• Forum - Site, Fixation, Facteurs

[Biologie Cellulaire] Promoteur/ site de fixation de ARN polymérase / site d'initiation de la transcription

... Chez les Eucaryotes, sur le promoteur un peu avant le gène, tu as généralement une TATA box (après elle peut être absente et on aura la présence d'un autre boîte ailleurs sur le promoteur, je ne rentre pas trop dans le détail). Sur cette TATA box viendra se fixer des facteurs généraux de la transcription (TFIIA, B, D, F, E et H) nécessaires à la fixation de l'ARN polymérase et à la coupure du brin d'ADN pour initier la transcription.  [...] - http.//www.snv.jussieu.fr/vie/dossie...nscription.htm ce lien te montre un peu plus en détail le site de fixation de la polymérase et les facteurs mis en jeu pour cela.  [...]

[Génétique] Contrôle de l'expression génétique

IRES. internal ribosomal entry site. C'est à dire que c'est une séquence permettant la fixation du ribosome en plein milieu de la séquence codant la protéine. Le principe (peut-être a-t-il évolué) de l'initiation de la traduction est que le ribosome reconnait l'extrémité 5' de l'ARNm et va progresser sur la partie 5' UTR jusqu'à ce qu'il rencontre le codon d'initiation.  [...] Au niveau de la transcription là aussi il y a d'autres facteurs entrant en jeu. promoteur alternatif (le point +1 change), site de polyadénylation alternatif. La longueur de la queue polyA va définir la demi-vie d'un ARNm (les polyA-BP qui se fixe dessus ont une dynamique de fixation-libération, quand elle libère, les exonucléases cytosoliques grignotent la queue polyA, plus elle est longue plus la demi-vie l'est aussi).  [...]

[Biologie Cellulaire] Effet des éléments de réponse

Au delà de la multiplicité du signal d'activation, la présence de plusieurs facteurs de transcription sur un promoteur augmente aussi le nombre d'interactions protéiques et la formation de complexes transcriptionnels plus stables. Dans le cas que tu énonces des récepteurs nucléaires (RN), la particularité est que le RN lié à son élément de réponse sera soit activateur, soit inhibiteur de la transcription selon la nature du ligand fixé et/ou selon s'il est sous forme holo ou apo (non lié ou lié à un ligand).  [...] Je m'explique. la fixation de certains facteurs peut être une condition indispensable à l'expression d'un gène, mais pas forcément suffisante, dans ce cas c'est plus un effet permissif. Dans d'autres cas, la liaison de certains facteurs favorise ou empêche la fixation d'autres facteurs soit sur les mêmes sites (certains éléments consensus sont des sites de liaisons de nombreux facteurs), soit sur des sites voisins.  [...]

[Biologie Moléculaire] Résumer Génétique (absurde)

Pour aider à cette fixation de la polymèrase ce sont le séquences situées avant le gène codant qui sont importante. les promoteurs et les enhancers. Ces séquences peuvent nécessité la présence de facteurs de transcriptions et/ou de molécules de réplication pour permettre le fonctionnement.  [...] Non je n'ai pas fais d'erreur, le site d'initiation est bien la TATA box, je n'ai pas précisé qu'elle était située géographiquement dans le promoteur mais il ne s'agit pas vraiment d'une séquence promotrice (sous entendu d'un lieux de fixation de facteurs de transcription).  [...]

[Biochimie] enzymologie

-une autre question s'agit de l'inhibition compétitive, les 2 sites de fixation de substrat et d'ihnibiteur presente une analogie structurale, et il ya un seul site actif de fixation soit il est occupé par l'I ou le Sub, mais en regardant les model de fixation des 2 ligants on trouve parmis eux celui d'encombrement stérique.  [...] La fixation de l'inhibiteur provoque un changement de conformation de l'enzyme et la rend inactive ou modifie le site de fixation du substrat ce qui empêche la réaction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Généralité génétiques(ADN,gène,chromosome s..)

Pour ce qui est des parties codantes et non codantes, le sujet est assez récent (dans le sens finalement on ne sait pas grand chose). On constate juste qu'en effet une très grande partie du génome des animaux et plantes supérieurs (entendez par là apparuent plus tard dans l'évolution) est non codante et que certains effets de régulation leur sont aussi associés.   [...] Au fait, l'ADN n'est pas une simple molécule d'acide désoxyribonucléique + les nucléosomes. ADN est l'abréviation d' a cide d ésoxyribo n ucléique, et les nucléosomes sont des complexes de protéines histones sur lesquels s'enroule l'ADN pour se compacter.   [...]

[Biologie Moléculaire] Le transfert de la f-Met de son ARNtf-met

*puis la sous-unité 50S avance d'un cran sur l'ARNm et l'ARNtf-Met vient occupé le site P de 30S et nous savons bien que l'ARN de transfert occupe le site E et puis comment la sous unité 30s comprend un site de fixation P au lieu de dire qu'elle occupe un site de fixatin de l'ARNm.  [...] Alors comment ils changés le rôle de fixation pendant l'élongation pour que le site A est occupé par le peptidyl et le site P est occupé par l'ARNtf-Met.qu'est ce qu'il a changé.  [...]

[Biologie Moléculaire] Acétylation/méthylation des histones

Les forces d'interaction entre histones et ADN diminuent et la suite est logique. la chromatine se relâche et libère ainsi des sites de fixation pour des facteurs de transcription notamment.  [...] Et plutôt que de donner des réponses trop évasives, je préfère compléter tes interrogations par les miennes. quel est l'ordre de temps de la régulation de la transcription (alternance de différentes modifications des nucléosomes) et quels sont les acteurs cellulaires qui contribuent à le définir et à le limiter Qu'en est-il du code des histones Est-il parfaitement compris et permet-il de mettre précisément en relation modifications post-traductionnelles et état chromatinien.   [...]

[Biologie Cellulaire] Inhibiteurs compétitif / non compétitifs

Et une autre petite question au passage. Comment se nomme le site de fixation entre le neurotransmetteur et le récepteur (je sais que lorsqu'il est question d'une activité enzymatique cela s'appelle le site actif mais je crois que ce terme n'est pas approprié dans le cas du neurotransmetteur et de son récepteur).  [...] Lorsque l'imidaclopride prend la place de l'Ach vous dites qu'il y a suractivation. Cela veut il dire que pr toute molécule se fixant au niveau du site de fixation le récepteur agira de la même façon qu'avec son neurotransmetteur original (ici une dépolarisation de la membrane dc la naissance d'un potentiel d'action).  [...]

[Biochimie] Agoniste

Ligant antagoniste. se fixe au même site mais pas de changement de la conformation du récepteur, donc ça induit pas de signal intracellulaire. Il diminue la réponse de l'agoniste en empechant la fixation du ligant agoniste sur le récepteur.  [...] Pour l'agoniste partiel, il s'agit en fait de n'activer qu'un site du recepteur (ici µ). Cette fixation empêchant la fixation d'un agoniste pur qui activerait les deux sites, l'agoniste partiel joue donc le rôle d'antagoniste (aucune activation du site K).  [...]