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génétique du developpement et évolution

J'aurais besoin de votre aide a propos d'un dossier que je dois faire sur l'apport de la genetique du developpement ds la connaissance de l'évolution des especes. Le prof ns a demandé de prendre un ex concret, j'ai pensé au passage de la nageoire a la patte ou l'appartition des ailes chez les hexapodes, seul souci j'arrive pas a trouver le mécanisme exact des genes homéotiques jusqu'a l'apparition de l'innovation genetique et morphologique, l'apparition de la ou les mutations, la comparaison des sequences en bases azotées et AA pr ces exemples.  [...] tu peux prendre comme exemple, celui de l'oeil des vertebrés et des céphalopes (poulpes, seiches,calmar...). ces deux familles ont inventé l'oeil camérulaire à un seul cristallin, avec une origine histologique très différente pour les deux. donc pour ce qui est du développement on peut bien voir comment avec des mutations successives on arrive à un oeil avec au départ des cellules d'origine très différentes.  [...]

Notion d'évolution...

Dans le cas de la coévolution, si on considère les protéines. soit on les utilise uniquement pour faire la phylogénie (donc on observera des divergences conjointes entre les deux groupes d'espèce coévoluant). Si on a affaire à des protéines qu'on connaît bien et qu'on sait impliquées dans les interactions entre les deux espèces, on pourra analyser plus finement les séquences et observer une correspondance entre les mutations des espèces interagissant (ça peut par exemple être le cas pour des mutations de récepteurs).  [...] Dans le cas de convergences évolutives, pour des protéines, si ces protéines ne sont pas directement impliquées dans la convergence, on observera que les deux espèces convergentes sont en fait éloignées. Si on a des protéines impliquées dans la convergence, on observera une convergence soit au niveau de l'activité des protéines, avec des séquences carrément différentes, soit des convergences sur les parties de la séquence de la protéine impliquées dans la convergence, mais il y aura des différences importantes entre les parties non impliquées dans cette convergence.  [...]

[Biologie Moléculaire] Rechercher des séquences nucléiques parmi plusieurs espèces

Je dois faire un screening et récupérer les séquences nucléotidiques de trois sous-unités d'une enzyme, chez différentes espèces. Je ne me lance pas dans l'océan, je dois compléter une liste qui a déjà été réalisé lors d'un publication vielle de 10 ans donc surement plus à jour.  [...] Je dois faire un screening et récupérer les séquences nucléotidiques de trois sous-unités d'une enzyme, chez différentes espèces.  [...]

Mutation?!

Je pense que ce que veut dire fafac (dit moi si je me trompe.) c'est que, comme les séquences intergéniques sont très différentes entre les individus, ils n'y a pas d'intérêt à en rechercher les mutations. Pour considérer une mutation il faut se baser sur une norme.  [...] Ce que j'y ai compris c'est que les mutations au niveau des séquences régulatrices subissent une assez forte pression de sélection. Càd que l'on ne peut pas accepter que les mutations surviennent trop et/ou trop souvent parce que changer le niveau d'expression d'un gène peut être mauvais pour l'organisme concerné.  [...]

[Microbiologie] ADNr 16S ou ARNr 16S ?

.) possèdent des ARNr. On va ensuite comparer les séquences de ces ARNr dans les différentes espèces, et en simplifié, plus ils se ressemblent d'une espèce à l'autre, plus les espèces sont proche d'un point de vue évolutif. Et donc plus ces séquences divergent, plus les espèces considérées sont loin évolutivement.  [...] J'avais compris que plus les séquences d'ARNr diffèrent plus les espèces sont éloignées les unes des autres. Mais si ces séquences en viennent à se différencier autant, comment sait-on qu'il s'agit d'ARNr et pas d'un autre ARN.  [...]

[Biologie végétale] Phylogénie des transporteurs CAT. (recherche de relations)

J'ai du déterminer les relations phylogénétiques entre les séquences protéiques d'un transporteur CAT ( AAT1, alias AAP1 chez arabidopsis thaliana) et les bases de données protéiques des 6 espèces (riz, peuplier, vigne, arabidopsis, maïs et ricinus).  [...] Bon, si ca intéresse quelqu'un. La divergence des especes au sein des 2 clusters représenté est due au fait que le gène qui code pour le transporteur CAT était présent chez un ancètre commun à toutes ces espèces. Les divergences entre une même espèce sont dues à des duplications du génome, mutations etc.  [...]

question sur le logiciel ANAGENE

Seulement je ne sais pas quelles séquences choisir pour faire une bonne comparaison et, ainsi, déterminer quelles sont les espèces les plus proches de l'homme.  [...] Pour les séquences codantes, il faut aussi distinguer les mutations synonymes et non synonymes, qui n'induisent pas la même pénalité. Mais je crois que le logiciel fait ça tout seul, ça doit être juste une option à cocher.  [...]

[Biologie Moléculaire] analyse des séquences

Pour d 'autre, aprés avoir établi des corrections au niveua des séquences, le pourcentage d homologie n a pas dépassé 99% et aussi avec plusieurs espéces.  [...] Il semblerait que tu ais séquencé un gène dont l'intégrité est nécessaire à la survie d'un grand nombre d'espèces différentes. si la moindre mutation est délétère, ce gène se retrouve de facon identique chez plusieurs espèces.  [...]

ADN poubelle

Certains pseudogènes dans une espèce correspondent à des gènes actifs dans d'autres. On reconnait un pseudogène en général car il contient des mutations qui empêchent son expression (soit au niveau de la transcription, soit de la traduction).  [...] A mon avis pas plus que d'autres séquences, et même plutôt moins, puisque les pseudogènes évoluent plus vite que les séquences codantes (car les mutations ne sont pas contresélectionnées).  [...]

[Biologie Moléculaire] Réparation du DNA; système NHEJ

En fait est ce que la cassure DSB, c'est comme un coup de ciseau sur l'adn, qui crée donc 2 fragments, ou 2 cassures SSB qui peuvent être a des endroits éloignés, mais généré 2 fragments quand même (DSB), car sinon je ne comprend pas la perte de séquence possible en raboutant les 2 bouts.  [...] Le raboutage ne se fait pas nécessairement par microhomologies d'ailleurs, comme mentionné dans un des liens ce qui peut vraiment être mutagène. Il peut se faire entre des extrémités n'ayant pas du tout d'homologie et situés à des endroits différents du chromosome.   [...]