• Forum - Séquences, ADN, Protéine

[Biologie Moléculaire] Comment ce fait-il qu'on ait des séquences codantes et non codantes ?

Je comprends pas un truc. L'ADN est un polymère d'acide nucléique comment ce fait-il qu'ont est des séquences codants pour des protéine (exons) et d'autres séquences non codantes (introns) qu'on a longtemps qualifié d'ADN poubelle avant de trouvé qu'ils avaient une action régulatrice sur les gènes.  [...] Mais la chose qui m'interpèle vraiment c'est comment ce fait il qu'il y est une différence alors que c'est simplement un enchainement de nucléotide comment ce fait-il que certain nucléotides code et que d'autres non c'est lié au modification post-traductionelle c'est à dire méthylation etc.   [...]

Promoteur

Bof bof, c'est sur les deux brins. Un facteur de transcription reconnait une conformation de séquence d'ADN double brin, qu'on la mette dans un sens ou dans l'autre, la conformation reste la même... (voir les enhancers par exemple).  [...] Pareil que LXR, quand on parle de séquences régulatrices, c'est-à-dire que leur fonction implique des intéractions protéine-ADN, il faut considérer que la structure importante est l'ADN double-brin.  [...]

[Biochimie] Empreinte à la DNase+ TAMOXIFENE

Cette méthode permet de démontrer qu'une protéine X se fixe à une séquence approximative Y de l'ADN, mais ne permet pas de dire si Y est enhancer, silencer ou quoi que ce soit d'autre.  [...] Sans tamoxifène, la protéine de fusion cre-dllER est séquestrée dans le cytoplasme par des chaperonnes (HSP70). Lorsque l'on ajoute le tamoxifène, le DLL change de conformation, libère les chaperonnes et la protéine de fusion peut entrer dans le noyau et exciser la portion d'ADN comprise entre les séquences LoxP.  [...]

[Biochimie] etude de proteine de liaison à l'ADN

j'ai fait un TP ou on a purifié un domaine de liaison a l'ADN et je suis sur que pour l'examen qu'en passe dans 2 jours ils vont nous demandé les techniques permettant d'étudier cette liaison.  [...] pour déterminer quelles sont les séquences d'ADN reconnues par une protéine X.  [...]

[Génétique] question

Si tu recherches une protéine, le site d'uniprot ( http.//www.uniprot.org/ ) reste celui avec la base de donnée la plus importante. Mais tout est en anglais.  [...] SInon vous avez également Ensembl et Genbank qui vous permettent d'obtenir les séquences de génôme que vous voulez, avec une myriade de fonctionnalités.  [...]

[Biologie Moléculaire] Banques d'ADNc

Si tu veux cloner un gène avec toutes les séquences inutiles qu'il peut éventuellement comporter tu vas utiliser une banque ADN génomique. Si tu veux uniquement la séquence stricte du gène correspondant à la protéine qui t'interesse, tu vas utiliser une banque d'ADNc.  [...] Mais il ne faut pas oublier que tu n'as plus de séquence promotrice car ton ADNc est le copier/coller d'un ARNm. Il faudra éventuellement insérer une séquence promotrice à ton gène si tu veux le faire exprimer.  [...]

Biologie moleculaire

comment peut -on déterminer les séquences nucléotidiques interagissant avec une protéine par les expériences de protection.  [...] tu mets ta protéine candidate avec ton ADN ou ARN. Ensuite tu utilises une RNAse ou DNAse pour dégrader tout ce qui n'est pas protégé, puis tu retires toutes les protéines, et tu séquences les nucléotides qui ont été protégés.  [...]

[Génétique] PCR ou RT-PCR

La PCR amplifie des séquences d'acide nucléique. Dans l'immense majorité des cas, quand on parle de PCR on sous entend que on l'effectue à partir d'une matrice ADN.  [...] une PCR suffit pour répondre à cette question, si ce sont des gènes conservées, une réponse négative peut indiquer que les séquences d'hybridation des amorces sur l'ADN de votre organisme sont différentes sans pour autant rendre le gène ou la protéine inactif.  [...]

[Biochimie] Vecteur d'expression pour une proteine recombinante

Pour ta dernière question, il faut bien sur faire sauter le stop de la stathmine. Il y a plusieurs options. soit tu as un site de restriction bien placé, soit tu places la GFP après et tu modifie le codon stop en mutagénèse dirigée. Truc capital. les ADN codants pour ces deux protéines doivent être insérées dans le vecteur EN PHASE.  [...] Apparamment il y a deux moyens de faire cet ADN recombinant. Je suppose que c'est soit on fait Stathmine-GFP, soit l'inverse. Mais est ce qu'on obtient la meme proteine selon la façon d'assembler ses séquences.  [...]

OGM et pollution génétique de l'eau

Quelles peuvent être les conséquences de la présence de séquences d'ADN génétiquement modifié en quantité importante dans la nature et acheminées par l'eau Il suffit de se rappeler qu'un virus est une parcelle d'ADN enrobée d'une capsule (protéine) (4) et l'on peut deviner que la culture intensive d'OGM est un terrain de risques très importants d'élaboration de nouveaux virus que l'homme n'a jamais eu à affronter jusqu'alors.  [...] En tout cas, si l'on a pas détecté d'OGM 4 ans après, c'est bien parcequ'ils n'y en avait plus. la méthode de détection ne recherche pas la protéine synthétisée mais des séquences marqueurs ( en l'occurence, le promoteur, et le gène de la nopaline synthase ).  [...]