• Forum - Séquences, Protéines, Fusion

physiologie du cancer

- mutation sur un suppresseur de tumeur. c'est une inactivation de protéines essentielles à l'homéostasie, à la maintenance cellulaire. En effet certaines protéines ont pour rôle de réparer les erreurs/mutations pouvant survenir au niveau de l'ADN, ainsi une altération de ces protéines peut avoir des conséquences désastreuses.  [...] Les translocations sont des évènements cytogénétiques qui peuvent avoir plusieurs conséquences. On peut par exemple avoir formation d'une protéine de fusion (fonctionelle) après cassure dans 2 gènes différents et raboutement de ces 2 séquences. Ces protéines de fusions peuvent alors acquérir des propriétés que ne possédaient aucune des 2 protéines séparémment.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéine de fusion

En fait on utilise ces protéines de fusion pour faciliter la purification de la protéine et son couplage ultérieur à autre chose pour de la vectorisation. En général c'est juste le domaine Fc qui est pris dans la protéine de fusion, si tu veux en savoir plus envoie moi un MP.  [...] Mettre une séquence IRES entre les deux ADNc revient à faire un ARNm bicistronique en effet, donc un ARNm de fusion si on veut, mais deux protéines bien distinctes après traduction.  [...]

[Biochimie] Empreinte à la DNase+ TAMOXIFENE

Tout d'abord je ne suis pas totalement sure d'avoir compri comment on detecte une sequence ENHANCER ou SILENCER par la DNASE footing prints. Dapres mes notes les regions ENhancers ont beaucoup de Proteines regulatrices donc sont peu accessible a la DNASE, qui donc ne coupe pas cette sequence.  [...] Sans tamoxifène, la protéine de fusion cre-dllER est séquestrée dans le cytoplasme par des chaperonnes (HSP70). Lorsque l'on ajoute le tamoxifène, le DLL change de conformation, libère les chaperonnes et la protéine de fusion peut entrer dans le noyau et exciser la portion d'ADN comprise entre les séquences LoxP.  [...]

cadres de lecture et codon start

Une protéine-fusion gag-pol est donc produite (en fait, les séquences gag et pol codent elles-mêmes pour des polyprotéines qui sont clivées par une protéase après traduction).  [...] Cette erreur produite dans 5% des cas a son importance biologique puisqu'elle permet d'assurer une certaine stoechiométrie entre les protéines (structurales) de capside, nécessaires en grande quantité, et les protéines non strucurales codées par pol, nécessaires en quantités catalytiques (ce sont des enzymes).  [...]

[Biotechnologie] purification d'une protéine

Là est le problème...Je ne comprend pas par quelle téchnique on peut purifier cette protéine dont on connait uniquement la séquence... peut-on purifier la protéine grâce aux résultats obtenues dans les différentes expériences.  [...] Je ne suis pas du tout experte en purification de protéines mais en lisant les différentes étapes de la manip je me dis qu'en insérant la séquence codante pour la ligase dans E. coli, ils ont peut être en même temps créé une protéine de fusion avec une étiquette (par exemple GST ou Tag) et ont pu ensuite purifier cette protéine de fusion sur une colonne d'affinité.  [...]

[Biochimie] formulation inconnue

je ne sais pas ce que signifie cette écriture. mBD-CYCA2.3-GFP. Je sais que c'est la cycline de type A, spécifiquement la A 2.3, est fusionnée à la GFP pour la localiser. Mais que veut dire mBD.  [...] A-type cyclins contain destruction box (D-box) sequences, which have been reported to mediate protein degradation (Glotzer et al., 1991). To express the CYCA2.3-GFP fusion protein at even higher levels, we changed its D-box sequence to a nonfunctional one (from RAVLGEITN to GAVVGEITN.  [...]

Problème: transport entre le reticulum endoplasmique rugueux et appareil de Golgi

- fusion vésicules-membrane. Intervention de proteines G, on parle d'amarrage, puis fusion des membranes (interaction NSF-SNAP-SNARE).  [...] Certaines protéines en cours de synthese (cad de façon co-traductionnel) sont adressées (syn transportées) au reticulum endoplasmique RE. Une fois dans le RE, certains de ces proteines (donc pas toutes) seront enpaquetées dans des vesicules. Ces vésicules sont ensuite adressées à la membrane du ( cis ) Golgi, avec laquelle elles fusionnent.  [...]

Protéine de fusion recombinante dimérique, besoin d'aide.

- Pour faire une protéine de fusion, est ce qu'il faut mettre le gène codant pour la protéine d'intérêt et celui pour le gène que l'on souhaite fusionner avec celle-ci (par exemple la poly histidine) sur le même plasmide sans les séparer d'un promoteur ou est ce qu'il faut rajouter quelque chose en plus.  [...] Pour une protéine de fusion, les deux séquences codantes sont mises à la suite l'une de l'autre sans codon stop entre les deux. une seule chaîne est produite.  [...]

fusion transcriptionnelle et traductionnelle

la fusion traductionnelle est une fusion de gênes effectuée dans leur partie codante et respectant les cadres de lectures. Permet d'obtenir une protéine chimère. cette technique permet par exemple de faire une fusion entre un gène d'intérêt ( qui code pour une protéine d'intérêt ) et le gène qui code pour la GFP.  [...] à propos d'une fusion traductionnelle, j'imagine qu'on peut l'utiliser pour isoler une protéine d'intérêt ou bien réaliser une fusion entre une protéine d'intérêt et la GFP ( pour visualiser et localiser le chemin emprunté par la protéine dans la cellule ) je me trompe.  [...]

[Identification] Bacterial display !

Les bactéries vont exprimer à leur surface des peptides/protéines par fusion avec des protéines bactériennes constituant ainsi une banque de protéines qui va pouvoir être criblée. Cette étape de criblage correspond au biopanning.  [...] En fait, on ne sélectionne pas les protéines qui se lieraient mais qui sont exprimées à la surface de la bactérie, expression provoquée par modification du génome bactérien.  [...]