• Forum - Structure, Enzyme, Substrat

[Biologie Moléculaire] Conditions de la catalyse enzymatique ? interprétations?

L'enzyme possède un site catalytique qui de part sa structure 3D permet de positionner le substrat parfaitement dans l'espace pour que les réactions chimiques puissent avoir lieu. Donc l'eau ne peut pas faire ça je pense.  [...] Bref, en dénaturant ta molécule, tu lui enleves toutes les liaisons intramoléculaires qui lui donnaient sa forme spécifique, elle revient quasiment à une structure linéaire (primaire). Comme une enzyme est stéréospécifique, son action sur le substrait est rendue impossible par dénaturation.  [...]

[Biochimie] Les propriétés des enzymes dépendent de leur structure spatiale

Après avoir défini ce qu'est une enzyme, vous expliquerez l'importance de la structure tridimensionnelle d'une protéine enzymatique dans la réalisation de sa fonction, puis vous présenterez les facteurs à l'origine de modifications de l'activité enzymatique.  [...] Je pense que dans le I, il faut parler de la structure de l'enzyme complémentaire avec celle du substrat, du site catalytique et du site de fixation. Dans le II, la température, le pH etc qui cassent les liaisons faibles de l'enzyme, et qui la rendent non fonctionnelle, la protéine qui est mal synthétisée par le gène à cause d'une mutation.  [...]

[Biochimie] fonctionnement des enzymes

Dans cette question il y a deux aspects. l'aspect spatial et l'aspect chimique. D'un point de vue spatial, les enzymes sont des protéines qui ont une structure particulière qui va permettre au composé que l'on nomme Substrat de s'ajuster dans la protéine formant le complexe Enzyme-Substrat, imaginez que l'enzyme ait un creux en forme de triangle et que le substrat ait justement une forme de triangle (comme les jeux pour bébés).  [...] Le produit, lorsqu'il est en excès, se fixe à un autre endroit de l'enzyme. Ce faisant, l'enzyme va changer de forme, le site sur lequel le substrat devrait se fixer n'est plus accessible. (dans ma métaphore, le triangle en creux qui est souple devient un triangle déformé dans lequel on ne peut plus placer de triangle à cause du losange qui est venu se placer sur un autre endroit de l'enzyme).  [...]

[Divers] Différence entre Biochimie et Biologie moléculaire

Par exemple cela va de l'enzyme qui synthétise une sucre, avec le substrat nécessaire, l'énergie impliqué...etc, la formation du sucre, sa structure, sa disposition dans la paroi ou son stockage, sa dégradation (par qui et comment), et son rôle.  [...] Biologie moléculaire. Au sens strict, branche de la biologie qui vise à expliquer les propriétés biologiques des protéines et des acides nucléiques par leur structure moléculaire. Dans le langage courant, le terme se rapporte aussi à toute forme de manipulations de gênes (ex.  [...]

DNAses, pourquoi spécifique aux ADN?

les enzymes ont une spécificité de substrat, en l'occurence l'ADN, tout comme la glucose oxydase oxyde le glucose et pas ses isomères ou comme la pyruvate deshydrogénase kinase phosphoryle la pyruvate deshydrogénase et pas autre chose. C'est rendu possible par la reconnaissance par l'enzyme de son substrat, elle même liée a une conformation spécifique de l'enzyme qui permet ou non la formation du complexe enzyme substrat PUIS le déroulement de la réaction.  [...] Et dans la formation du complexe enzyme-substrat, il n'y a pas que la structure du site ou se déroule la réaction qui compte (ici la liaison PDE), dans notre exemple la seule présence du groupe hydroxy sur le ribose peut faire la différence.  [...]

[Biologie Cellulaire] les enzymes et la catalyse

Il s'agit d'expliquer comment les enzymes réalisent la catalyse et de montrer que certains facteurs peuvent influencer la vitesse de réaction enzymatique.  [...] Je fais le même sujet... Il faudrait donc parler de structure tridimensionelle j'avais raison mais par contre est-ce judicieux de faire une sous-partie qui ne parle que de cela puis après une sous partie Enzyme-Substrat ou alors faire un petit mixe des deux dans une grande sous partie.  [...]

[Biochimie] Enzyme

Diverses théories ont été proposées pour expliquer les modifications structurales du substrat et/ou de l'enzyme lors de leur association.  [...] c.Williams Jenks (1966) a proposé le modèle appelé strain (trad.. tension. déformation). c'est une combinaison des deux théories qui précèdent. Les changements de conformation de l'enzyme entraînent des contraintes dans la structure du substrat.  [...]

[Génétique] Groupe sanguin et parentalité

Ces molécules sont formées d'un substrat (une molécule de base) sur lequel se fixe des marqueurs. Ces réactions doivent être catalysées par des enzymes, ces enzymes sont synthétisées à partir du programme génétique contenu dans nos gènes.  [...] gène 1NF qui donne une enzyme 1 non fonctionnelle ce qui bloque les réactions suivantes même si l'enzyme 2A ou 2B est présente.  [...]

[Biochimie] Biochimie > Enzymologie > constante de Michaelis (Km)

Euh... En fait, Km represente l' INVERSE de l'affinite de l'enzyme pour le substrat, cette constante pourrait etre assimile a la constante de dissociation de l'enzyme avec son substrat.  [...] Euh... En fait, Km represente l' INVERSE de l'affinite de l'enzyme pour le substrat, cette constante pourrait etre assimile a la constante de dissociation de l'enzyme avec son substrat... ( SPILLOU ).  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

Comme le soulignait Novocaine, cela doit également jouer sur la structure tridimensionelle de l'enzyme et donc la capacité à fixer le substrat mais également sur la catalyse enzymatique elle meme. Dans le cas de la température, je sais pas trop, mais l'augmentation de la température devrait augmenter l'agitation et donc augmenter la constante d'association et par conséquent la vitesse.  [...] Cependant, des trop fortes températures pourraient altérer la structure de l'enzyme et par conséquent nuire à la catalyse. En espérant ne pas avoir dit trop de bétises.  [...]