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Génome : petites questions.

Bonjour, je me permets de créer ce post afin de poser une petite question sur la génétique. Nous savons qu'il existe dans le génome des régions codantes (exons) et des régions non codantes (introns et/ou exons). La région promotrice d'un gene est non codante pour celui-ci, mais est-il possible que cette région soit codante pour un autre gene, ou bien les régions non codantes le sont pour tous les gènes ( sans compter le fait qu'une région codante peut devenir non codante si l'euchromatine se condense en heterochromatine vu que l'heterochromatine ne permet pas la transcription.).   [...] Et aussi, est-ce que l'on sait qu'elle est la fonction des mini et microsatellites répétés en tandem Est-ce qu'ils permettent la régulation de la transcription comme les transposons et rétrotransposons ou bien est-ce qu'ils codent pour des protéines comme par exemple le gene à ARNr qui est lui aussi répété en tandem.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène et Promoteur

..). Dans le dogme central, il est établi qu'un gène sert à la fabrication d'un ARN messager, servant lui-même à la synthèse d'une protéine par le processus ultérieur de traduction.  [...] Le fait d'avoir un seul promoteur par unité de transcription permet une régulation plus fine de chaque gène individuellement, tandis que l'organisation de gènes en tandem appelés opérons dans le domaine des procaryotes permet d'organiser le génome en modules fonctionnels et de s'adapter rapidement à des variations de l'environnement (disponibilité de substrat,...).  [...]

Rétrogène et pseudogène

L'auteur de cette revue ( http.//protein.bio.msu.ru/biokhimiya...f/bcm_0559.pdf ) avance le fait que la duplication génique peut se produire au voisinage du gène d'origine tout comme sur d'autres chromosomes. De façon intéressante, il dit que si la duplication est en tandem, cela a tendance à éteindre le gène alors qu'une duplication lointaine (il parle de sites ectopiques) aurait tendance à conserver l'activité du gène ( the greater part of newly born tandem duplicates perish if they stay at the same place whereas translocation to ectopic sites, often a different chromosome, favors their survival ), mais logiquement celui-ci aurait un nouveau pattern d'expression.  [...] il faut noter que la duplication de gènes ne produit pas nécessairement des pseudogènes. Il y a un mécanisme bien connu de résistance à un insecticide (étudiée chez Culex pipiens) dans lequel un gène est multiplié jusqu'à plusieurs centaines de copies et toutes ces copies sont fonctionnelles.   [...]

[Biochimie] 2D LC : différence Offline vs Online

Dans les articles sur les méthodes d'études des protéines par des systèmes complexes comme LC-ESI-MS/MS, il n'est pas rare que les auteurs couplent leur système à des bases de données en ligne dédiées à des spectres de masse peptidiques. Ainsi, grâce à ce couplage, l'analyse est entièrement automatisée jusqu'au résultat final puisque l'ordinateur collecte le spectre de masse, se connecte à la base de données, compare le profil de fragmentation avec les profils préexistant et identifie la protéine.  [...] Discovery and Verification of Head-and-neck Cancer Biomarkers by Differential Protein Expression Analysis Using iTRAQ Labeling, Multidimensional Liquid Chromatography, and Tandem Mass Spectrometry.  [...]

[Biochimie] TPE PCR en temps réel, interprétation.

minisatellite = VNTR (variable number of tandem repeats). motif de 10-30pb riche en GC et répété en tandem un nombre variable de fois selon les individus, localisation surtout péri-télomérique, révélation par Southern blot.  [...] microsatellite = STR (short tandem repeats). motif de 1-4pb répété en tandem un nombre variable de fois selon les individus, répartition homogène dans le génome mais souvent extragénique, non stable, révélation par PCR.  [...]

[Biotechnologie] spectrométrie de masse type MALDI en tandem

quelles sont les applications de la spectrométrie de masse type MALDI en tandem ( a part son application en criminologie ou toxicologie, pour la détection de la glycosylation, le dépistage néonatal, et la protéomique) existe il autre domaines d'application.  [...] Etant donné que la préparation pré-analyse réclame un peu plus de manipulations, on la réserve surtout à l'étude de grosses molécules telles que les protéines.  [...]

[Génétique] Vocabulaire en génétique

- un gène peut-il être pléiotrope il faudrait que la réponse soit non mais si l'allele peut etre polyentrope pourquoi le gène ne le serait-il pas.   [...] quelle est la différence entre VNTR (variable number tandem repetition) et STR (short tandem repeats).  [...]

[Divers] L'extraction d'ADN

Les scientifiques comparent sur l'ADN des régions que l'on appelle STR (Short Tandem Repeat). ce sont de courtes régions (2 à 7 paire de base) répétés en tandem.  [...] Les caractéristiques des STR utilisés sont. la présence sur plusieurs chromosomes (indépendants), région non codante (dans un souci d'éthique), faible taux de mutation, fort taux d'hétérozygotie, stable au multiplexage.   [...]

[Génétique] Questions Materials & Methods...

Secundo, dans la partie traitant des duplications intrachromosomiques en tandem direct, les gars prennent 2 exemples de duplications. Bon, c'est cool, les deux sont orientées ainsi. Mais pourquoi les deux en questions sont de tailles inférieure ou égale à 100 kb, alors que la taille de pratiquement 2/3 des duplications intrachromosomiques qu'ils ont mises en évidence est supérieure à 100 kb Personne n'en pipe un mot.  [...] This result suggests that large tandem duplications alter meiotic segregation of chromosomes, which may lead to abnormal and unviable meiotic products.  [...]

Séquence ADN

La définition de mon cours dit Les VNTR sont caractérisés par la présence d'une séquence donnée répétée plusieurs fois en tandem.  [...] J'aurais une autre question s'il vous plaît, concernant les STR cette fois-ci et les VNTR, pourquoi pour détecter des STR on ne fait pas de Southern Blot mais uniquement de la PCR car mon cours dit que pour détecter les VNTR nous faisons des PCR et des Southern Blot, et pour detecter les STR nous faisons des PCR (on ne parle donc pas de Southern pour les STR).   [...]