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[Biochimie] Structure 3D protéines,...

Est-ce que l'un de vous pourrait m'indiquer où je pourrais obtenir les structures 3D de protéines et autres molécules.  [...] Car je ne m'y retrouve pas trop sur Swissprot ou UniProt.   [...]

Quizz biologique

1.Les protéines de structure sont des molécules utiles pour la construction des structures cellulaires. Les protéines de fonction sont souvent des enzymes, elles permettent l'activation ou la régulation des réactions biochimiques de la cellule. Quest-ce qui donne à une protéine sa qualité d'enzyme.  [...] Ca c'est pour un gène sur une seule paire d'homologues mais tu te doutes bien que le phénomène est amplifié sachant qu'il peut y avoir plusieurs centaines (voir milliers) de gènes sur un même chromosome, avec parfois plusieurs dizaines d'allèles possibles pour chaque gène.   [...]

[Biochimie] Inhibiteurs d'enzymes

C'est une question à priori simple mais qui demande une réponse hyper compliquée. Il y a deux méthodes, soit ta protéine a une activité facilement mesurable. Tu peux alors mesurer l'effet d'une collection de molécules sur l'activité (tu peux pour ça t'aider des homologies de structures d'autres protéines ayant des molécules inhibitrices connues).  [...] L'autre méthode est beaucoup plus complexe et nécessite d'utiliser la méthode du FBDD (fragment based drug design) qui se réalise dans des plateformes spécialisées. La technique est complexe à décrire ici en quelques lignes, mais l'idée est de générer une molécule groupement par groupement pour l'adapter au site actif.  [...]

où trouver des schémas simples de structures quaternaires?

Savez-vous où je peux trouver des schémas simples de structures quaternaires molécules type protéines.  [...] bonjour, sur google dans recherche d'images tu peux trouver quelques schémas de la structure quaternaire de protéines (la plus couraante. l'hémoglobine) mais je ne sais pas si c'est ça que tu cherches.  [...]

Le collagéne

C'est l'arrangement de structures secondaires en formant de grosses sous-unités. Mais le collagène comprends évidemment toutes les hélices ensembles, pas uniquement 3.  [...] Page 18. Tandis que les protéines globulaires ont des structures secondaire, tertiaire ( http.//www.cours-medecine.info/bioch...proteines.html ), voire quaternaire, les protéines fibreuses ( ex. Le collagène ) n'ont ni structure tertiaire ni structure quaternaire et leur structure secondaire associe plusieurs molécules suivantes.  [...]

[Evolution] Molécules homologues

Exemple. une kinase va phosphoryller des protéines mais je pense que l'on peut trouver des protéines sans activité kinase et avec une structure proche.  [...] Relative pauvrete de structures... oui et non. On sait combien il est difficile d'obtenir et cristalliser des proteines. Alors, dans le cas ou on parlerait de structures, je pense qu'il faut faire attention a avoir une vision integrative de la chose dans le sens prendre en compte la facon de description des molecules.  [...]

l'Actine, ses homologues et l'origine de la polarité

Maintenant, chez un organisme procaryote, d'un point de vue évolutif, ne peut on pas penser que la bactérie (dont la survie dépend de sa rapidité de mise en place et de régulation des processus biologiques) se serve de l'actine comme moteur direct (ou indirect via des moteurs moléculaires non identifiés en interaction avec elle) pour l'adressage de protéines à un pôle cellulaire.  [...] .. et à ce moment là envoyer des protéines à un endroit spécifique permettant ainsi l'élaboration de structures localisées... ce qui conduirait à une distribution asymétrique des protéines. Le problème est que la polarité du filament d'actine procaryote n'a jamais été montrée et qu'on n'a pu mettre en évidence de moteurs moléculaires ou même d'interacteurs avec le filament.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéines [Master 2] problème structures secondaires différentes

Je pensais que les structures secondaires étaient déterminées par les structures primaires et qu'elles correspondaient au niveau de conformation le plus stable (soit une séquence d'acides aminés = une seule structure secondaire possible).  [...] Après de nombreuses recherches infructueuses, je me demande si ces séquences ne seraient pas les protéines prions mais je pense que c'est plutôt un exemple que le nom générique de ces séquences (et puis les protéines prions sont des protéines complètes).  [...]

Petite énigme à vous soumettre...

Bon je détaille un peu plus mon idée de départ Je pense en effet donc à un criblage haut débit, avec par exemple un criblage in-silicio suivie d'une étude plus poussée des molécules retenues par RMN. En effet, la RMN est une très bonne méthode pour mettre en évidence des intéractions protéines-ligand, et pourrait donc permettre d'obtenir des données fort intéressantes.  [...] Le premier test va donc être un traitement informatique pour supprimer les doublons parmi les 20.000 structures, et sélectionner les molécules susceptibles de se lier à la protéine. Il existe des programmes informatiques permettant ce genre de travail.  [...]

fichiers PDB

je commence tout juste mes etudes en biologie et j'aimerai savoir si vous connaissez un site qui explique bien comment lire un fichier PDB d'une molécule par soi-meme. ^_^.  [...] Une fois rasmol installé. télécharge un fichier pdb, et ouvre-le avec rasmol. Tu verras la molécule, et tu pourras choisir d'afficher les atomes, les représentations de structures secondaires des protéines, etc.  [...]