• Forum - Structure, Protéine, Beta

[Biochimie] acides aminés et structures

Peut-on deduire la structure II(hélice alpha, feuillet beta..) ou III (repliement ) d'une protéine à partir d'une séquence d'acides aminés (structure I).  [...] On arrive à peu près correctement à prédire les structures IIaires des protéines, mais pour les structures IIIaires, c'est beaucoup plus difficile. Et en fait, on ne prédit pas vraiment la structure, on essait de trouver parmi les structures que l'on connait déjà, lesquelles pourraient correspondre à la séquence donnée.  [...]

[Biochimie] Les protéines

Enfin, la structure quaternaire est l'assemblage de plussieurs protéines entre elles (exemple. l'hémoglobine a 2 chaines alpha et 2 chaines béta aurour d'un atome de fer. Chacune des chaines étant une protéine).  [...] l'alpha-kératine (protéine essentielle des cheveux et poils).elle est formée uniquement par des hélices alpha,mais cela ne signifie pas qu'elle est de structure secondaire.Par définition la structure tertiaire correspond au repliement du polypeptide déja organisé dans une stucture secondaire.  [...]

Protéine avec bcp de résidus acides migre de façon aberrante en western blot

- As-tu bien dénaturé ta protéine bouilli et utilisation de Beta mercapto (ou autre) en suffisance Car pour moi ta protéine a peut-être gardé une partie de sa structure 3D, ce qui l'empêche de passer les mailles formés par ton gel et donc de migré. Ceci pourrait en faite le bloqué avant la taille attendu.  [...] La sérine aurait une possibilité d'intéragir au niveau structurel avec un autre aa de ta séquence malgrè la présence de dénaturant Même si au moment de l'injecté elle est dénaturé, le fait que le tampon de migration dilue le composée dénaturant et imaginant que ta protéine a une vitesse de reconformation 3D rapide, alors il est possible que.  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

C'est lié à la structure primaire qui présente 8 domaines composés d'a.a. favorables à la formation d'hélice alpha. Ces domaines, dans la structure primaire sont successifs mais séparés par des a.a. qui n'entrent pas dans la formation de la structure secondaire. On a donc 8 hélices bien distinctes.  [...] La structure tertiaire, qui représente l'organisation tridimensionnelle de la protéine, peut donc être organisée en plusieurs domaine, et se retrouver avec des hélices alpha, des domaines beta ou même des structures désorganisées (sans aucune forme précise), et tout cela en même temps.  [...]

Dénaturation de prions

Bah oui mais ce que je comprend pas c'est pourquoi dans ce cas là ils sont de nouveaux actif En fait sa revient a demander est-ce que une protéine dénaturé peut reprendre sa conformation native.  [...] Sinon pour les prions PrpSc, il me semble que la structure en feuillet beta de la protéine est beaucoup plus stable thermiquement, et que donc pour cette raison il faut des temperatures beaucoup plus fortes pour la dénaturer.  [...]

[Biologie Moléculaire] Ribose ou.. Beta-D-ribofuranose

Alors on va commencer par les protéines. Une protéine tu le sais aussi bien que moi c'est un enchainement d'acides aminés liés par une liaison peptidique. Cet enchainement forme la structure primaire. Ensuite ces acides aminés s'agencent entres eux en fonction de leurs relations stériques.  [...] hélice alpha et feuillet plissé beta ne concernent que les protéine. La stucture tertiaire concerne la protéine achevée, la structure quaternaire quand la protéine contient au moins deux chaines polypeptidiques.  [...]

[Biochimie] peptides

ah oui je voulais préciser. pour moi, enfin pour le prof, un peptide est une séquence allant jusqu'à environ 20, quoique les exemples donnés en cours dépassent pourtant souvent 20.Sinon quand on parle de chaîne peptidique c'est bien la même chose que peptide,c'est çapuisque la structure quaternaire est une association de chaînes..merci.  [...] tout dépend de la définition.. structure secondaire, tertiaire, quaternaire... tout ca répond au besoin incessant de l'homme de classer, encore classer, toujours classer. Mais pour quoi faire personne n'est d'accord sur la définition de la limite entre un peptide et une protéine, ni entre un oligisaccharide et un polysaccharide d'ailleurs.  [...]

[Biologie Moléculaire] Structures

=. la structure primaire conditionne la structure tertiaire, qui elle meme impose la fonction -si on dénature, donc fait perdre sa structure 3D a la protéine, elle devient inactive-. (Qu'est-ce qui conditionne la structure secondaire ).  [...] De même, la capacité de la protéine à former des structure tertiaire dépend de sa séquence, c'est à dire de la nature et de l'enchaînement des AA qui la constitue. Il faut une certaine alternance d'AA hydrophiles et hydrophobe pour former un feuillet Beta puis ensuite pour pour faire en sorte que ce feuillet se positionne de façon optimale pour la fonction de la protéine.  [...]

[Biochimie] Chaines de l'hemoglobine

Pour être plus précis, ces noms ont-ils été choisis en fonction du domaine (alpha, beta, alpha+beta) de la structure tertiaire.  [...] Non, rien à voir avec la structure tertiaire (hélice alpha, feuillet beta) mais simplement la dénomination des différentes chaînes de la protéine.  [...]

[Biochimie] Influence du NaCl sur structure secondaire (feuillet beta)

Je bloque sur un exercice de biochimie dont la correction n'est pas détaillée. On étudie l'influence de la présence de NaCl à 50 mM sur les spectres de dichroïsme circulaire de trois protéines. Dans deux cas sur trois, l'ajout de NaCl à 50 mM provoque une modification du spectre de DC, qui devient alors caractéristique des feuillets beta (minimum à 215 nm).  [...] Je ne comprends pas le rôle du NaCl et pourquoi celui-ci peut-il modifier ou pas la structure de la protéine en faveur des feuillets beta.  [...]