• Forum - Témoin, Concentration, Quantité, Produit

[Biologie Moléculaire] pcr en temps réel / pcr classique

Une PCR classique c'est une méthode qualitative ou encore semi-quantitative. Pour l'observation des résultats tu coules un gel afin d'observer tes produits et tu les compares par rapport à un témoin. Avec ce témoin tu peux connaître la concentration ou la quantité de produit final formée.  [...] Dans ce cas là, on a une expérience qui est reproductible puisque tu suis la formation de ton produit au cours du temps. Par contre la lecture des résultats n'est pas possible directement il faut d'abord faire une courbe étalon.  [...]

[Biologie Moléculaire] optimisation dHPLC

J'utilise la dHPLC pour identifier des mutation sur les exon d'un gène. J'aurais aimé savoir sur quels facteurs il est possible d'intervenir pour diminuer les épaulements que j'obtiens lorsque je passe mon témoin (adn sans mutation) j'ai déja essayé de diminuer la concentration en MgCl2 lors de la PCR mais j'ai peur que si je la réduit encore je n'obtienne plus de produit PCR.  [...] Mon mapitre de stage m'a expliqué que purifier ses produits de PCR changeait pas grand chose, étant donné que l'ADN qui reste non spécifique est trop gros pour être purifié et les dntp, primers qui restent ne vont pas être détectés.  [...]

[Biologie Moléculaire] Preparation d'une gamme étalon ou standard pour PCRq

Car c'est surement une mauvaise lecture de ma part, mais en te lisant j'ai eu l'impression que tu voulais une gamme pour relier directement a une quantité en ng ou nmol initiale de ton gène, un peu comme en biochimie on prépare une gamme de BSA pour obtenir une concentration de protéines.  [...] Donc meme si tu as une séquence de ton gène en plasmide, que tu l'amplifie dans des bactéries, que tu l'extrait des bactéries, pose sur gel puis extrait du gel ta bande d'intéret, la purifie puis quantifie, tu auras la concentration que tu pourras diluer et te servir en qPCR, mais la meme quantité de transcrits, sur de l'environnemental ne donnera pas les mêmes résultats (ou alors il ne faut pas que tu utilise des primers dégénérés sur ton témoin car pour une meme quantité de primers tu n'auras pas le même taux de fixation, mais même dans ce cas, ton efficacité E ne sera pas la meme entre ton standard et ton echantillon).  [...]

[Biologie végétale] Le Gravitropisme

La circulation de l'auxine se fait de haut en bas dans le témoin (à forte concentration) mais on constate une circulation de sens opposée (à faible concentration), ce qui explique le fait qu'elle pousse verticalement vers le bas.  [...] On pourait alors dire que la courbure de la racine est due à la différente de quantité d'auxine reçue par les zones d'élongation dans le document 1 (c'est-à-dire le témoin). L'apex qui produit l'auxine, diffuse cette molécule vers la zone d'élongation. Or, en cas d'inégalité de répartition de l'auxine, on observe une croissance différentielle d'une face du coléoptile par rapport à l'autre.  [...]

[Divers] Conseils pour un dépôt de brevet

Le résultat. un rajeunissement visible de l'organisme, pas plus de cancers que dans le groupe témoin. Pourquoi une molécule très impliquée dans les cancers n'a pas augmenté son incidence sur les souris Peut être parce que celle ci était bien réparatie dans le corps des souris, qu'elle était naturellement produite par les cellules ou tout simplement qu'elle n'était pas présente en plus grande quantité que dans le corps des souris normales (au vu de la mise en place de l'expérience, je ne voit pas comment il pourrait y en avoir plus), mais en tout cas, une grande quantité d'une molécule potentiellement cancérigène était présente d'un seul coup, et il n'y a pas eu plus de tumeurs.  [...] Ah ça c'est sûr, le vieillissement est un domaine très particulier... Le pire, c'est que beaucoup de moyens permettent de le ralentir assez efficacement. Par exemple, la déméthylase semble pouvoir le faire, mais le seul moyen connu de faire rajeunir un organisme, à ma connaissance, est de lui injecter ou lui faire produire de grandes quantités de télomérase.  [...]

[Biochimie] dosage du glucose danns le coca

donnez l'expression littérale de la concentration massique du glucose dans le coca.  [...] Puis on a prélevé 60µL de solution mère et mis dans une cuve avec une solution enzymatique contenant l'ATBS (volume total de la cuve. 3,06mL). On a mesuré l'absorbance à 430nm. Dans le cas du coca, on obtient. A=0,140 et pour le coca light. A=0,037 et on avait aussi un réactif témoin à A=0,050 et un témoin de glucose de concentration. 6µg/mL.  [...]

[Biochimie] Tpe-Aide-Microbio

Dans le cadre d'un antibiogramme, on parle de 0.5 de l'échelle de Mac Farland pour indiquer une concentration de 1.5*10x UFC/mL. UFC veut dire Unité Formant Colonies (1 cellule = 1 unité, en gros).  [...] Pour moi le plus simple est la numération en hématimètre (ou cellule de Malassez). Tu peux compter les cellules et déduire une concentration. Mais si le but est de prouver qu'il y a une contamination, je pense qu'une observation microscopique suffirait.  [...]

[Biochimie] Clonage après purification sur gel

As-tu déjà essayé de purifier ton ADN avec un kit de purification de produits de PCR J'avais commencé mes clonages avec un kit de purification sur gel. Le problème est que le rendement de ce genre de kit est souvent faible. Cela occasionne une grosse perte de matériel, surtout au bout de 3 ou 4 purif.  [...] Votre approche est interessant mais pas applicable dans mon cas. L'intérêt de la k7 de resistance de 2000 pb est un témoin de digestion du phagemid. Dans votre stratégie, au lieu de purifié un produit de digestion, je puriferais sur gel un produit PCR. Je garde cela en tete mais je doute.  [...]

[Biochimie] Role de la BSA dans une extraction protéique ??

une solution serait de faire une extraction témoin sans échantillon que tu utiliserais pour faire la gamme, mais je n'ai aucune idée de si la quantité qui sera présente aura un impact sur le dosage.  [...] Et un dosage des protéines extraites avec un Bradford modifié (RC DC biorad) à 750 pour pouvoir exprimer mes activités par quantité de prot extraites.  [...]

[Microbiologie] Absence de bacilles dans le yaourt qui m'intrigue :(

Aujourd'hui, on a fait une coloration de gram pour deux yaourts le premier étant le témoin ( sain) et le deuxieme un yaourt avarié, seulement après coloration de gram et observation au microscope photonique grossissement 100 on remarque présence des chaînettes de strepto mais aucune bacille et cela dans les deux échantillons le témoin et l'avarié sachant que dans un yaourt il y'a présence des deux bactéries Streptococcus bulgaricus et Lactobacillus thermophilus sinon le produit ne s'appellera pas yaourt mais un lait fermenté.  [...] On arrive pas à trouver une explication à cette absence totale des bacilles... si quelqu'un pourra m'eclaircir je serai reconnaissante.   [...]