• Forum - Séquences, Sens, Hypothèse

Système Cre/Lox et transposons

Par exemple, si deux transposons sont orientés dans le même sens, on peut avoir une recombinaison ectopique qui élimine une des 2 copie du transposon... Il se passe exactement la même chose avec le système Cre/Lox. si une séquence est entourée de 2 sites Lox P orientés dans le même sens, et si on ajoute la recombinase, on va obtenir la délétion de la séquence entre les 2 sites Lox P (c'est d'ailleurs un système d'expression inductible très utilisé en recherche).  [...] T'as regardé sur pubmed Le système Cre/Lox étant issu de bactériophages, peut-être chercher aussi vers cette direction. Ou sinon essaie de faire des comparaisons de séquences dans le sens de ton hypothèse, tu es peut-être sur la voie de quelque chose d'intéressant.  [...]

[Biologie Moléculaire] Amorce Sens et Anti-sens

Après un séquençage, les deux séquences obtenues sont représentées l'une en dessous de l'autre pour l'alignement avec une séquence de référence.  [...] lors du séquencage, si tu sequences dans les deux sens, tu auras la composition du brin sens (5'-. 3') et du brin antisens (5'-. 3'), et sur l'un des 2 le reverse complémentaire à été fait afin afin d'avoir 2x le brin sens et de comparer les deux séquences par un alignement classique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Anti -sens ???

Bonjour tout le monde. Au niveau des brins d'ADN, que veut dire la notion d'anti sens. j'ai 2 séquences d'ADN,on me dit que l'une est sens 5'-. 3' et l'autre séquence est anti-sens 5'-. 3' sachant que les 2 séquences ne sont pas complémentaires...merci.  [...] Alors alors je crois avoir la réponse...Par exemple, dans la PCR, les brins sens et anti sens sont utiliser comme des amorces...ils ont pour rôle de cibler la séquence d'interêt (qu'on souhaite amplifier), par conséquent, ils ne sont en aucun cas complémentaires c'est d'ailleurs un critére de choix.  [...]

[Biologie Moléculaire] Clonage avec plasmide

Les sites de restrictions sont en fait des séquences consensus dites palindromiques qui sont donc identiques dans le sens 3'-5' et 5'-3'. Ces séquences soont reconnues par des enzymes particulières très souvent d'origine bactériennes (EcoR1, EcoR5, BamH1...).  [...] Les amorces sont des oligonucléotides (en général environ 20nt), qui permettent d'encadrer sur les deux brins 5'3' et 3'5' la séquence que l'on veut amplifier. Ce sont donc des amorces qui permettent de donner un substrat de base à partir du quel les polymérases penvent continuer à générer des brins complémentaires d'amplification.  [...]

[Biologie Moléculaire] Traduction et transcription

Il y a cet outil qui traduit automatiquement les séquences d'ADN et d'ARN en protéines. Très simple d'utilisation, vous remarquerez qu'il donne 6 cadres de lecture car il lit les séquences dans les deux sens.  [...] w je pense que j'ai compris ce qu'elle veut dire part cette sequence est au milieu d'arn messager qui code pour une grande proteine ça veut dire qu'il ne doit pas avoir de codant stop peu etre.  [...]

[Biologie Moléculaire] Knock-down

J'hésite entre anti-sens et RNAi, mais les séquences d'antisens pour mon gène d'intérêt ont déjà été publiées. Donc je pencherai plutôt pour cette solution.  [...] Et pour ce qui est de l'anti-sens c'est un petit peu moins efficace que les siRNA. Tu peux acheter des siRNA spécifiques de ton gène même si ces séquences ne sont pas publiées. Par exemple chez QIAGEN tu as quasiment toujours 4 siRNA différents par gène, et pour les gènes très étudiées tu peux même avoir un siRNA validé.  [...]

mesure de l'expression d'un gene

d'ailleurs la PCR quantitative est plus fine que le run-ON et je suis d'accord avec les objections d'Igothigh, n'etant pas dans des conditions physiologiques le taux obtenus n'aura aucun sens biologique. D'ailleurs si tu utilises le promoteur natif du gene comment compte tu faire ton run-on sans purifier la polymerase et les proteines accessoires necessaires.  [...] Je ne peux pas utiliser de système rapporteur, car je veux étudier un couple d'ARN sens et antisens dont les sequences se chevauchent. Ce n'est pas la force des promoteurs qui m'intéresse, mais la transcription de l'un par rappport a l'autre, et peut etre l'effet de l'anti-sens sur le sens.  [...]

Manipulations génétiques

Ce qu'on maîtrise le plus à mon sens, c'est le découpage de longues séquences et leur recombinaison (technique de l'ADN recombinant). Mais n'oublions pas que si on a séquencé entièrement le génôme d'une bonne poignée d'organismes maintenant, on ne sait pas pour autant à quoi toutes ces séquences correspondent.  [...] Bon, on est à fond sur d'hypothétiques humains génétiquement modifiés. mais pour élargir le sujet, les OGM en général ( organismes génétiquement modifiés ) rendent pas mal de bon services déjà. outils de recherche, production d'insuline, solutions de dépollution des sols.  [...]

[Biologie Moléculaire] DNA MAN et Chromas

lorsque par exemple je prend les deux séquences sens et antisens d'un produit PCR pour obtenir des chevauchements par le logiciel DNA MAN je trouve que la séquence antisens représentée puis les deux avec les chevauchements puis seulement la séquence sens en fin.  [...] normalement les deux séquences sens et antisens ont la meme taille donc il ne faut pas avoir ces parties à droite et à guauche.  [...]

Caractéristiques des promoteurs, transcrits...

. J'ai déjà mis un identifiant et la sequence, mais ça ne suffit pas, il faudrait rajouter d'autres caractéristiques. Des suggestions Si vous avez d'autres idées de table, n'hésitez pas.  [...] Vous faut il les caractéristiques générales d'un promoteur ou les caractéristiques d'un promoteur particulier Un promoteur bactérien ou eucaryote Un promoteur pris au sens strict (promoteur minimum) ou au sens large (séquences régulatrices types enhancer, silencer).  [...]