• Forum - Structure, Protéine, Liaisons

[Biologie Moléculaire] liaisons chimiques

Je voudrai savoir quelles sont les différentes liaisons chimiques qu'on trouve dans la structure primaire d'une protéine.  [...] Concernant la liaison peptidoïde, d'un point de vue chimique strict, ça reste une liaison amide (NH2 - COOH) comme la liaison peptidique.  [...]

Dénaturation Protéique

Quand on dénature une protéine, on perd les niveaux de structure secondaire, tertiaire et quaternaire. Je suis allée à la recherche d'une définition plus précise de dénaturation protéique sur le net, et souvent on y dit que dénaturer ne rompt pas les liaisons covalentes.  [...] Pour moi, la dénaturation protéique correspond à la perte de la structure tertiaire de la protéine que celle-ci soit due à des liaisons faibles comme les liaisons H ou covalentes comme les ponts disulfure. A confronter à d'autres avis.  [...]

la molécule d'ADN & "molécule"

La première. une protéine est une grosse molécule (assemblage d'atome) cela veux dire qu'une protéine faite de plusieurs sous-unité (relié par liaison H) reste une seule molécule. Cela veut dire qu'une molécule est un ensemble d'atome relié ensemble, mais pas forcement par des liaisons covalentes.  [...] une protéine est une suite d'acides aminés liés par des liaisons covalentes (structure primaire) qui peut se replier sur elle même par des liaisons non covalentes localement (structure secondaire) ou globalement (structure tertiaire). La structure quaternaire est l'association par des liaisons non covalentes de plusieurs protéines (complexe protéique).  [...]

[Biochimie] L'urée

Bonjour, j'aimerais comprendre un petit truc =S voilà on sait que l'urée dégrade les liaisons hydrogènes, or dans une structure quaternaire ce sont les liaisons covalentes et les points disulfures qui sont mis en jeu, alors pourquoi dit-on que l'urée peut dénaturer la structure quaternaire alors que dans la structure quaternaire, comme on vient de le dire, ce ne sont pas les liaisons hydrogènes qui sont mis en jeu.  [...] Ah oui désolé je me suis trompé c'est bien liaisons faibles. Donc c'est parce-que la liaison hydrogène est une liaison faible qu'on dit que la structure quaternaire est dénaturée.  [...]

[Biochimie] exposé d'SVT: help!!!

Dans un exposé structuré et illustré, vous expliquerez précisément comment s'effectue la synthèse d'une protéine à partir d'un gène puis commentune enzyme catalyse une réaction chimique.  [...] Tu dois juste savoir que la séquence en acides aminées est déterminante dans la structure spatiale d'une protéine, parce qu'il se forme entre eux des liaisons chimiques qui entrainent des replis de la protéines.  [...]

[Biochimie] Sds page

EDIT. Lors de l'action de l'urée, tu as juste une dénaturation de la structure tertiaire, tu n'as pas rupture des ponts disulfures ou autres liaisons covalentes, autrement dit, ta protéine même constitué de 100 unités reste en un seul morceau si on peut dire ça comme ça ^^.  [...] Enfait, si j'ai bien suivi votre discussion tout joue sur la connaissance de la definition du mot dimère qui n'est pas egal une protéine formée deux morceaux mais à une protéine formée en deux morceaux égaux.  [...]

a propos d'immuno, et de proteines...

Deuxième question. La structure tertiaire d'une proteine, est elle due à des liaisons covalentes entre des acides aminés souvent normalement éloignés les uns des autres.  [...] Concernant la structure tertiaire des protéines, ne surtout pas oublier les interactions hydrophobes, qui sont les premières impliquées dans la conformation native, les liaisons covalentes nécessitant une intervention enzymatique.  [...]

[Biochimie] Les propriétés des enzymes dépendent de leur structure spatiale

Après avoir défini ce qu'est une enzyme, vous expliquerez l'importance de la structure tridimensionnelle d'une protéine enzymatique dans la réalisation de sa fonction, puis vous présenterez les facteurs à l'origine de modifications de l'activité enzymatique.  [...] Je pense que dans le I, il faut parler de la structure de l'enzyme complémentaire avec celle du substrat, du site catalytique et du site de fixation. Dans le II, la température, le pH etc qui cassent les liaisons faibles de l'enzyme, et qui la rendent non fonctionnelle, la protéine qui est mal synthétisée par le gène à cause d'une mutation.  [...]

Liaisons H et ponts disulfure.

Pour les liaisons hydrogènes elle participent aussi à la stabilisation de la protéine mais aussi à la liaison entre l'enzyme et son substrat. Voit plutot les liaisons hydrogène comme une bande Velcro, si on à une liaisons hydrogène ca ne tient pas longtemps, mais si on multiplie les liaisons hydrogène ca devient de plus en plus stable.  [...] Les liaisons H (liaisons non covalentes) et les ponts dissulfures (liaisons covalente soit 20 fois plus forte) participent et forment l'architecture d'une proteine, d'une enzyme... Si tu perturbe cette organisation, la structure change, la fonction aussi.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Tout est une question de conformation, c'est à dire de structure tridimensionnelle. La spécificité de substrat repose, entre autres, sur la conformation du site actif (la partie de la protéine qui va être responsable de la catalyse) et de ses environs. Quand un substrat s'approche du site actif, il va y avoir des micro-ajustements réciproques entre enzyme et substrat, avec formation de liaisons de faible énergie (c'est à dire non covalentes).  [...] Ainsi, certaines enzymes vont être flexibles, ou alors certains substrats auront une structure tridimensionnelle proche ce qui leur permet d'établir des interactions suffisament importantes avec l'enzyme. Un exemple type. vous avez du voir la traduction, qui met en jeu les ARNt.  [...]