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[Biochimie] solubilité des protéines

A basse concentration saline (salting in), les régions chargées des protéines en solution s'attirent ==. agrégation via les régions hydrophiles ==. basse solubilité.  [...] A concentration saline intermédiaire, les ions en solution vont casser les interactions entre régions hydrophiles de la protéine ==. la solubilité augmente.  [...]

[Biochimie] Definitions et propriétés

Ensuite j'aimerais que vous me confirmiez ou infirmiez une explication. Dans le cas de la propriété d'insolubilité des protéines en solution saline, j'ai marqué sur mon cours, plus on ajoute de sel moins la protéine aura d'affinité pour l'eau qui l'entoure donc si j'ai bien compris lorsque l'on ajoute du sel celui ci se lie préferentiellement à l'eau qui n'a plus de quoi faire des interactions avec les protéines qui deviennent insolubles c bien ca.  [...] En effet le phénomène que tu décris s'appelle le salting out. Toutes molécules nécessite (en solution aqueuse) des molécules d'eau pour leur solvatation. Lorsqu'on augmente fortement la concentration en sels, les ions vont s'accaparer les molécules d'eau et donc les protéines n'auront plus assez de molécules d'eau pour être sous forme soluble.  [...]

[Biologie Moléculaire] Petit point sur les interactions protéine-protéine

.. mé bon ca risque de prendre pas mal de tps... et du tps j en ai pas trop donc j'aimerais bien avoir un max de propositions si il y a plus simple pour pas trop cher tout en restant solide dans les resultats obtenus voila voila.. merci d'avance.   [...] As-tu la chance d'avoir ces deux protéines purifiées ou non Si non le double hybride est le plus facile, quoiqu'un peu simpliste (et pas forcément certains à 100%...), si tu as des protéines purifiées il existe pas mal de techniques intéressantes. Je t'en parlerai si tu le désire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Base de données interactions protéine-protéine ?

[Biologie Moléculaire] Base de données interactions protéine-protéine.  [...] Je cherche une base de données regroupant, pour une protéine donnée, tous ses partenaires protéiques répertoriés dans la littérature (toutes techniques confondues, et sans vouloir me taper PubMed à coup de keywords). Les base de données protéiques que je connais ne fournissent pas ce genre d'informations (elles sont axées sur la reconnaissance de domaines/motifsconservés, ou compilent des infos sur une famille de protéine, etc.).  [...]

[Biotechnologie] Global Analysis of Protein Activities using proteome chips

Son avantage majeur reste qu'il devient possible de tester rapidement et pour peu cher les interactions d'une protéine sur un quasi-protéome, même s'il faut confirmer les résultats après avec une autre technique, cela permet de réduire grandement le temps de recherche (et le nombre d'étudiant faisant du double hybride ).  [...] Et est ce que ils utilisent des techniques généralement utilisé en protéomique, quels sont leur noms (pour la création de la puce, pour l'interactions protéines-protéines, et pour l'interaction protéine lipides ).  [...]

[Biochimie] Diverse question

Quels types d'interactions interviennent dans la liaison entre une protéine et son ligand j'ai répondu que sont les interactions apolaire, non covalente, ioniques et les liaisons hydrogène.  [...] Ai-je répondu correctement à cette question. Quels types d'interactions interviennent dans la liaison entre une protéine et son ligand.  [...]

[Immunologie] Faire divorcer un couple Ag-Ac

Les interactions Ac-AG sont de nature électrostatiques non Une solution ionique ne pourrait-elle pas perturber ces interactions.  [...] Tu peux aussi regarder les manips où les auteurs effectuent une purification protéique par chromatogrtaphie d'affinité où la phase stationnaire est constituée de billes couplées à un anticorps dirigé contre la protéine d'intérêt. Généralement, ils utilisent la force ionique pour éluer la protéine.  [...]

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

J'ai notamment trouvé les interactions ligand-protéine (Vos & Martin, 2004), l'isomérisation cis-trans de la Rhodopsine (Peteanu et al., 1993. Rousse et al., 2001) et la réorganisation des liaisons hydrogène dans des solutions aqueuses (Lindenberg et al., 2005), qui sont tous de l'ordre de 10 -13 à 10 -14 seconde.  [...] En ce qui concerne les origines de la vie, je crois qu'une grande source potentielle de progrès sera l'étude de l'évolution des protéines et plus particulièrement des métalloenzymes, ainsi que la détermination de ce qu'on qualifie parfois de fossiles moléculaires.  [...]

[Biochimie] Comment synthetiser une peptide recombinant ?

Certains peptides sont très faciles à synthétiser chez la bactérie, d'autres pas (par exemple ceux nécessitant des modifications co ou post traductionnelles (encore que maintenant on fait n'importe quoi chez la bactérie, y compris lui faire inclure des AA non naturels ).   [...] Merci beaucoup pour ces remarques. Mais a propos du tag, ne serait-il pas envisageable de l'utiliser pour la purification, et, ayant aussi inséré un site de clivage, d'utiliser une protéase en vue de retirer le tag Par exemple un tag GST.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pull down GST

Personnellement j'utilisais environ 10-15µg de proteine de fusion GST (80kDa au total) couplées aux billes GST pour faire mes test d'intéractions.  [...] Ma protéine en fusion fait environ 95kDa... Les intéractions avec les partenaires on ne les connait pas car justement on essaye d'identifier des partenaires.  [...]