• Forum - Utilisation, ADN, Classification

[Evolution] Statut espèce pour les plantes?

Et ne serait il pas possible en dehors de l'utilisation de l'ADN de faire un autre type de classification.  [...] On peut faire toutes les classifications que l'on veut, ca dépend du critère utilisé. Mais si on cherche à faire une classif évolutive, l'ADN (en association ou pas avec de la morphologie) reste actuellement le meilleur moyen( mais ca peut évoluer).  [...]

[Biologie Moléculaire] adn polymérases ?? classification

j'ai dans mon cours deux classification des adn polymérases. I, II et III.  [...] ainsi que alpha, beta, delta, epsilon et gamma, je me demande quel critéres on prend pour chaque classification et est ce que en fin en a 8 adn polymérases ou bien les I, II et III sont des hologues a 3 parmi alpha, beta, delta, epsilon et gamma.  [...]

[Biologie Moléculaire] Adn...

- Au sujet de l' hydridation d'ADN de différentes espèces. l'ADN est naturellement sous forme double brin et peur être dénaturé en simples brins par la chaleur. Si deux brins complémentaires dénaturés sont mis à refroidir ensemble dans des conditions de vitesse et de salinité définies, ils vont se réapparier.  [...] Les hybridations ADN-ADN étaient une technique qui faisaient fureur dans les années 70-80 pour distinguer les espèces bactériennes. On prenait l'ADN de 2 bactéries et on essayait d'apparier les brins ensemble pour voir si elles étaient de la même espèce ou non, et si l'hybridation était imparfaite on étudiat les différences selon leur % d'hybridation.  [...]

le virus

(après séquençage) De nombreux gènes ont été trouvés pour la première fois dans un virus. C'est notamment le cas de trente gènes que l'on avait jusque là identifiés que dans les organismes cellulaires. Par exemple, certains gènes codent des protéines de réparation de l'ADN, d'aide au repliement des protéines et des enzymes du métabolisme jamais mises en évidence chez les virus.  [...] c faux il peut y avoir ADN et ARN, ainsi les virus de classe VII (selon la classification de baltimore) sont des virus a ADN mais passent par un intermediaire ARN lors de leurs replication et de la meme facon les virus de classe VI alias les retrovirus sont des virus a ARN qui passent par un intermediaire ADN.  [...]

[Génétique] Bioinformatique: biais/variance

Je dois étudier une séquence ADN (faire de la classification) et en particulier calculer le biaise/variance de chaque classifieur. Je ne comprends pas comment faire cela. En effet, je classifie mes données dans la classe 0 ou 1 mais qu'est que c'est que le biais ou la variance il faut supposer une distribution de probabilité derrière comment calculer cela sous matlab Par exemple j'ai construit avec Matlab un arbre de classification qui me donne (avec quelques erreurs bien sûr) la classe de mon groupe de test.  [...] Comment calculer la variance et le biais sur cet exemple merci beaucoup à la personne qui me répondra.   [...]

Rep-pcr

Même principe que la PCR ordinaire... Ce n'est qu'une PCR en fait... L'originale dans cette méthode c'est l'utilisation d'amorces consensuelles, homologues de séquences répétées, Ce sont les éléments REP (pour Repetitive Extragenic Palyndromic element). Dans un génome bactérien, ces éléments représentent environ 0.  [...] 5 à 1 %. Un ensemble de ces séquences palindromiques alignés constitue une séquence consensus REP. Le fait que ces éléments sont conservés au sein d'une même espèce (malgré l'existence de variation infra-spécifiques), place cette PCR parmi les meilleures méthodes utilisées pour la classification bactérienne (couplage avec une électrophorèse et utilisation de logiciel pour traiter les résultas tel que bionumerics...) ….  [...]

[systematique][evolution] Races

On essaye d'être honnête un minimum...c'est quoi ces arguments totalement farfelus...en aucun cas la taxonomy/biologie utilise des critères de couleur des yeux ou des poils comme protocol de classification des sous-groupes de mamifères...en tous cas pas comme critère unique.  [...] Encore plus fort, vous prenez l'ADN d'un Pygmée et d'un Norvégien est revenez me dire qu'ils peuvent être classés dans un même sous-groupe en utilisant les protocols taxonomique de classification des espèces et sous-espèces du monde animal.  [...]

[Evolution] Evo-Devo Quelques difficultés...

Ou alors je peux changer mon début et montrer ce que la génomique a permis de comprendre en evo devo, donc contraction des genomes, expansion des genomes, perte/gain de gene etc etc suivit de l'apport de l'utilisation des fossiles dans l'evo devo.  [...] Bon en fait voila ce que je pense faire, dans la review de Canestro, il explique comment est utilisé la génomique et comment on s'en est servi pour revoir la classification animale, et ensuite il explique l'expension ou la contraction des genomes et leur impactes sur le developpement, donc je pense suivre son approche, la seconde reviews sur les fossiles (arghhhh) expliquent leur utilisation en evo-devo donc la encore je vais prendre les grandes idées de ce papier.  [...]

Idées de classement pour une flore

En fait, ton système de classification doit dépendre du public auquel est destinée la flore, et du type d'utilisation auquel tu la destines. S'il s'agit d'aider le lecteur à reconnaitre les végétaux rencontrés au cours de balades, une classification par milieu me semble adéquate.  [...] Les regrouper par familles est déjà plus interressant, sachant que l'ordre des familles est ensuite établit selon la classification phylogénétique la plus récente.  [...]

[Microbiologie] phages à ADN et ARN

La classification de Baltimore (lien wikipedia) pour les virus ne parle que des virus des Eucaryotes. Les phages s'attaquent que aux bactéries et donc c'est différent.  [...] Les bactériophages ou phages sont effectivement principalement des virus à ADN double brin mais ils sont comptés aussi dans la classification des virus en fonction de leur matériel génétique. Mnt, les bactériophages ne sont pas différents des virus eucaryotes (même principe, même fonctionnement).  [...]