• Forum - Séquences, Chromosome, Identiques

Nombre d'allèles par chromosome

Un même gène est présent en deux versions, une sur chaque chromosome de la paire de chromosomes homologues (sauf pour les chromosomes sexuels mais je suppose que tu sais ça). Il arrive qu'un gène existe dans le génome en plusieurs exemplaires (éventuellement sur des chromosomes différents) auquel cas il peut y avoir plus de deux allèles.  [...] Mais dans la plupart des cas, c'est oui les deux séquences du meme gènes pour un chromosome sur ses deux chromatines sont strictement identiques.  [...]

[Microbiologie] recombinaisons génétiques (bactéries)

euh voila j'ai un petit souci de comprehension concernant les recombinaisons génétiques chez les bactéries. Je pensais avoir bien compris le principe jusqu'à ce qu'on nous parle du devenir de l'exogenote. En fait pour moi, la bactérie Hfr intégrait le facteur de fertilité F dans son chromosome par recombinaison homologue, mais les deu brins de l'ADN pour moi étaient intégrés lors de cette recombinaison.  [...] En méiose, les chromosomes paternels et maternels qui viennent de se répliquer sont appariés sur la plaque métaphasique. au polymorphisme près leurs séquences sont identiques. A ce stade chaque chromosome a donné naissance à deux chromatides mais la région centromérique n'est pas encore répliquée.  [...]

[Génétique] chromosomes

Je crois que tu fais une confusion entre les deux brins de l'ADN et les deux chromosomes d'une paire. Un chromosome vient soit du père soit de la mère. Les deux chromosomes d'une paire sont différents, même si en un certain locus les séquences peuvent être identiques (l'individu est alors homozygote en ce locus).  [...] D'ACCORD, donc les chromosomes ont des séquences de bases différentes ( dans les chromosomes analogues cependant, ça dépend des allèles du gène, et donc même séquence pour un gène quelconque ou pas) les uns des autres. Dernier détail, comment s'activent certaines parties du chromosome selon le tissu, et d'autres pas.  [...]

Quel est le taux de polymorphisme des gènes humains*?

Si par allèles identiques tu veux dire séquences identiques, alors la probabilité que deux chromosomes homologues d'une même personne ou de deux personnes différentes soient identiques en tous leurs locii est (à peu près) nulle. C'est facile à comprendre.  [...] il y a 23 chromosomes et 3 milliards de paires de bases, soit environ 100 millions de paires de bases par chromosome en moyenne, et comme je disais il y a un polymorphisme (connu) toutes les 3000 bases, soit environ 30000 par chromosome. Pour que deux chromosomes soient identiques, en supposant l'indépendance et l'équirépartition, la proba est de l'ordre de 1/2^30000 soit en gros zéro.  [...]

[Génétique] détection de mutation

Je ne comprend pas très bien les notions de polymorphismes, variants, hétérozyogotes/homozygotes, subtitution, mutation, codon, chromosome.Si quelqu'un pouvait m'éclairer sur ces définitions car je dois choisir des échantillons pour effectuer une dHPLC et je sais pas comment choisir mes échantillons et analyser les résultats.  [...] 1. biologie. chromosome sexuel présent en un seul exemplaire chez les mammifères mâles et en deux chez les mammifères femelles.  [...]

[Biologie Cellulaire] Qu'elle est la différence entre une personne Hétérozygote et Homozygote ?

Et j'ajouterai que la notion d'allèles identiques ou non dépend du niveau de détail de l'observation qui en est faite. Aujourd'hui on obtient facilement des séquences et on va parler d'allèles identiques quand les séquences sont identiques mais parfois on a une observation moins fine, par exemple on sait juste que les protéines produites sont fonctionnellement identiques (mais elles peuvent avoir des séquences différentes).  [...] Dans ce cas on pourra aussi parler d'homozygotie alors que les séquences sont distinctes. Pour prendre un exemple. dans le système de groupe sanguin ABO, une personne peut être considérée comme homozygote AA, ce qui signifie que les deux versions du gène qui code l'ABO-transférase produit la même protéine (au moins fonctionnellement) mais ne dit rien sur les séquences de ce gène (ou plutôt dit qu'elles ne sont pas très différentes mais autorise quelques variations).  [...]

bioinformatique dot plot

si j'ai bien compris les anti diagonales représentent une portion de séquence qui est identique pour deux séquences, mais que représentent les diagonales.  [...] les diagonales sont des séquences identiques, et les antidiagonales (je ne connaissais pas ce terme) des séquences identiques mais dont l'une est inversée par rapport à l'autre.  [...]

[Génétique] questions simples mais qui m'embrouillent la tête:(

Ce n'est pas tout à fait ça. Les chromosomes homologues ne sont pas identiques (ils sont homologues). Effectivement, l'un vient du père et l'autre de la mère. Mais du coup, ils n'ont pas exactement la même séquence. Celui du père a une certaine histoire au travers des anciennes générations, et a accumulé des mutations différentes de celui de la mère.  [...] Donc, d'accord en phase G2, une paire de chromosomes homologues ayant 2 chromatides chacun, on peut considérer qu'ils portent effectivement 4 copies de chaque gène à eux deux. Mais le chromosome d'origine paternelle porte 2 copies identiques (deux fois le même allèle) et celui d'origine maternelle, deux copies identiques qui peuvent être ou non identiques à celles du père.  [...]

Programme agencement alignements multiples de séquences

je recherche un programme compatible mac os X qui permettrait a partir d'un alignement de séquences clustal par exemple de colorer les aa identiques ou homologues (pas comme dans clustalX ou chaque aa est coloré, je cherche un truc qui me les colore uniquement quand 60% des aa entre les sequences sont identiques par exemple).  [...] 60% des aa entre sequences sont identiques implique que l'homologie soit calculée dans une fenêtre (un certain nombre d'acide aminés). Ce genre d'approche est possible avec un systeme d'alignement de genre dot-plot... qui peut par exemple se faire sur vector NTI (un peu cher) ou ailleurs (tape dot-plot sur google).  [...]

Crossing over à chaque méiose?

Il y a bien une différence. Le crossing-over c'est le phénomène qui se produit, aussi appelé enjambement entre chromatides NON-SOEURS, c'est-à-dire entre les chromatides de deux chromosomes homologues, donc pas les chromatides du même chromosome, ce qui ne servirait à rien puisqu'elles sont par définition identiques.  [...] Cependant après ce premier brassage en prophase I il faut bien noter que les chromatides d'un même chromosome ne sont plus identiques.  [...]