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Mutation d'une enzyme

Bonjour à tous. est ce que des modifications de la structure primaire d'une enzyme va entrainer une modification de la structure tertiaire et donc modifier son site actif et son activité ou bien l'enzyme garde une activité intacte si elle est mutée Merci.  [...] Impossible de te donner une réponse qui est valable dans tous les cas de figure, parfois oui, parfois non. Une modification de structure primaire peut ne pas affecter la structure tertiaire, une modification de la structure tertiaire peut ne pas modifier le site actif de l'enzyme.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fonctionnement des enzymes

I/ Fonctionnement de l'enzyme. définition de l'enzyme, la double spécificité site actif, structure des enzyme (structure primaire qui determine les structure secondaire, tertiaire).  [...] C'est aussi très important d'en parler au début car c'est ce qui détermine le site actif (structure tertiaire ou quaternaire, en fonction des enzymes) et c'est aussi la structure de la protéine qui détermine ses conditions de fonctionnement (pH, température ect...).  [...]

[Evolution] Intérêt de la Photorespiration & évolution.

La structure prise par le site actif pour permettre l'activité carboxylase entrainerait elle obligatoirement une activité oxygenase par analogie dans la reconaissance des 2 substats (oxygène et dioxyde de carbone) par le site actif.  [...] Les chercheurs en génie génétique planchent depuis un moment pour retirer cette activité carboxylase... sans succès. Serais ce la preuve que cette double spécificité de substrat soit trop fine et que l'on ne trouve ainsi pas se séquence codant l'enzyme avec une spécificité simple pour le dioxyde de carbone J'imagine qu'a défaut de supprimer cette double spécificité on doit également chercher à diminuer le Km de l'enzyme pour l'oxygène.  [...]

[Génétique] svt devoir

(les protéines restent néanmoins de simples molécules. C'est leur site actif et leur structure 3D qui leur permettent d'avoir différentes fonctions. Cest basé sur des lois physico-chimiques universelles).  [...] Alors l'hémoglobine est quand même fonctionnelle dans ce cas car son site actif n'est pas touché. Mais sa structure 3D est affectée et donc elle est moins efficace que d'habitude. Elle est aussi moins soluble. De plus, cette hémoglobine anormale a tendance à s'agglomérer avec ses copines déformant ainsi le globule rouge.  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

Cette structure est importante(site actif) pour la fonction de la protéine. Et donc dans un pH différent cette structure peut être modifiée ce qui peut rendre la protéine non fonctionnelle.  [...] Comme le soulignait Novocaine, cela doit également jouer sur la structure tridimensionelle de l'enzyme et donc la capacité à fixer le substrat mais également sur la catalyse enzymatique elle meme. Dans le cas de la température, je sais pas trop, mais l'augmentation de la température devrait augmenter l'agitation et donc augmenter la constante d'association et par conséquent la vitesse.  [...]

[Divers] Bioinfo- docking

Je souhaiterais docker cet inhibiteur dans le site actif de la meme enzyme, mais issue d'une autre espece. Je dispose également de la structure RX de l'enzyme chez cette autre espece (le site actif est relativement bien conservé). Le but est d'essayer de comprendre, d'un point de vue structural, les différences d'activités observées pour cet inhibiteur chez les differentes especes.  [...] Donc, ma question est de savoir si vous connaissez un logiciel, suffisament intuitif(et idealement en libre-acces), pour qu'un pauvre chimiste tel que moi puisse parvenir à realiser ce docking, et si possible, faire une petite minimisation.   [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme

Bonsoir, Ce sont tous les deux des enzymes protéolytiques mais ils sont différents par leur séquence d'acides aminés et par conséquent, leur structure 3D est différente. La structure est importante notamment au niveau du site actif. Imagine que le site actif soit une serrure et que le substrat soit une clé.  [...] Si la clé entre bien dans la serrure alors le substrat est fixé au niveau du site actif et l'enzyme peut agir. La trypsine et la chymotrypsine ont des serrures différentes.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Tout est une question de conformation, c'est à dire de structure tridimensionnelle. La spécificité de substrat repose, entre autres, sur la conformation du site actif (la partie de la protéine qui va être responsable de la catalyse) et de ses environs. Quand un substrat s'approche du site actif, il va y avoir des micro-ajustements réciproques entre enzyme et substrat, avec formation de liaisons de faible énergie (c'est à dire non covalentes).  [...] C'était une mauvaise idée, l'enzyme dispose de moyens de contrôle et le dégrade. Pourtant, s'il a pu pénétrer à proximité du site actif, c'est que l'enzyme peut se lier à plusieurs acides aminés, structurellement proches.  [...]

Adieu l'orthodoxie dans l'évolution

Prenons l'hémoglobine. La zone qui code pour le site actif mute plus lentement que celle qui code pour la structure d'ensemble.  [...] Mais l'aléatoire n'est pas opposé strictement à déterminisme puisque dans un processus aléatoire, il existe une structure sous-jacente, un champ de probabilité, et rien de plus déterminé que les probabilités d'un jet de dés (ou d'une actualisation d'une observavble quantique).  [...]

[Biochimie] Immunoblotting, anticorps

d' ou ma question. connais tu une technique pour vérifier que la cysteine est bien proche du site actif, sachant qu on connait La séquence de la protéine mais pas sa structure 3D.  [...] OUh, pas évident... quand on n'a pas la structure 3D, on peut fonctionner par analogie avec des protéines déjà caractérisées. Sinon je ne vois pas.  [...]