• Forum - Séquences, Traduction, Protéines

[Biologie Moléculaire] Transgene????

mais quand j'ai cherché sur le caractere commun entre eux j'ai trouvé qu'ils doivent avoir des séquences nécéssaire pour leur traduction en proteines recombinantes, c'est séquences là sont site d'initiation et de terminaison de la traduction bien sur,  [...] Ce type de séquence est présent un peu partout, mais il ne suffit pas qu'il y en ait. il faut qu'elles soient bien placées pour que les gènes insérés s'expriment. Elles font partie de la construction.  [...]

[Bioinformatique] Analyse d'un transcriptome pour déterminer les protéines sécrétées

Nous avons séquencé le transcriptome de glande salivaire d'une espèce d'insecte. J'aimerais déterminer quelles protéines sont codées par ces transcrits et si ces protéines sont secrétées. Voici les différentes étapes que je compte faire pour mon analyse.  [...] Ma question que je me pose n'est-il pas mieux que je fasses la traduction dès le début, puis faire un blastp sur les séquences protéiques traduites, car peut-être que la traduction en séquence protéique ne donne pas du tout le même résultat que le blastx.  [...]

[Biologie Cellulaire] séquences d'initiation transcription/traduction

[Biologie Cellulaire] séquences d'initiation transcription/traduction.  [...] je me mélange un peu les pinceaux entre les séquences d'initiation de la traduction,celles de la transcription et leurs différentes séquences consensus.Est ce que quelqu'un peut me faire un petit récaitulatif s'il vous plait ca m'aiderait bcp a y voir plus clair.  [...]

[Biologie Moléculaire] Epissage et épissage altérnatif

3-On peut trouver des séquences polyA (séquence de résidus adénine qui protège l'ARNm des exonucléases) à l'intérieur de l'ARNm en plus de la séquence polyA que l'on trouve à l'extrémité 3' de l'ARNm. Selon la séquence polyA qui sera coupé avant traduction, on aura donc des protéines traduites différentes. '''''.  [...] Mais sachant que tu as un gène, tu auras un transcrit primaire, et après ce transcrit primaire, sera convertit en pré-ARN (le principal changement étant le changement de thymine par de l'uracile), et à partir de celui là, différents épissages possibles, d'abord en fonction des exons, et ensuite selon différents promoteurs qui possèdent des affinités particulières avec certaines protéines traductionnelles etc.  [...]

[Biologie Cellulaire] proteine caryophile

pourriez vous me donner une définition de proteine caryophile J'ai cherché sur google mais je n'ai rien trouvet.  [...] Les protéines caryophiles sont des protéines qui sont présentes et actives dans le noyau. Pour cela elles ont besoin d'être redirigée au niveau du noyau après leur traduction dans le cytoplasme par le biais d'un NLS (nuclear localization sequence).  [...]

[Biologie Moléculaire] Phase de lecture

Bonjour à tous. Il y a un petit truc que je ne comprends pas trop... une délection de 3 pb dans un exon change t'elle la phase de lecture et d'un intron je ne comprends pas bien cette histoire de phase de lecture, quelqu'un peu t'il m'éclairer Merciii beaucoup.   [...] non, ca ne change pas la phase de lecture. Ca va enlever un acide aminé à la séquence protéique, mais une délétion d'1 ou 2 paires de bases aurait tout décalé, du fait que la traduction fonctionne à base d'unités de 3 nucléotides (codons). Dans un intron, vu que ce sont les séquences à la limite exon-intron qui sont importantes pour l'excision et l'épissage, une délétion de quelques bases a de fortes chances de ne rien faire du tout (sauf cas de régulation par des séquences introniques).  [...]

[Biologie Moléculaire] exercice sur la traduction et la biosynthese des protéines

les deux protéines ont la même séquence NH2 terminale. Le début de la traduction est donc identique pour ces deux protéines.  [...] Il a été montré que la séquence CAA UAG CAA UUA, également conservée dans d'autres virus de plantes (cf. ci-dessous), était suffisante pour promouvoir 5% de traduction du codon stop mesuré avec un système rapporteur dans des protoplastes de tabac (Skuzeski et al. 1990).  [...]

[Evolution] Poule ou l'oeuf ... - Page 2

Extremement peu de genes sont universellement conservé, si on prends tout les génomes séquencés, il y a entre 50 et 80 genes conservé dans le vivant (suivant la méthodologie utilisée). L'essentiel de ces genes codent pour des produits impliqués dans la traduction (protéine ribosomale par ex.  [...] Les gènes architectes et tout le toutim, je doute fort qu'ils ne soient pas soumis à la sélection. Ça ne veut pas dire qu'ils ne peuvent pas se modifier, ça veut dire que toutes leurs modifications n'ont pas les mêmes conséquences sur la fitness de l'individu qui les porte.  [...]

ADN traduit - Page 2

Par contre, imaginons que la polymérase délire et qu'elle prenne pour ADN matrice le brin codant, alors la séquence de l'ARN obtenu serait celle du brin matrice, pas du tout la bonne. La séquence ne correspondrait pas du tout à la protéine censée être traduite.  [...] Non car ces sequences correspondent au brin dit codant =. brin non transcrit. DOnc dans ces cas il suffit de remplacer T par U. Il est interessant de noter que la difference entre les deux sequences soit justement la presence d'un codon TGA au lieu de CGA. CA n'est surement pas un hasard.  [...]

[Divers] Codon start dans un promoteur de gène

Il faut que tu vérifies sur la séquence si cet ATG initie une séquence codante suffisamment longue (et éventuellement que le produit de cet séquence codante corresponde à une protéine déjà décrite) et si elle est précédée de séquences connues pour initier la traduction (Séquence de Kozak ou Shine Dalgarno).  [...] Cependant, en effet, la séquence ATG est un des 64 codons, et outre sa capacité initier la traduction, il permet également à l'intérieur de plusieurs séquences de coder pour un a.a bien précis. la methionine.  [...]