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modélisation

je cherche un site web ou qqu documents concernant la modélisation des fermentations.  [...]

[Biochimie] Site web interactif de modélisation des cinétiques enzymatiques et détermination des constantes

Les cinétiques enzymatiques ne suivent pas toujours le modèle de Michaelis-Menten. Les modèles cinétiques sont parfois très complexes avec des interactions multiples entre enzymes, substrats, inhibiteurs, modulateurs, à tel point qu'il n'est pas toujours possible de trouver les solutions analytiques décrivant l'évolution des composants du système.   [...] Il permet de construire le modèle cinétique, trouver le système d'équations différentielles qui décrit le modèle, et fitter (régression) des données expérimentales pour retrouver les paramètres du modèle (constantes cinétiques, concentrations des composants...).   [...]

Criblage virtuel et "docking"

Pour l'alignement j'arrive a le faire sur Pymol donc pas de probleme, mais merci quand meme. Le docking c'est la modelisation des interactions entre de petites molecules et une proteine cible. ca permet par exemple de trouver des drogues pouvant potentiellement bloquer l'activité d'une proteine car cette molecule se fixerait au site actif de la proteine.  [...] Le docking c'est la modelisation des interactions entre de petites molecules et une proteine cible. ca permet par exemple de trouver des drogues pouvant potentiellement bloquer l'activité d'une proteine car cette molecule se fixerait au site actif de la proteine.  [...]

Intégration de VIH-1 dans la chromatine: la chute d'un dogme.

Autre chose, avez-vous réalisé une étude de modélisation moléculaire afin de visualiser le site d'interaction putatif entre l'intégrase et INI1 Si c'est le cas, cette interaction masque-t-elle un site nécessaire à la fonction de l'intégrase Pour aller au bout de mon idée, je me dis que si cette interaction perturbe la fonction de l'intégrase, un peptide compétiteur d'INI1 pourrait agir en même temps comme inhibiteur de l'intégrase.  [...] Pour ce qui est des modélisation, c'est assez juvénile car on vient juste d'avoir une structure d'une forme active entière d'intégrase (pas de VIH en plus) retrovirale. L'intégrase VIH est un casse tête pour les structuralistes/cristallographes.  [...]

effets stroboscopiques

Ce serait plutôt le thème de la modélisation de ce phénomène qui m'intéresse mais une source anatomique ou physiologique est toujours utile.  [...] J'y ai trouvé des résumés de faits, de modélisation et de lois découvertes. En revanche, ça reste dans le vague. ESt-ce parce que je n'ai pas suffisament fouillé dans les options ou juste parce que c'est simplement ce que présente ce site.  [...]

Réseaux de neurones

C'est en réalité ce trait qui fait que ce type de modélisation se raproche de certains comportements biologiques (comme les courbes d'apprentissage ou la robustesse aux destructions randomisées). Alors pour le perceptron je dirais plutôt que le seul point commun est.  [...] Personnellement, je trouve que l'analogie entre réseaux artificiels et biologie n'est pas tellement dans le fonctionnement des automates, mais plutôt dans le fait que le traitement de l'information se fait de façon distribuée et parallèle. C'est en réalité ce trait qui fait que ce type de modélisation se raproche de certains comportements biologiques (comme les courbes d'apprentissage ou la robustesse aux destructions randomisées).  [...]

[statistique] Analyse de survie

Le probleme est que le model de Cox semble faire une modelisation de mes donnees car je trouve la courbe tres tres lisse pour mes trois genotypes (pour un marqueur donne). Comme si a chaque incrementation, meme si le nombre de survivants ne change pas, SPSS (pour ne pas le nommer) faisait une estimation de ce que cela donnerait avec plus de donnees.  [...] Oui le modèle de Cox c'est bien de la modélisation. il essaie de calculer la probabilité de mortalité à chaque pas de temps à partir de tes données, selon ton génotype (cf. la barbare formule que tu trouveras dans la documentation).  [...]

[Divers] Bioinformatique

Si je peux me permettre, la bioinfo ne se résume pas à écrire des softs ou à en utiliser (ce que tu semble sous entendre). En modélisation par exemple, il y a des raisonnements particuliers et, c'est plutot ta vision des choses que je trouve réductrice.  [...] Euh, non. tu fais un amalgame entre la modélisation en tant que domaine général (très lié au maths d'ailleurs) et ses applications en bio. Drug design n'est qu'une thématique parmi d'autres et se servir d'outils bioinformatiques spécialement conçus pour (ie, adéquats) n'en fait pas un domaine scientifique au même titre que la modélisation tout court.  [...]

[orientation] Avenir de la Bioinformatique

En vrac, on peut désigner les bases de données en génome, transcriptome, protéome, métabolisme, divers (lipides, surces, etc...). les outils de traitement de ces bases de données et de comparaisons (FASTA, BLAST...), la phylogénie, les modélisateurs à partir de données cristallographiques ou RMN (Pymol, Swiss Pdb Viewer), les systèmes de calculs d'énergie en modélisation moléculaire, les pr évisions de structure, de domaines, voire plus.  [...] En vrac, on peut désigner les bases de données en génome, transcriptome, protéome, métabolisme, divers (lipides, surces, etc...). les outils de traitement de ces bases de données et de comparaisons (FASTA, BLAST...), la phylogénie, les modélisateurs à partir de données cristallographiques ou RMN (Pymol, Swiss Pdb Viewer), les systèmes de calculs d'énergie en modélisation moléculaire, les prévisions de structure, de domaines, voire plus.  [...]

[Biochimie] culture de bacterie peste

Il est formellement interdit de manipuler des souches biologiques en dehors du stade de manipulation minimal qui leur est attribué. Yersinia pestis se manipule dans des laboratoires type P3. Il existe probablement des modèles d'étude de la peste non pathogènes.   [...] Les modeles d'etudes non pathogenes sont Yersinia pseudotuberculosis (tres tres proche de pestis mais sans les plasmides de virulence) voire meme une Y. pseudotuberculosis ou l'ilot de pathogenicite HPI a ete delete.   [...]