• Forum - Séquences, ADN, Protéines

logiciel de bioinformatique

En gros tu cherches des logiciels de modélisation et des bases de données bioinformatiques (séquences ADN, protéines, etc...).  [...] - Pubmed pour la littérature scientifique, mais aussi les séquences ADN, les protéines, le métabolisme.  [...]

[Biochimie] Génome "poubelle" codant

A part les gènes à proprement parlé qui codent pour des protéines, on sait que dans le génome, une bonne partie de ce qu'on pensait être de l'ADN poubelle (non codant en masse), se trouve des séquences de contrôle etc. A-t'on une idée actuellement de la proportion de séquences en fait codantes dans l'ADN dit non codant Et quelles sont les types de séquences codantes que l'on peu retrouver dans cet ADN poubelle Il me vient à l'esprit uniquement les ARN interférents par exemple.  [...] oui c'est pour ça que j'avais mis des guillemets un peu partout.. toujours est il que je me pose toujours cette question... Quelles peuvent être les fonctions des séquences d'ADN qui ne codent pas pour des protéines (à part les séquences de régulation de la transcription, sur lesquels les facteurs de transcription se fixent etc.).  [...]

Gene récessif, dominant, codant ou non

Je vois aussi que L'ADN non codant, autrefois appelé improprement ADN poubelle, désigne l'ensemble des séquences du génome qui ne sont pas traduites en protéines.  [...] Pour certains auteurs, ADN codant comprends aussi l'ADN qui code pour des ARNs non traduits en protéines (ARNt, les ARNs dits non codants. siRNA, miRNA, piRNA, les longs ARNs non codants,...), par opposition à l'ADN qui n'est pas du tout transcrit. centromères, séquences régulatrices de type enhancer/silencer (qui peuvent réguler un gène alors qu'il sont à des kb en amont ou en aval...).  [...]

[Biologie Moléculaire] ChIP on chip

On peut utiliser la technique ChIP on Chip pour identifier les interactions protéines - ADN. Je me pose quelques questions quant à l'utilisation de cette méthode. Une fois qu'on obtient nos séquences d'ADN où étaient fixées nos protéines d'intérêt fait-on une PCR ou on peut hybrider directement sur la puce Quelles séquences sont utilisées sur notre puce (des facteurs de transcription) afin d'hybrider nos séquences qui contenaient nos protéines.  [...]

l'ADN chromosomique sert-il in fine à produire autre chose que des protéines ?

Sinon, oui l'ADN va servir à autre chose, il y à notemment les ARNt qui sont indispensable mais jamais traduit en protéine, les ARNr qui forment les ribosomes, les micro ARN types miRNA, siRNA... et pleins d'ARN non codants.  [...] Dans l'ADN il y a aussi des sequances qui ne donnerons ni protéines ni ARN, mais qui sont indispensables (séquences régulatrices,promotteurs, switchs) des séquences qui favorisent la compaction de l'ADN pour qu'il prenne moins de place car une cellule ne peut pas avoir son ADN en permanence déroulé tellement il est grand, il y a aussi des séquences protectrices (télomères), des zones indispensable à la structure (centromère) et tout ceci ne fabrique aucunes protéines mais est indispensable.  [...]

Comment les protéines et l'ARN peuvent-ils agir sur les genes?

Ce qu'on appelle promoteur, c'est une séquence d'ADN qui est à proximité de la séquence codante du gène (qui sera transcrite en ARNm, lui-même traduit en protéine). Les protéines venant se fixer sur le promoteur sont des facteurs de transcription qui permettent l'expression du gène, ou au contraire l'inhibition de son expression. Ca peut marcher dans les deux sens.  [...] Ainsi, on peut suivre le chemin inverse de ADN à protéines et à partir de protéines avoir de l'ADN, cependant il faut des complémentarités de structures entre le brin d'ADN produit et l'ADN initial...ainsi il y a toujours une sélection et protection du code génétique.  [...]

[Biologie Cellulaire] questions sans réponse

Ceci implique un renouvellement permanent. La fréquence de divisions des cellules souches doit être assez élevée mais je ne saurai te répondre de façon plus précise.   [...] Bah, en fait, les télomères sont des séquences particulières d'ADN sur lesquelles se fixent des protéines. C'est les protéines qui s'y fixent qui protègent. Sans télomères les protéines ne protègent plus l'ADN de la dégradation.  [...]

Readseq Logiciel

Prière de m'aider pour trouver un logiciel qui remplace readSeq de INFOBIOGEN pour manipuler des séquences ADN ou Protéines.  [...] Qu'est-ce que tu appelle manipuler les séquences d'ADN ou de protéines Parce-que des logiciels dans ce style, y en a une grosse flopée.  [...]

[Biologie Moléculaire] Traduction et transcription

Il y a cet outil qui traduit automatiquement les séquences d'ADN et d'ARN en protéines. Très simple d'utilisation, vous remarquerez qu'il donne 6 cadres de lecture car il lit les séquences dans les deux sens.  [...] w je pense que j'ai compris ce qu'elle veut dire part cette sequence est au milieu d'arn messager qui code pour une grande proteine ça veut dire qu'il ne doit pas avoir de codant stop peu etre.  [...]

[Biologie Cellulaire] carcinogenese, apoptose et mutagenese

La mutation peut etre ainsi silencieuse si elle touche une séquence d'ADN hors des séquences codantes fonctionnelles ou peut entrainer la synthèse de proteines défectueuse si elle touche ces séquences.  [...] Parmis les milliers de proteines que nos cellules synthétisent, on trouve la p53. Cette proteine a pour fonction l'arret des division mitotiques de la cellule si un défaut de la transmission de l'information génétique est détécté, elle intervient donc dans la correction de l'erreur puis donne une nouvelle fois le feu vert pour la poursuite de la multiplication.  [...]