• Santé - Acides aminés, Enzyme, Coupe, Liaison

[Biochimie] site de coupure de l'alcalase

voila, j'ai une petite question. savez vous quel est ou quels sont les sites de coupure de l'alcalase au niveau de la protéine, autrement dit après quels acides aminés cette enzyme coupe la liaison peptidique.  [...]

[Biologie Moléculaire] petite question : trypsine

La trypsine est une enzyme protéolytique qui clive derrière les acides aminés basiques. lysine et arginine. En très simple, elle coupe les protéines.  [...] Les protéines (dont font partie les enzymes) sont constituées d'une suite d'acides aminés formant une chaîne, les acides aminés sont en quelque sorte les briques des protéines. Ensuite cette chaîne se plie pour adopter une conformation en 3 dimensions spécifique et aquiert ainsi son activité, en l'occurence couper d'autres protéines à un endroit précis.  [...]

digestion trypsique

quel est le role d'une digestion trypsique sur une protéine et quelle sont les liaisons coupées.  [...] slt la trypsine est une protease gastrique importante elle coupe les liaisons peptidiques apres les acides amines basiques lysine et arginine, in vitro elle tres utilisée pour couper les liaison peptidiques covalentes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Acide aminé

La Trypsine et la Chymotripsine sont deux enzymes elles hydrolysent les liaisons peptidiques à l'interieur de la chaîne polypeptidique, la Trypsine coupe les liaisons au niveau du carboxyle ( C=O) de 2 acides aminés la lysine et l'argenine jusque là il n'y a pas de probleme.  [...] la région particulière de l'enzyme dans laquelle s'imbrique la molécule de substrat est appelé site actif ( jusque là je ne vous apprends rien ). On distingue dans ce site actif 2 régions.les acides aminés de liaison qui se lient par des liaisin non covalente avec le substrat, et les acides aminés catalytiques qui sont responsable de la réaction.  [...]

[Biologie Cellulaire] Internalisation et trypsine

je sais que la trypsine est un enzyme protéolytique qui clive derrière les acides aminés basiques donc elle coupe les protéines. or on a besoin pour l'endocytose (phagocytose) de récepteurs sur le macrophage pour attraper les molécules à internaliser.  [...] savez vous pourquoi il ya internalisation de fluorescence en présence de trypsine si la trypsine coupe tous les recepteurs, on devrait plus avoir d'endocytose, a moins que quelques recepteurs ne soient pas touchés.  [...]

[Biochimie] Biosynthèse

la pré-pro-insuline qui a une durée de vie courte. L'ARNm traduit et exporté dans le cytoplasme transfère aux ribosomes situés à la surface des citernes formant le réseau complexe du réticulum, les informations nécessaires pour assembler les acides aminés constituant la ré-pro-insuline.  [...] Le segment pré coupé par des enzymes, synthétisés par d'autres ribosomes, est responsable de la migration de la chaîne protéique en cours d'assemblage vers l'intérieur des cavités du réticulum endoplasmique rugueux. La molécule de pré-pro-insuline est alors transformée en pro-insuline (86 acides aminés, poids moléculaire H 9000) contenant les chaînes d'acides aminés qui donneront l'insuline (51 acides aminés, poids moléculaire H 6000), plus un segment, le peptide de connexion ou peptide-c (31 acides aminés, poids moléculaire H 3000) reliant la fin de la chaîne A au début de la chaîne B.  [...]

enzymes de restriction

1) exemple avec l'enzyme BamHI qui coupe dans la séquence 5'-G*GATCC-3'. L'enzyme va couper la liaison covalente phosphodiester entre les 2 G de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' exposé et un groupe hydroxyle 3' en retrait. On parle alors d'une extrémité collante 5' (5' cohesive ends, ou 5' overhang ou surplomb 5').  [...] 2) exemple avec l'enzyme Sac I qui coupe dans la séquence 5'-GAGCT*C-3'. L'enzyme va couper la liaison phosphodiester entre le T et le C de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' en retrait et un groupe hydroxyle 3' exposé. On parle alors d'une extrémité collante 3' (3' cohesive ends, ou 3' overhang ou surplomb 3').  [...]

[Biochimie] Activité enzymatique et pallier de quantité de produit formé ?

Pour moins, s'il y a un pallier pour la quantité de produit formé, c'est qu'il y a de moins en moins de liaisons peptidiques à rompre (action de l'enzyme d'hydrolyse des protéines).  [...] La trypsine hydrolyse les liaisons peptidiques dans lesquelles un acide aminé basique engage sa fonction acide. Elle coupe en C-terminal de ces acides aminés. Elle transforme les chaînes polypeptides en chaînes protéiques plus courtes pour permettre la digestion.  [...]

[Biochimie] Comment couper "proprement" un peptide

connaissez vous un moyen d'isoler mes peptides Existe t-il une enzyme capable de couper la liaison peptidique, quelque soit l'acide amminé.  [...] je dis peut être une betise mais il y a toujours la possibilité de faire une dégradation d'edman (si le peptide n'est pas trop grand, sinon ça peut être long). Cette dégradation coupe acides aminés apres acides aminés à partir de l'extrémité N-terminale.  [...]

[Biochimie] Pepsine=papaine ?

La papaïne est une cystéine - protéase, la pepsine coupe elle après les acides aminés aromatiques.  [...] L'hydrolyse d'un anticorps par la pepsine conduit à la formation d'un fragment F(ab')2 et de plusieurs peptides issus du fragment Fc.   [...]