• Santé - Acide, Séquences, Protéine

[Biologie Moléculaire] Comment ce fait-il qu'on ait des séquences codantes et non codantes ?

Je comprends pas un truc. L'ADN est un polymère d'acide nucléique comment ce fait-il qu'ont est des séquences codants pour des protéine (exons) et d'autres séquences non codantes (introns) qu'on a longtemps qualifié d'ADN poubelle avant de trouvé qu'ils avaient une action régulatrice sur les gènes.  [...] Mais la chose qui m'interpèle vraiment c'est comment ce fait il qu'il y est une différence alors que c'est simplement un enchainement de nucléotide comment ce fait-il que certain nucléotides code et que d'autres non c'est lié au modification post-traductionelle c'est à dire méthylation etc.   [...]

[Biologie Cellulaire] Dalton -> taille ARNm

Le poids moyen d'un acide aminé est de l'ordre de 130 -135 Da. A partir de là on peut calculer le nombre d'acides aminés dans la protéine. Cependant, à l'usage, cette méthode n'est pas la bonne parce que la répartition des acides aminés dans les protéines n'est pas aléatoire et les acides aminés légers sont plus fréquents que les lourds.  [...] ca te permet de determiner le nombre d'acide aminé de ta protéine. Ensuite il faut combien de nucléotide pour incorporer un acide aminé ca te permet de connaitre la taille de la sequence codante, qui est la taille minimale de l'ARNm puisqu'il manque toutes les sequences non codantes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Structure des protéines

Mais si, elle est présente dans 2 espèces totalement différentes, bien que l'on l'a nomme de la même façon, qu'elle assure le même role biochimique dans chacune des espèces et qu'elle agit de la même façon dans chacune des espèces. il y aura 2 séquences codantes au total pour la même protéine.  [...] Pour produire une protéine de plante en bactérie, j'ai du faire modifier et optimiser la séquence pour que les codons correspodent.  [...]

[Biochimie] origine de la vie

Le problème si l'ARN arrive en premier, c'est de savoir comment a pu être codé les séquences d'acides aminés au travers des codons ce qui supposerais que l'ARN soit capable d'analyser les constituants d'une protéine, de la décomposer en acide aminés ce dont je doute.  [...] Soit l'assemblage au hasard des base azoté aurait fournie encore une fois pile la séquence codant ces protéines formés spontanément.  [...]

Le diagnostic de la grippe aviaire | Dossier

2001 25 ) (Ellis and Zambon 2001 33 ). Les résultats sont disponibles en quelques heures. Elle utilise la transcription inverse de l' acide ribonucléique (ARN) viral en ADN complémentaire ( ADNc ). Elle requiert une paire d'amorces oligonucléotidiques. les amorces sont basées sur les séquences connues de la protéine HA et N1 des virus influenza A et permettent d'amplifier spécifiquement un sous-type.  [...] ou des séquences des gènes M, H5 et N1 en seul passage (single set). les amorces sont sélectionnées à partir de 75 séquences conservées répertoriées du gène de la protéine M et de 50 régions invariables connues, spécifiques des gènes H5 et N1(Amonsin, Payungporn et al. 2005 6 ).  [...]

Mutations silencieuses

Des séquences exoniques ou introniques de 5 à 10 nucléotides, appelées séquences régulatrices de l'épissage, jouent un rôle important dans la reconnaissance des sites d'épissage par le spliceosome. Ces séquences, qui peuvent être proches ou éloignées des sites d'épissage qu'elles contrôlent, sont reconnues par des protéines appelées facteurs d'épissage qui aident au recrutement local du spliceosome ou au contraire empêchent ce recrutement (rôle enhancer ou silencer ).  [...] Donc pour résumé. une mutation est dite silencieuse si elle ne change pas l'acide aminée correspondant mais elle peut, en affectant certaines séquences dites régulatrices, avoir des conséquences encore plus dramatique sur la protéine.  [...]

Mutagénèse dirigée

J'ai la séquence d'un gène codant pour une protéine sauvage et j'ai la séquence du gène codant pour la protéine mutée pour une espèce A. On sait donc qu'aux alentours de la position 200 on a un changement d'un acide aminé entre la forme sauvage et mutée.  [...] Dans un premier temps j'envisage d'aligner les séquences protéiques des 2 protéines sauvages et identifier l'acide aminé qu'il faudra modifier.  [...]

Affinité des virus influenza A vis-à-vis de l'hôte | Dossier

Les mutations au niveau du gène de la neuraminidase participent à l'adaptation des virus grippaux à de nouveaux hôtes et en conséquence au franchissement de la barrière d'espèces. L'adaptation à un nouvel hôte nécessite néanmoins une compatibilité entre la NA et l'HA, dans la mesure où ces protéines ont des fonctions complémentaires.  [...] Les protéines M. L'analyse des séquences d'acides aminés montre dix régions contenant des acides aminés spécifiques des souches aviaires ou humaines, le nombre de sites différents est plus important pour la protéine M2 (sept sites) que pour la protéine M1 (trois sites).  [...]

Le traitement de la grippe aviaire et des virus influenza | Dossier

Dans le cas du virus influenza A (H5N1), l'analyse des séquences aminoacides de la protéine M2 montre que tous les isolats viraux de génotype Z, circulant en 2003 et en 2004 en Thaïlande et au Vietnam montre une mutation correspondant à l'acide aminé en position 31 (substitution de la sérine par l' asparagine ).  [...] Il suffit d'introduire dans les cellules des petits ARN double brin (ARN interférents) qui ont la même séquence que l'ARN messager du gène à inhiber. on dit qu'ils interfèrent avec l'ARN. L'utilisation d'ARN interférents, spécifiques de régions conservées des gènes de virus influenza A, en particulier, les nucléotides 1496 à 1516 de la nucléoprotéine NP, les nucléotides 2097-2107 de l'ARN transcriptases PA et les nucléotides 2257-2277 de la polymérase PB1 a démontré une activité inhibitrice de la réplication virale in vitro (Bennink and Palmore 2004 12 ).  [...]

[Biologie Moléculaire] Phase de lecture

Bonjour à tous. Il y a un petit truc que je ne comprends pas trop... une délection de 3 pb dans un exon change t'elle la phase de lecture et d'un intron je ne comprends pas bien cette histoire de phase de lecture, quelqu'un peu t'il m'éclairer Merciii beaucoup.   [...] non, ca ne change pas la phase de lecture. Ca va enlever un acide aminé à la séquence protéique, mais une délétion d'1 ou 2 paires de bases aurait tout décalé, du fait que la traduction fonctionne à base d'unités de 3 nucléotides (codons). Dans un intron, vu que ce sont les séquences à la limite exon-intron qui sont importantes pour l'excision et l'épissage, une délétion de quelques bases a de fortes chances de ne rien faire du tout (sauf cas de régulation par des séquences introniques).  [...]