• Forum - Sites, Amorces, ADN

[Biologie Moléculaire] Comprendre les cartes des plasmides

Le promoteur est situé sur l'extrémité 5' du gène, en amont de la séquence à transcrire. C'est pour cela que quand tu vas couper et ajouter l'adn qui t'interesse tu vas avoir un sens A et B. Le sens a choisir est celui ou on va avoir l'extremité 5' du gène.  [...] La si tu veux retaper des sites de restriction, c'est trés utile et tu as également la Taq polymerase qui est une adn polymerase qui te sert a effectuer des PCR avec des amorces dans les deux cotés de chaque brin.  [...]

[Microbiologie] Gene

1) Cela veut dire que tu fais une PCR en utilisant l'ADN chromosomique de ta souche et des amorces qui reconnaissent deux sites spécifiques de ton gène X. A la fin de ta PCR tu fais migré le produit de ta PCR sur un gel d'agarose et si tu observe une bande (un amplicon, qui représente ton gène X ou une partie de celui-ci qui a été amplifié) cela veut dire que ton gène X est bien présent dans ton ADN chromosomique.  [...] 2) Blaster un gène, cela veut dire comparer la séquence nucléotidique de ton gène aux séquences nucléotidique de gènes présents dans une base de donnée. http.//blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast..._LOC=blasthome.   [...]

[Biologie Moléculaire] choix des amorces

Je sais qu'aujourd'hui, des sites sur internet permettent de calculer de choisir les amorces les plus adaptées au brin d'ADN qu'on veut dupliquer. Mais j'aimerai connaitre le raisonnement qu'il faut adopter quand on veut prévoir la séquence des amorces sens et anti sens.  [...] Il faut éviter surtout les séquences formant des structures secondaires (genre des tiges boucles). Enfin il faut faire attention a ce que les deux amorces choisies ne s'apparient pas entre elles, ni ailleurs dans le génome/plasmide (donc eviter les longues répétitions monotones de A, ou de C, ou de G, ou de T).  [...]

PCR clonage

Tu as calculé comment ton Tm pour tes amorces avec sites de restriction Tu as peut être tout simplement un problème d'hybridation de tes amorces à cause d'un Tm inapproprié.  [...] mes amorces sont identiques, a part les sites de restcriction, c'est pr ca que les Tm sont élevé, mais est ce que je devais reduire de mes amorces pr que j'aie une Tm convenable.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication de l'ADN chez les eucaryotes SOS

n'a pas la fonction de changeur d'amorces On est bien d'accord que meme si sur les grands axes (bidirectionnelle, antiparallèle, nécessite des amorces, complémentaire, sens 5'3') la réplication de l'ADN des eucar. n'est pas la meme véritablement, surtout au niveau des enzymes utilisées, que celle des procar.  [...] En plus clair la dernière question correspond au fait que dans la synthèse d'ADN chez les procaryotes l'exonucléase 5'3' n'a que la fonction de dégrader les amorces d'ARN et c'est l'ADN pol I qui les synthétisent en amorces d'ADN (d'après mon cours), donc ce que je voudrais savoir si en fait ma pensée est juste.  [...]

[Biologie Cellulaire] Quelle est la définition de la vie ? - Page 2

Alors si un virus est vivant, quand est-il de mes fragments d'ADN que je mélange avec l'ADN polymérase et des amorces pour faire ma PCR.  [...] Enfin, je précise que les virus, ce sont des acides nucléiques (ADN ou ARN) et une capside (avec parfois un tégument et une enveloppe).  [...]

[Biologie Moléculaire] Besoin d'une confirmation sur la réplication

Les gros cercles jaunes représentent l'ADN poly delta,je voulais juste que vous me confirmiez que les ADN poly qui reprennent la réplication à partir des amorces brins retardés sont bien à chaque fois de nouvelles ADN poly présentent dans le milieu. en gros y en a une qui commence la réplication à partir de l'amorce située sur le site d'initiation,celle-ci effectura une réplication directe,puis il y en a une seconde qui reprend la réplication à partir de l'amorce qui va dans le même sens que la première(de 3' à 5') etc.  [...] Je ne sais pas si je suis claire,mais j'ai cru voir sur un site que l'ADN pol delta coulissait le long du brin matrice en sens inverse pour compléter les trous.  [...]

[Génétique] Extraction, purification et analyse d'ARN (Nanodrop et bioanalyser)

Voilà, je me demandais si on utilisait des amorces ADN Dans le cas où on utilisait des amorces ARN, il faudrait les dégrader et les substituer par de l'ADN La Taq pourrait-elle faire cela.  [...] Pour les PCR classiques on utilise toujours des amorces ADN. C'est plus facile a synthétiser et a manipuler. In vivo pour la réplication il y a synthese d'amorces ARN par la primase qui sont ensuite remplacées par de l'ADN mais en PCR il n'y a pas de raison.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN Polymérase alpha delta epsilon

L'ADN pol alpha peut synthétiser les amorces ARN (primer) et les allonger sur le brin à synthèse discontinue de l'ADN naissant. Pour le brin à synthèse continue le complexe ADN polymérase delta/PCNA synthétise le brin d'ADN.  [...] Les amorces ARN sont supprimées par la RNAse H, les trous seront remplis par béta ou alpha. L'ADN ligase va lier les fragments.  [...]

[Biologie végétale] pcr : LP/RP et LB/RP pour une plante

Je m'arrête là dans mon blabla et te propose ce schéma qui illustre les trois possibilités de génotype pour ta plante et ce qu'il se passe pour chacune selon les amorces. Tu me dis si tout ça prend du sens.  [...] Les amorces sont des bouts d'ADN fabriqués artificiellement avec une certaine séquence que l'on choisit. Pour une PCR donnée, on utilise deux amorces, une pour délimiter le début de la région d'ADN échantillon à étudier, et l'autre pour marquer la fin. Tu choisis la séquence de chacun de tes amorces pour viser la séquence d'intérêt (en respectant A avec T, et G avec C).  [...]