• Forum - Sillon, Structure, ADN

[Biologie Moléculaire] structure secondaire de l'adn

La forme B de l'ADN est la forme physiologique. On peut observer la formation d'un petit et d'un grand sillon dû au fait que les liaisons N-glycosiliques ne sont pas diametralement opposée au sein d'une paire de base ce qui cré un espace plus grand (grand sillon) et plus petit (petit sillon).  [...] Les protéines devant intéragir avec l'ADN se dirigent principalement vers les grands sillons (mais peuvent aussi atteindre les petits) et créent des liaisons hydrogènes à partir des groupements donneurs et receveurs de liaison H sur les bases.  [...]

[Génétique] Sillon Majeur et mineur?

Je commence presentement mon baccalaureat en sciences biologiques a Montreal et nous venons d'aborder le sujet de la structure de l'ADN.  [...] J'ai de la difficulte a comprendre la difference entre le sillon majeur et le sillon mineur de la structure de l'ADN. Ce que j'avais cru comprendre.  [...]

[Génétique] sillons de l'ADN

j'ai un souci pour comprendre qu'est ce que le grand et petit sillon, en fait j'ai beau chercher, voir des images, mais mon idée reste confuse, car certains document les indiquent sur l'enchaînement des paires de bases de L'ADN (sa structure en double hélice), tandis que d'autres indiquent sur les liaisons entre bases azotées appareillées, pourriez vous m'expliciter comment des de l'enchaînement des pdb se forment ces deux sillons.  [...] Pour comprendre pourquoi il y a un petit et un grand sillon sur la double hélice d'ADN, une petite réponse en image. Les bases azotées d'un des deux brins de la double hélice sont reliées entre elles par une chaîne sucre-phosphate (qu'on ne voit pas sur cette image) entre le 5'OH et le 3' phosphate des nucléotides.  [...]

[Divers] [biologie du developpement] développement des membres

Ils présentent encore, et c'est logique, des anomalies de la notochorde (ou encore corde), structure mésodermique transitoire, centre inducteur du système nerveux central. Ainsi la mutation Brachyury (et donc la protéine qui fut identifiée plus tardivement (Herrmann et al Nature 1990 Vol 343.  [...] Ils présentent encore, et c'est logique, des anomalies de la notochorde (ou encore corde), structure mésodermique transitoire, centre inducteur du système nerveux central.  [...]

[Biologie Cellulaire] Duplication de l'ADN en phase S

Selon la composition du milieu extérieur, en particulier le pourcentage d'eau lié aux phosphates hydrophiles, la cristallisation de l'ADN donne lieu à trois structures.  [...] * ADN-Z. son action et son rôle sont inconnus. C'est une hélice gauche. Il est caractérisé par des plateaux peu inclinés (9° à peu près), et une position alternative des sucres en radiale et tangentielle (ainsi qu'une alternance 3'endo syn/5'endo anti). L'axe passe par le petit sillon et présente 12 paires de bases par tour soit 30° entre chaque sucre.  [...]

petit sillon

Le petit sillon, par rapport au grand sillon, a une configuration spatiale très étroite. Et dans le grand sillon, les atomes nucléophiles des bases puriques sont très bien exposées vers l'extérieur. Ceci facilite la liaison (liaisons hydrogène) à d'autres protéines, donc à des enzymes.  [...] Ceci étant, petit sillon ou grand, la réparation avec resynthèse nécessite un déroulement de l'ADN, donc il n'y a pas plus de grand ou de petit sillon.  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules

Je ne suis pas certain que cette mise en relation entre l'ADN et l'évolution soit bienvenue. Je ne pense pas qu'il y ait une quelconque pression de sélection sur la structure de l'ADN, de la même manière qu'il n'y en a pas sur la structure des acides aminés.  [...] Par contre je me permet d'imaginer que l'ADN ai pu être sélectionné pour sa structure, stable et pleine de possibilités (regulationnelles entre autre...) parmi d'autres molécules informationnelles.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Il s'agit d'une structure 3D où vient se nicher l'ADN assez souvent. Cela résoudrait ton problème de variabilité au sein de la séquence TATA-box, Didie.  [...] C'est une histoire de configuration spatial de la proteine (structure quaternaire) et de la disposition dans l'espace de la séquence d'ADN qui est n'est pas linéaire ainsi la tata box qui est en amont est pourtant proche spacialement parlent du site d'initiation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Adn...

- J'ai rencontré les appellations ‘ sillons majeurs et sillons mineurs ' pour les brins d'ADN mais je n'ai pas compris ce qu'elles signifiaient et je ne trouve pas l'info sur internet….  [...] la double hélice d'ADN n'est pas aussi régulière dans ses spirales qu'un macaroni, elle alterne régulièrement un grand sillon et un petit sillon. Dit autrement, elle fait une torsion, tout de suite apres une autre torsion (c'est le petit sillon), un peu plus loin elle refait une torsion (c'est le grand sillon), puis elle recommance, tout de suite apres petite torsion, puis un peu plus loin, puis tout de suite apres,  [...]

Eléments régulateurs et activateurs:

Si vous prenez par exemple un motif de liaison a l'ADN Helix-Turn-helix, le principe est que l'helice 1 se place au dessus du sillon majeur et cree des contacts avec le squelette phosphate et la deuxieme helice s'insere dans le sillon majeur pour creer des contacts specifiques.  [...] Le plus souvent les sequences de fixation sont repetees inversees avec une distance plus ou moins longue entre les sequences RI parce que la proteine (ou le complexe proteique ) amene 2 motifs HTH, il faut donc 2 sillons majeurs identiques. Le premier se trouve sur le brin codant, le deuxieme sur le brin non codant.  [...]