• Santé - Acides aminés, Migration, Protéine

[Biochimie] migration des AA proline glutamine

Je me demande si quelqu'un connait l'influence des acides aminés proline et glutamine sur la migration de protéine en condition dénaturante.  [...] En effet j'ai fais migré une protéine composée de ces deux acides aminés, et au lieu d'arriver à la taille attendue de 30kDa, elle arrive à 40kDa. Je sais qu'avec les western c'est rare de trouver la taille attendue, sans parler des modifications post-traductionnelles possibles.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

La protéine est linéaire à cause du SDS, peu importe la composition en acides aminés. Mais le phosphate fait office de chaine latérale sur la protéine si tu me permets l'expression.  [...] J'ai un peu de mal moi aussi avec l'idée que les phosphates dépassent suffisamment des chaines latérales des acides aminés pour avoir plus d'influence sur la migration de la protéine que les chaines latérales elles-même. Mais bon, je ne vois pas d'autres explications non plus.  [...]

Protéine avec bcp de résidus acides migre de façon aberrante en western blot

J'ai vraiment l'impression, via les différents papiers sur Nrf2 ou sur d'autres protéines, que la raison de cette migration aberrante est la forte proportion d'acides aminés acides dans la séquence. Mais je ne comprends pas pourquoi ces aa acides engendreraient une migration plus lente.  [...] Il serait bon pour toi de revoir tes cours de biochimie. Où as-tu vu qu'une sérine pouvait adopter une conformation particulière Dans une protéine, une séquence peut adopter une conformation mais pas un acide aminé seul. D'autre part, seule la phosphorylation de la sérine pourrait diminuer la migration de la protéine car un groupement phosphate est encombrant.  [...]

[Biochimie] Analyse recurrente d'edman

j'aurai besoin d'un petit complément d'information par rapport au cour de ce matin en biochimie. lorsque l'on parle du séquensage d'une chaîne d' acide aminé grasse a la dégradation récurrente d'edman. car  [...] d'ITCP on doit le mettre en solution et donc théoriquement des que le complexe ITCP-AA se détache un autre va prendre sa place spontanément et on va se retrouver avec une solution de complexe ITCP-AA isolée mais avec impossibilité de savoir dans quel ordre il s'agence. si quelqu'un peut m'éclairer merci beaucoup.  [...] On avait fait agir notre réactif, puis au bout d'un temps donné, on a arrêté la réaction puis effectué une chromatographie avec comme témoins les acides aminés, puis on a comparé leurs profils de migration avec le profil de migration de notre échantillon. Si tu arrêtes la réaction à temps assez court, tu ne verras qu'un seul point qui correspondra au premier acide aminé, si tu laisses un peu trop longtemps, tu verras un deuxième point qui sera ton deuxième acide aminé (trace plus faible sûrement car le réactif n'aura peut être pas eu le temps de réagir avec celui ci sur tous tes peptides alors que les premiers acides aminés sur tous tes peptides auront pu réagir avec le réactif).  [...]

[Biochimie] qcm sur les acides aminés et peptides non comprises

Q3)On realise une electrophorese à pH=6 d'un mélange de 3 acides amines.Quelle sera le resultat de la migration.  [...] Q6) une solution contenant les 3 acides amines suivants.ala,arg,asp doit être soumis à une chromatographie d'échange de cathions.  [...]

pH d'une solution protéique et Western-blot

Si je fais migrer cette solution acide dans mon gel de Western-blot, est ce que cela aura un impact sur la migration Le pH change la conformation des protéines mais est ce que cette dénaturation () aura un impact sur la migration/transfert et/ou révélation.  [...] Pas étonnant, si c'est un Laemmli (conditions dénaturantes) c'est le SDS qui forme des patchs sur la protéine et la fait migrer. Et si le pH est trop acide, la charge peut ne pas être suffisamment négative pour obtenir une bonne migration.  [...]

Recepteur à l'insuline en SDS PAGE

Ce n'est pas le tampon de migration qui contient du beta-mercapto, c'est le tempon dans lequel est repris les protéines laemli. Cette etape, denature totalement la proteine (pont S-S compris). Ensuite la presence de SDS permet de faire migrer les protéine uniquement en fonction de leur poid moleculaire apparent.  [...] Et donc, selon la distance de migration pour un type de gel donné sera associé à un rayon de Stock théorique...proportionnel à la taille de la protéine complexée par les molécules de SDS, et donc, proportionnel au poids moléculaire.  [...]

[Biochimie] Chromatographie de partage

D'après ce que j'ai compris la chromatographie de partage est une technique de séparation des composant selon leur hydrophilicités ou leurs hydrophobicités. On a deux phase une stationnaire (fixe) et l'autre mobile. Mais quelle phase est hydrophile et la quelle et hydrophobe et lorsque en utilise un milieu acide qu'est ce que sa change Car au cours de ma révision j'ai rencontrer un exercice dans lequel ils me demande de classer des acides aminé (Val, Tyr, Lys et l'Asp) soumis a une chromatographie de partage dans un milieu acide.  [...] Ma répons était Asp. Lys. Tyr. Val si la phase fixe était hydrophobe, en se basant sur un tableau de dans lequel les acides aminé était classer selon leur hydrophobicités. Mais est ce que le milieu acide utiliser vas influencer la migration de ces élément.  [...]

Petit secret des migrations cellulaires au sein de notre corps

Comment une cellule se déplace-t-elle La question intéresse les scientifiques, qui y voient un moyen de mieux comprendre le fonctionnement du corps humain et de trouver un rempart contre la dissémination des cellules cancéreuses. Jusqu'ici, les recherches avaient mis en évidence le rôle crucial de l' actine (une protéine) dans cette migration.  [...] Les résultats sont basés sur des travaux précédents, réalisés par le même laboratoire. Les chercheurs avaient montré que la protéine Exo70 intervenait dans la stimulation des filaments d'actine lors de la fabrication des vésicules d'exocytose. Cette fois, les scientifiques se sont intéressés au rôle de cette protéine lors de la migration cellulaire.  [...]

QCM - Immunoprécipitation

A-Après migration en gel non dénaturant, on identifie la protéine B dans les complexes retenus par l'anticorps anti-protéine A au poids moléculaire de 2kDa.  [...] D-Après migration en SDS-PAGE et transfert sur nitrocellulose, on identifie la protéine C dans les complexes retenus par l'anticorps anti-protéine A.  [...]