• Forum - Structure, Acides aminés, Chaîne

[Divers] Confusion sur les notions "basiques"

J'ai un gros problème que je viens de m'en rendre compte, en effet premièrement aussi triviale que ça peut paraitre à part dire que l'ADN est une molécule je pourrais pas parler plus en détails ou expliquer grossomodo le focntionnement, de même chromosomes, nucleotides, séquence primaire/secondaire, acide aminés mitose et cie il y'a un gros vide concernant ces notions et leurs liens qui est imbriqué dans quoi mais je crois que ces notions sont basique et qu'il est important de les connaitres.  [...] La structure primaire c'est l'enchainement des acides aminés ou des acides nucléiques. La structure secondaire se sont les interactions entre les acides aminés (nucléiques) de la chaine qui entraine un repliement de cette dernière.  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

- La structure secondaire, qui représente l'organisation de cette chaine d'acides aminés, en hélice alpha ou en feuillet bêta par exemple.  [...] Cependant, il arrive que certains acides aminés, et c'est le cas pour la proline, cassent l'hélice mais que plus loin dans la chaine celle-ci soit reformée.  [...]

[Microbiologie] Hydrophobocité de la surface bactérienne !

À la louche, je dirai que les bactéries Gram-, possèdant une bicouche lipidique externe, auront une charge statique de surface (fort) probablement négative.   [...] Quant aux bactéries Gram+, a priori je pense qu'on a une structure avec localement des moments dipolaires. Je pense qu'il y aurait des possibilités que ce soit légèrement négatif en fonction des acides aminés de la chaîne oligopeptidique. Néanmoins la structure doit être globalement neutre.  [...]

structure quaternaire d'une protéine

- Ensuite des acides animés voisin de cette chaine polypeptidique, par le biais d'interactions (electrostat, liaison H, ionique) vont donner la structure secondaire = feuillets beta, hélica alpha.  [...] Je voulais ajouter et préciser que la structure secondaire concerne des acides aminés voisins sur la chaine polypeptique, alors que la structure tertiaire concerne des acides aminés plus éloignés (d'où un repliement important). (de plus toutes sortes de liaisons peuvent en fait amener à la formation de cette structure tertiaire.  [...]

[Biochimie] protéine

La structure secondaire ce sont les agencement réguliers et répetés des chaines polypeptiques grace à des liaisons hydrogènes entre différents acides aminées (ce qui donne naissance à 2 types de structure. hélicoïdale alpha (confère élasticitée) et feuillet plissé beta (confère rigidité).  [...] structure tertiaire est formée par les intéractions entre des acides aminées situés à différents endroits de la chaine polipeptidique (plus ou moins éloignés) via des liaisons de 5 types (hydrogène, ionique, van der waals, hydrophobe ou pont disulfure) (les pont disulfure sont des liaisons entre 2 atomes de soufres des chaines latérales de 2 acides aminés cystéines).  [...]

[Biochimie] protéine monomérique et une protéine polymérique

Bonjour, oui c'est la structure. une protéines polymérique est constituée d'un motif répété plusieurs fois. Une protéines dimèrique aura 2 fois ce motif, une protéine timérique aura 3 fois ce motif etc.  [...] A la base, une protéine est une longue chaine d'acides aminés (appelée polypeptide). Cette longue chaine peut se replier sur elle même pour que la protéine adopte une forme 3D. C'est cette forme en 3D qu'on appelle la structure tertiaire de la protéine. S'il s'agit d'une protéine monomérique, elle peut fonctionner telle quel (ou après quelques éventuelles modifications chimiques).  [...]

[Biologie Cellulaire] Structure des protéines

Je vois pas comment tu peux savoir quelle est l'orientation de chaque chaîne si tu n'as pas un minimum de formule semi-développée. S'ils sont pas très tordu, ils auront numéroté les acides aminés de façon habituelle c'est à dire du N vers le C terminal. Le 1 c'est donc N-terminal, le 21 et 30 c'est C terminal.  [...] La structure de base des protéines est un enchaînement de liaison covalente entre les acides aminés d'une même chaîne. Ici, on forme des liaisons covalentes entre des acides aminés de chaïnes primaire différente. Cela rentre en ligne de compte pour former les structure tertiaires des protéines surtout.  [...]

[Biologie Moléculaire] feuillet beta

je dispose d'un peptide sous forme d'une série d'acides aminés, on me demande de prédire l'éventuelle formation de feuillet B, comment procéder est-ce que le fait qu'il y est une succession d'aa chargés et hydrophobes au début suffit a prouver que c'est les 2 faces du feuillet.  [...] Je commencerais par essayer d'identifier les différents brins beta et les turns à partir de la séquence primaire. En effet tu as certains acides aminés qu'on retrouve d'avantage dans telle ou telle structure. Par exemple les régions glycine/sérine sont souvent non structurées (du fait de l'absence de chaine latérale pour l'une et du groupement hydoxyle de l'autre qui interagit très favorablement avec le solvant).  [...]

Ponts Disulfures

LEs ponts disulfures se forment effectivement entre 2 acides aminés cystéine qui possède un résidu -SH. La formation de cette liaison -S-S- va provoquer un repliement de la protéine et participer à la structure 3D de la protéine et donc à sa fonction. La liaison peut être intracaténaire (la meme chaine protéique) ou intercaténaire (entre 2 protéines ou polypeptides ex.  [...] l'insuline). Ces ponts ne se forment que en présence de cystéine, et il n'y en a que dans les chaines polypepidiques qui possèdent des cystéines sans leur structure primaire. (au moins 2). Est ce que la présence de 2 Cys entraine forcement une liaison disulfure Pas sure.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 4

22 acides aminés, auxquels s'ajoutent certains acides aminés exotiques qui résultent de remaniements a posteriori (après assemblage de la chaîne polypeptidique) d'acides aminés classiques. pour les bases azotées 5 fondamentales en effet plus des bases exotiques en particulier dans les ARNt.  [...] 22 acides aminés, auxquels s'ajoutent certains acides aminés exotiques qui résultent de remaniements a posteriori (après assemblage de la chaîne polypeptidique) d'acides aminés classiques.  [...]