• Forum - Substrat, Enzyme, Question, Organisme, Protéine

[Biochimie] nomenclature

salut tout le monde, j'ais une question pour les biochimistes versés dans la biologie végétale par rapport à la signification de codes du genre (EC 3.2.1.91) pour la cellobiohydrolase qui est une cellulase.  [...] Il y a probablement un site sur lequel tu peux trouver toute l'arborescence. En général, le premier chiffre correspond au type de réaction catalysée, le deuxième précise le mécanisme de recombinaison, le troisième le substrat de l'enzyme dont il est question et le quatrième l'organisme dont on a isolé la protéine (de souvenirs).  [...]

[Biochimie] fonctionnement des enzymes

Dans cette question il y a deux aspects. l'aspect spatial et l'aspect chimique. D'un point de vue spatial, les enzymes sont des protéines qui ont une structure particulière qui va permettre au composé que l'on nomme Substrat de s'ajuster dans la protéine formant le complexe Enzyme-Substrat, imaginez que l'enzyme ait un creux en forme de triangle et que le substrat ait justement une forme de triangle (comme les jeux pour bébés).  [...] Le produit, lorsqu'il est en excès, se fixe à un autre endroit de l'enzyme. Ce faisant, l'enzyme va changer de forme, le site sur lequel le substrat devrait se fixer n'est plus accessible. (dans ma métaphore, le triangle en creux qui est souple devient un triangle déformé dans lequel on ne peut plus placer de triangle à cause du losange qui est venu se placer sur un autre endroit de l'enzyme).  [...]

[Biologie Cellulaire] Rôle des Cdk et Cycline dans le cycle cellulaire.

J'ai une question, dans mon cours de régulation du cycle cellulaire il parle de cycline et de Cdk c'est bien beau tout ça mais au final il n'arrive pas au rôle concret de ces cyclines et Cdk donc j'aurais besoin de confirmation de ce que je vais dire. La cycline est le substrat du Cdk qui est une Kinase dépendante de la cycline donc qui dit Kinase dit Phospho Transférase, je sais que quand la cycline se fixe sur la Cdk elle l'active donc ça voudrait dire que c'est la Cdk qui joue un rôle Elle phosphoryle d'autres protéine/enzyme de croissance, prolifération etc.  [...] Oui la phosphorylation des protéines cibles par le complexe cycline/CdK entraîne pour ces protéines de nouvelles propriétés (activation, inhibition, changement de partenaire d'interaction).  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 7

Je suis une protéine de 1247 aa, à deux domaines. le N-term est constitué d'environ 630 aa présentant une bonne ressemblance avec une certaine enzyme d' E.coli. Je suis quelqu'un d'atypique.  [...] Je ne sais pas trop quoi vous donner comme indices sans trop en dire... Cette protéine est un enzyme, ses deux domaines ont une fonction distincte. Cet enzyme a pour substrat l'ADN. Le point important est le mot atypique. autant la fonction que les organismes chez lesquels on la trouve.  [...]

Inhibiteurs compétitifs

Question 1. non, une enzyme allostérique est une enzyme à plusieurs sites actifs semblables. Ce type d'enzyme possède plusieurs sites actifs différents fixant généralement le même substrat.  [...] Question 2. ils font référence ici au type de molécule qui constitue le substrat. Une enzyme est un catalyseur d'une réaction chimique définie. Une molécule ressemblant au substrat mais légèrement différente pourra faire office d'inhibiteur.  [...]

Vecteur de clonage, PCR et vecteur d'expression

Je ne voulais pas dire que c'etait specifique d'une enzyme mais qu'on pouvait utiliser l'enzyme comme proteine liée au DB et le substrat lié au AD.  [...] Je pense surtout que tu utilises le mauvait vocabulaire. un substrat est une petite molecule qui est modifiée par l'enzyme. dans quelques cas le substrat peut etre une autre proteine, mais on n'utilise pas le double hybride pour etudier cela.  [...]

Protéine dépendante d'ions pour une oxydation chez E.Coli

Un peut compliqué comme cahier des charges. Enzyme je suppose Ou bien peut-il s'agir d'une protéine membranaire type chaine respiratoire Quand vous parlez d'oxydation, s'agit-il d'un substrat organique ou minéral Etc.  [...] Le substrat serait organique en effet, il s'agit d'une enzyme membranaire. La réaction que je recherche est en fait d'une oxydoréduction entre 2 enzymes, mais largement conditionnée par la présence d'un ion.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Tout est une question de conformation, c'est à dire de structure tridimensionnelle. La spécificité de substrat repose, entre autres, sur la conformation du site actif (la partie de la protéine qui va être responsable de la catalyse) et de ses environs. Quand un substrat s'approche du site actif, il va y avoir des micro-ajustements réciproques entre enzyme et substrat, avec formation de liaisons de faible énergie (c'est à dire non covalentes).  [...] Ainsi, certaines enzymes vont être flexibles, ou alors certains substrats auront une structure tridimensionnelle proche ce qui leur permet d'établir des interactions suffisament importantes avec l'enzyme. Un exemple type. vous avez du voir la traduction, qui met en jeu les ARNt.  [...]

[Microbiologie] génétique bactérienne et enzymes inductibles

..je me suis dit si il existe des gènes capables de faire l'étude d'un substrat nutritif et de fabriquer l'enzyme capable de le digérer, ce phénomène mérite l'étude, car si nous trouvons un moyen de génie génétique pour améliorer cette capacité après l'avoir décrite dans tout ces détails, on pourrait sélectionner des bactéries susceptible de faire réussir la fabrication d'une enzyme qui digère le plastique et faire un lâché massif dans les océans pour le nettoyer du plastique qui le pollue.  [...] ma question sans plus tarder, c'est quel est la machinerie utilisée par la bactérie pour fabriquer des enzymes spécifique à un substrat inconnu...je veux dire utilise t elle une espèce de protéine moule qui l'aide à savoir exactement combien d'espace couper ou conserver aux seins de l'enzyme comme lorsque vous allez chez le dentiste pour une prothèse il prélève l'emprunte de vos dents pour qu'il sache quel forme exacte donner à la prothèse.  [...]

Enzyme

Lundi dernier alors que je suivait attentivement le cour de SVT sur les enzymes, je me suis pose une question, comment l'enzyme modifie t'elle son substrat, par quels procedes chimiques Un echange d'acide amine ou autre truc du genre.  [...] Et bien, l'enzyme se lie par liaisons faibles à son substrat, et donc, ce faisant, lui communique de l'énergie, abaissant par conséquent la quantité d'énergie nécessaire à la réaction.  [...]