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homologie protéome entre les organismes

Je trouves sur internet un peu de data concernant l'homologie entre l'ADN génomique des espèces (nombre total de nucléotides), mais quelqu'un connaîtrait-il une banque qui donnerait directement les % d'homologie au niveau du transcriptôme et au niveau du protéome entre les organismes Par exemple une banque construite par des analyses de l'ADN génomique et des algorithmes de prévision de protéine ou d'ARNm.  [...] .. Et à l'inverse, les homologies inter-especes considérants seulement l'ADN non codant... Et des radios ''homologie codante/homologie non condante''... Il y auraitenviron 20 000 gènes traduits dans H. Sapiens, et au total de l'ordre d'environ 5 millions de séquences peptidiques non redondantes sur Terre selon la méthode ''Towards completion of the Earth's proteome Carolina Perez-Iratxeta1, Gareth Palidwor1 & Miguel A Andrade-Navarro1,2,3'' http.  [...]

[Microbiologie] évaluer la diversité

La composition de l'échantillon a été analysée par culture (des dilutions étalées sur un milieu solide et cultivée en anaérobie, 96 isolat identifies par séquençage du 16S) et par la méthode moléculaire (PCR 16S sur l'ADN total, clonage, séquençage de l'insert pour 96 clones).  [...] J'ai identifié 21 espèces au total, certaines par les deux techniques, d'autres seulement par culture ou par la méthode moléculaire. Le nombre d'isolats ou de clones pour une espèce varie de 19 à 1 (moyenne=9.4).  [...]

[Biologie Moléculaire] Analyse de séquences, phylogénétique

Pour réduire au max, j'ai traduit en séquences protéiques et regroupé celles qui sont similaires à +97% (tout ça sous Excel). Je me suis retrouvé avec 7 grands groupes de séquences (dans chaque groupe j'ai des représentants des 4 banques de clones) et 62 séquences individuelles (total 69).  [...] J'ai analysé ces 69 séquences sous Phylip en utilisant Neighbor et Parsimony et les arbres se ressemblent (ouf.) Mais le fait d'avoir des groupes avec des séquences des 4 banques me gène un peu. On m'a conseillé de procéder ainsi pour voir l'apparition/disparition d'espèces entre les 4 états étudiées.  [...]

Homéopathie uniciste - Page 6

Par exemple, la méthode double aveugle fonctionne parfaitement si le médecin ignore si le traitement homéopathique à sa disposition est un placébo ou non. Il soignera son patient de la manière appropriée et prescrite par le protocole homéopathique. Par conséquent, les résultats seront parfaitement fiables.  [...] je dirais que la chirurgie n'est pas une méthode thérapeutique mais une technique. Une technique qui vient en dernier recours. Qui s'est construite sur des années, des siècles d'expérimentations sur sujets morts, vivants, mammifères supérieurs ou inférieurs, et qu'une transplantation cardiaque, une première réussie (en France, faut-il le rappeler) s'est faite grâce à la collaboration médicale de bien des médecins, l'acte chirurgical en lui-même étant surtout de technique (c'est de la plomberie fine.  [...]

[Biochimie] activité de la béta-fructosidase

Bonjour, j'ai énormément de difficulté pour la rédaction et la compréhension de mon TP. Je sais que c'est un TP type mais je suis perdu j'ai des doute sur mes analyses de résultat.   [...] La méthode 2. C1V1=C2V2 puis on multiplie par le volume total=20ml.  [...]

Méthode et durée de conservation du sang total pour une étude génétique

Méthode et durée de conservation du sang total pour une étude génétique.  [...] - quelles sont les conditions et la température nécessaire pour conserver ces tubes pendant.   [...]

[Microbiologie] A la recherche des bactéries tueuses.

Une fois les échantillons relevés, quels sont les différentes étapes (cultures séquençage ) et analyses en laboratoire qui vont les menés à la découverte des bactéries tueuses.  [...] - identification des espèces présentes déjà connues à partir de l'ADNr 16S et indépendemment recherche d'une séquence pathogène par criblage de la banque (en culture eucaryote par exemple).  [...]

Problème d'extraction d'ADN

Je me permet de vous solliciter pour un problème d'extraction d'ADN que j'ai rencontrer. J'utilise la méthode d'extraction sur colonne de gel de silice à partir de prélèvement de sang total congelé. Le hic, c'est en voulant décongeler mes prélèvement trop vite, j'ai accidentellement coagulé le sang total.  [...] La coagulation étant due à l'albumine je suppose(70°C). Ma question est la suivante. Y'a-t-il un moyen de sauver mes prélèvements Y'at-til un traimtement que je peux leur faire subir pour pouvoir quand même en extraire de l'ADN ( le principal problème du sang coagulé c'est que ça bouche la colonne, ce qui rend la séparation du lysat par centrifugation impossible).   [...]

[Génétique] Construire un vecteur de transgenèse dérivé des transposons

D'après ce que je sais, les transposons reconnaissent différentes sequences selon leurs familles d'appartenance, cad, certains sont spécifiques de 4-6 nucléotides et d'autres s'inserent dans des 'hot-spot', séquences bcp moins homologues... Quois qu'il en soit, le transposon possède de très nombreux sites potentiel d'insertion dans un génome complet, c'est pourquois il est utilisé pour réaliser dans campagne de mutagénèse aléatoire.  [...] les transposons sont des sequences nucleotidiques presentes naturellement dans le genomes representes environ 50% de l'ADN total sont des elements mobiles.  [...]

[Biochimie] Est ce que NADPH absorbe à 405nm?

Je sais que NADH absorbe à 340nm, je voudrais savoir si il en est de même pour NADPH (ou peut être NAD+) à 405nm car sinon je ne vois pas se qui pourrait absorber.   [...] En fait, après l'ajout de ces solutions et des echantillons, nous avions ajouté un Substrat puis incubé 10min. L'Absorbance provient surement d'une réaction entre le Substrat et le GSH (présent dans les xtrait cellulaire et grâce à la transformation du GSSG en GSH par la glutathion Reductase).   [...]