• Santé - Acides aminés, Site, Liaison

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Le site de liaison est une poche définie par un ensemble d'acides aminés. suivant la nature de ces acides aminés (aa), seuls certains substrats seront capables de ce placer dans cette poche. Imaginons que ton site de liaison soit petit et possède des aa chargés négativement.  [...] Faut savoir que certains acides aminés à ph neutre sont chargés + d'autres -. La fixation d'un substrat donné dépend des acides aminés du site de liaison et de leur organisation dans l'espace(distance entre eux etc). Une fois fixé, la transformation du substrat va dépendre là aussi de l'organisation et de la nature des acides aminés du site catalytique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Acide aminé

La Trypsine et la Chymotripsine sont deux enzymes elles hydrolysent les liaisons peptidiques à l'interieur de la chaîne polypeptidique, la Trypsine coupe les liaisons au niveau du carboxyle ( C=O) de 2 acides aminés la lysine et l'argenine jusque là il n'y a pas de probleme.  [...] la région particulière de l'enzyme dans laquelle s'imbrique la molécule de substrat est appelé site actif ( jusque là je ne vous apprends rien ). On distingue dans ce site actif 2 régions.les acides aminés de liaison qui se lient par des liaisin non covalente avec le substrat, et les acides aminés catalytiques qui sont responsable de la réaction.  [...]

[Génétique] Transformation du brin codant en séquence d'acides aminés.

Bref tu vois bien que les deux premiers acides aminés sont identiques à l'ocytocine mais comme après la mutation par délétion a effacé 4 nucléotides cela a changé le cadre de lecture du ribosome, donc les autres acides aminés sont différents et il n'y a plus de codon stop, au moins pour la partie de la séquence qu'on te donne, la protéine pourra être plus longue et différente, un codon stop sera rencontré plus loin.  [...] Ensuite l'ARNt participe au phénomène de traduction mais ce n'est pas le seul, ce sont surtout les ribosomes. L'ARNt vient se fixer au site P du ribosome et reconnaît le premier codon AUG d'initiation de la traduction via son anticodon 3' UAC 5'. Un deuxième ARNt, via son anticodon reconnaît le deuxième codon adjacent à l'AUG et apporte son acide aminé greffé sur l'extrémité 3' de l'ARNt, la liaison peptidique se fait entre les deux acides aminés, il y a translocation et le premier ARNt va dans le site E pour partir, le deuxième devient le premier et passe dans le site P, etc de proche en proche jusqu'au codon stop.  [...]

Le ribosome humain révèle sa structure précise en 3D

L'équipe de Bruno Klaholz, à l'IGBMC (CNRS, université de Strasbourg, Inserm) vient de visualiser la structure atomique du ribosome humain complet avec une résolution supérieure à trois angströms (0,3 nanomètre ). Le modèle obtenu représente les 220.000 atomes qui constituent les deux sous-unités du ribosome et permet, pour la première fois, d'explorer son agencement en détail, de voir et d'identifier les différents acides aminés et nucléotides en trois dimensions.  [...] Les chercheurs se sont plus particulièrement intéressés aux différents sites de liaison et aux interactions fines qui y ont lieu. Leurs travaux révèlent par exemple qu'après avoir livré les acides aminés qu'ils transportaient, les ARN de transfert continuent à interagir avec le ribosome dans un site particulier (le site de sortie des ARNt, les acides ribonucléiques de transfert).  [...]

[Biologie Moléculaire] Biotine - Avidine

Essaie de trouver la structure tertiaire (elle est organisée en feuillets ß anti-parallèles) de l'avidine avec le site de liaison à la biotine. À mon avis, il doit y avoir une certaine conformation des acides aminés impliqués dans le site de liaison (qui est, en l'occurrence, une boucle) formant une cavité qui doit être très profonde, rendant l'affinité aussi grande.  [...] J'ai jeté un coup d'oeil à la structure de la biotine. tu peux déjà imaginer 4 liaisons hydrogènes avec 4 acides aminés. Je te justifie ça. une boucle constitue le domaine de liaison, et elle est composée d'au moins 4 acides aminés. Donc, si tu parviens à trouver la structure tertiaire de l'avidine, connaissant la structure tri-dimensionnelle de la biotine, y a peut-être possibilité de trouver avec quels acides aminés il y a des liaisons hydrogènes.  [...]

l'adn

-Le ribosome se fixe au niveau du codon initiation et traduit le triplet de nucletotide. Il correspond à la méthionyne (Acide aminé AUG sur code génétique).  [...] -Elongation du polypeptile (chaine d'acides aminés )Le ribosome avance et après chaque lecture de codon les acides aminés se lient (liaison peptylique) avec les Acides aminés précédents.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les biomolécules Première st2s

les protéines, peptides et holoproteines sont constitués d'acides aminés liés les uns aux autres la liaison entre deux de ces acides aminés est une liaison peptidique.  [...] pour les protéines et peptides, tu représentes les acides aminés sous forme de ronds qui sont reliés par des traits représentant les liaisons peptidique. Par contre, je suis étonnée qu'on te demande de schématiser ou de connaître les liaisons dans une hétéroprotéine (une hétéroprotéine est une protéine qui est liée à de petites chaînes glucidiques par exemple).  [...]

Cyclooxygenases et inflammation | Dossier

, un domaine de liaison à la membrane composé de quatre hélices &alpha. dans lequel viendra se loger l'acide arachidonique ou les Anti-Inflammatoires Non Stéroïdiens (AINS) et d'un domaine catalytique bifonctionnel. Le site actif est composé d' acides aminés essentiels en raison de leurs groupements fonctionnels ou par leurs positions spatiales.  [...] La COX-2 a de fortes homologies avec la COX-1. 60% des acides aminés, au nombre de 604 (Hla T. et Neilson K., 1992), sont identiques d'où une masse moléculaire également de 71 kDa, de plus certaines régions protéiques sont conservées, en particulier les sites catalytiques ( cyclooxygénase et peroxydase) et le site de reconnaissance contenant le noyau héminique (Xie W.  [...]

Chaîne de Biosynthèse... Je ne comprends pas!

Elles sont donc constituées par une succession d'acides aminés (il en existe 20 différents) unis par une liaison peptidique.  [...] Pour la synthèse des protéines et notamment la liaison peptidique (entre 2 acides aminés), l'association de 2 acides aminés qui se fait entre la fonction amine d'un acide aminé et la fonction carboxylique d'un autre acide aminé libère bien une molécule d'eau.  [...]

[Génétique] Quelques questions en génétique ( maturation et traduction de l'ADN)

3) Mise en place du spliceosme ( arrivée de U2 sur le site de branchement). Pourquoi l'Adénine du site de branchement est elle décalée par rapport au autres bases de la séquence de l'intron.  [...] Pour que la liaison peptidique puisse se faire entre 2 acide aminés ( site P et site A), il y a r otation de l'ARn t situé au niveau du site A.  [...]