• Santé - Acides aminés, Protéine, Charge

[Biologie Moléculaire] Page sds

4g de SDS pour 1g de protéine), la charge globale d'une protéine dépends alors uniquement de sa longueur en acides aminés, et du coups, de son poids moléculaire.  [...] La différence en poids moléculaire (et donc longueur et/ou complexité) entre protéines est énorme. Mais la dénaturation est là pour simplifier leur structure (il n'est censé resté que la structure primaire), et le SDS va camoufler les acides aminés de la protéine et en profiter pour uniformiser la charge.  [...]

[Biochimie] Extraction enzymes

acides, protéases,... Enfin, le tampon permet de rester dans des conditions isotoniques qui contribuent au maintien de la forme native de ta protéine.  [...] Oui en se plaçant à un pH proche du pHi, on favorise la stabilité de la forme native de la protéine. En effet, la structure protéique est conditionnée par le pH qui va définir la charge des acides aminés déterminante pour la conformation finale de la protéine.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Je cherche à déterminer si ma protéine est hydrophile ou hydrophobe à partir de sa séquence en acides aminés et de sa charge globale.  [...] Exemple. Dans le collagène, on compte beaucoup d'acides aminés apolaires (dont un tiers de résidus de glycine et un quart de proline) qui forment les hélices alpha. Pourtant c'est une protéine commune du liquide interstitiel - principalement constitué par H 2 O.  [...]

Composition d'un peptide

j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.  [...] pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe. C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de.  [...]

Besoin d'un peu d'aide : enzymes et acides aminés

Bonjour, il suffit de connaitre la structure primaire de la protéine, seuls certains acides aminés sont susceptibles de modifier la charge de la protéine. Il suffit de regarder selon leur pI quelle charge ils auront au pH considéré. Si le pI est proche du pH, il convient souvent de calculer plus précisément la proportion d'acide aminés qui seront protonnés ou non à ce pH.  [...] Forcément si les charges des acides aminés sont impliquées dans la forme de la protéine, si on fait varier le pH, on fait également varier les charges des acides aminés et donc on peut modifier la forme de la protéine. Souvent dans le cas des enzymes, le repliement fait apparaitre une poche (appelé site actif ).  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

C'est ici qu'il faut résonner pour répondre à ta question. car suivant les radicaux R portés par les acides aminés qui forme le polypeptide, la solubilité de ta protéine va changer. En effet, tu pourrais avoir des radicaux hydrophiles, hydrophobes, acides, basique ou neutres ou de tout type en même temps.  [...] -. a pH neutre, les acides aminés verront leurs groupements amines chargés positivement ( NH3+ car ils ont capté un H+ ) ET leurs groupements carboxylique chargés négativement ( COO- car perte d'un H+ ) Ainsi la charge moins + la charge plus fait bien 0 et ta protéine est neutre tout comme la solution.  [...]

[Biochimie] La charge des protéines à pH=7

En fait la charge de la protéine vient de son pka, que tu peut trouver dans une table des matières des protéines. En fonction du pka de la chaine latérale et du pH, tu pourras déterminer si a un ph donné, la chaine latérale sera protonée ou déprotonné.  [...] Certains acides aminés possèdent un deuxième groupement amine ou carboxyle, qui n'est donc pas pris dans la liaison peptidique.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

Heu non tu peux pas dire ça parce qu'il peut y avoir d'autres acides aminés chargés dans ta protéine (histidines, arginines, glutamates, aspartates). Disons plutôt qu'elle va moins migrer vers la cathode que ta protéine P normale.  [...] J'ai un peu de mal moi aussi avec l'idée que les phosphates dépassent suffisamment des chaines latérales des acides aminés pour avoir plus d'influence sur la migration de la protéine que les chaines latérales elles-même. Mais bon, je ne vois pas d'autres explications non plus.  [...]

[Biochimie] origine de la vie

Création spontanée de protéine (peptide) par assemblage d'acides aminés par condensation (perte d'une molécule d'eau) sous l'action de la chaleur (zone hydrotermales).  [...] On sait que des acides aminés peuvent s'associer pour donner des peptides et donc des protéines de manière à priori assez simple, sans enzime. Supposons que les bases azotés soient capables de mémoriser l'assemblage des acides aminés en peptides via la codification (codons).  [...]

Polypeptide végétal

pas vraiment, en fait on parle de protéine lorsqu'on parle d'une chaine d'environ 100 acides aminés, en dessous ce sont des peptides tout simplement.  [...] Une protéine, qu'elle soit animale ou végétale, est toujours un polypeptide. Les acides amines ou les modifications post-traductionnelles peuvent être différentes, mais l'organisation est similaire.  [...]