• Forum - Séquences, Génome, Protéines

[Evolution] Le transformisme aujourd'hui

Bref j'ai fini par me dire que cette idée devient un peu trop récurrente pour que ce soir une coïncidence, en gros ce qui ressort à chaque fois c'est que l'évolution se fait par les gènes mais que à force certains caractères acquis finissent par passer dans le génome ou un truc comme ça.  [...] Je soumets une autre observation sans pour autant la corréler avec ce que je viens de dire. Toute personne qui a fait un rien de biologie sait qu'à la fin de la gâmetogénèse, les histones sont remplacés par les protamines. Ce sont des protéines encore plus basiques que les histones dont l'apport à deux conséquences.  [...]

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

.. Avec le progrès du séquençage (qui a reçu un coup de fouet grâce au projet Génome Humain) de ces génomes, on parvient à extraire de façon automatique ou semi-automatique (dépendant des bases de données), des séquences d'acides aminés correspondants à des protéines (séquences vérifiées par la suite).  [...] En date du 3 décembre 2012, on connaissait la séquence d'acides aminés de 18877226 protéines différentes (voir les données Uniprot de la PDB). De ces ~19 millions de protéines, seules 538585 ont été vérifiées expérimentalement (voir base de données UniProtKB ).  [...]

[Divers] [bibliographie] Bibliothèque de biologie/santé

Site regroupant le génome de plusieurs organismes modèles. Il permet de trouver des séquences (ADN, ARN, proteines), les homologues dans les autres espèces, de faire des blasts, de trouver les séquences en amont ou en aval, et donne également des indications sur la structure des gènes, les epissages, ect.  [...] Site regroupant toutes les informations ayant trait au génome murin (analyse des gènes, des protéines, présentation des modèles mutants existants, bibliographie, photos).  [...]

E1A ?

je suis resté évasif sur la subastance en question E1A... Après une petite recherche sur google, il s'avère que son nom est bien E1A, une protéine, et est utile pour le gene expression (je sais pas comment on dit en francais, peut etre que le nom de la protéine en francais n'est pas le meme...).  [...] C'est un transactivateur, c'est-à-dire que cette protéine va reconnaitre des séquences sur le génome viral et recruter les facteurs cellulaires pour forcer la cellule à transcrire le génome viral (donc fabriquer des protéines virales) plutôt que le sien. C'est une molécule-clé pour le virus évidemment.  [...]

[Génétique] Fougere et chromosomes ...

[On peut continuer sur les critères pour mesurer un génome, parler du nombre de séquences codant des protéines, par exemple, mais je ne vais pas aller plus loin dans ce message.].  [...] Je tiens quand même à rappeler cet exemple. au début du séquençage, on estimait notre génome à 100 000, maintenant on atteindrait à peine 25 000 gènes. Car des phénomènes tel que l'épissage complique énormément la lecture, un même gène pouvant alors amener à différentes protéines et donc fonction.  [...]

Gene récessif, dominant, codant ou non

Je vois aussi que L'ADN non codant, autrefois appelé improprement ADN poubelle, désigne l'ensemble des séquences du génome qui ne sont pas traduites en protéines.  [...] Pour certains auteurs, ADN codant comprends aussi l'ADN qui code pour des ARNs non traduits en protéines (ARNt, les ARNs dits non codants. siRNA, miRNA, piRNA, les longs ARNs non codants,...), par opposition à l'ADN qui n'est pas du tout transcrit. centromères, séquences régulatrices de type enhancer/silencer (qui peuvent réguler un gène alors qu'il sont à des kb en amont ou en aval...).  [...]

[Biochimie] Génome "poubelle" codant

A part les gènes à proprement parlé qui codent pour des protéines, on sait que dans le génome, une bonne partie de ce qu'on pensait être de l'ADN poubelle (non codant en masse), se trouve des séquences de contrôle etc. A-t'on une idée actuellement de la proportion de séquences en fait codantes dans l'ADN dit non codant Et quelles sont les types de séquences codantes que l'on peu retrouver dans cet ADN poubelle Il me vient à l'esprit uniquement les ARN interférents par exemple.  [...] oui c'est pour ça que j'avais mis des guillemets un peu partout.. toujours est il que je me pose toujours cette question... Quelles peuvent être les fonctions des séquences d'ADN qui ne codent pas pour des protéines (à part les séquences de régulation de la transcription, sur lesquels les facteurs de transcription se fixent etc.).  [...]

[Biologie Moléculaire] [biologie moleculaire] Le code génétique

Tu oublies que la plupart des gènes et des protéines avec lesquels nous travaillons (enfin du moins moi) sont issus d'un clonage à partir de la protéine (séquençage de la protéine puis recherche du gène). Si un système à 4 bases par codon existait, il y aurait eu un bug dans cette méthode.  [...] Ensuite tu oublies un peu vite que l'on ne connait pas la fonction de 10% des proteines presentent dans une cellules... Lorsque le premier genome eucaryote a ete entierement sequences, les chercheurs se sont appercu que par les technique de biologie moleculaire et de genetique et de biochimie, ils n'avaient identifies que 30% des genes (ce qui signifie qu'aucune fonction n'a pu etre attribuee à 70% des genes en laboratoire.  [...]

[Biochimie] thérapie génique

Le principe consiste à éliminer les séquences du virus qui codent des protéines, notamment celles associées à un éventuel comportement pathogène du virus, et à ne conserver que celles qui sont utilisées pour construire la particule virale et assurer le cycle d'infection.  [...] Le génome du virus est reconstruit pour porter les séquences du gène thérapeutique. Les protéines virales qui potentiellement manqueraient à la formation des particules virales thérapeutiques sont fournies par des cellules dites productrices ou d'encapsidation lors de la phase de production des vecteurs.  [...]

[Biologie Moléculaire] Principe de la LM-PCR

La LM-PCR est utilisé pour la technique de ChIP on Chip qui a été developpé afin de rechercher les sequences nucléotidiques associées a une protéines d'interet (Facteur de transcription) sur tout le génome. Elle permet d'amplifier les sequences d'ADN intergéniques coimmunoprécipité lors de la ChIP de séquence inconnue.  [...] Tu fait la meme chose avec un autre fluorophore pour l'ADN total non coimmunoprécipté lors de la ChIP et t'hybride le tout sur une puce possédant une banques de séquences intergénique et le tour est jouer.  [...]