• Forum - Séquences, ADN, ARN, Protéine

[Génétique] question

Oui, le site du NCBI n'est pas l'idéal pour chercher des séquences ADN/ARN/protéine.  [...] SInon vous avez également Ensembl et Genbank qui vous permettent d'obtenir les séquences de génôme que vous voulez, avec une myriade de fonctionnalités.  [...]

[Biologie Moléculaire] Code génétique

Le code génétique est la correspondance entre les codons d'ADN et les protéines. Vous vouliez parler d'une même séquence et non d'un même code génétique je présume.  [...] Un gène est par définition une séquence d'ADN qui code pour une protéine (seulement 5% du génome environ). Pour le reste, il y a des séquences non codantes, d'autres qui sont transcrites mais non traduites (ARN non codants pour des processus de régulation), etc,  [...]

[Biologie Cellulaire] biophoton

Les cellules ne peuvent que recopier de l'ADN existant physiquement et/ou le traduire en protéines. L'information ne suffit pas. Il faut donc supposer que les photons se transforment par miracle en séquences d'ADN ou d'ARN viral. C'est impensable.  [...] minushabens Les cellules ne peuvent que recopier de l'ADN existant physiquement et/ou le traduire en protéines. L'information ne suffit pas. Il faut donc supposer que les photons se transforment par miracle en séquences d'ADN ou d'ARN viral. C'est impensable.  [...]

Biologie moleculaire

comment peut -on déterminer les séquences nucléotidiques interagissant avec une protéine par les expériences de protection.  [...] tu mets ta protéine candidate avec ton ADN ou ARN. Ensuite tu utilises une RNAse ou DNAse pour dégrader tout ce qui n'est pas protégé, puis tu retires toutes les protéines, et tu séquences les nucléotides qui ont été protégés.  [...]

[Biochimie] Génome "poubelle" codant

A part les gènes à proprement parlé qui codent pour des protéines, on sait que dans le génome, une bonne partie de ce qu'on pensait être de l'ADN poubelle (non codant en masse), se trouve des séquences de contrôle etc. A-t'on une idée actuellement de la proportion de séquences en fait codantes dans l'ADN dit non codant Et quelles sont les types de séquences codantes que l'on peu retrouver dans cet ADN poubelle Il me vient à l'esprit uniquement les ARN interférents par exemple.  [...] Quand on parle de sequence codante, on parle de sequence codant pour une proteine. Si tu connais les RNAi, tu dois certainement savoir que ce ne sont pas des messagers. Donc, l'ADN qui les code est transcrit non traduit, donc non codant.  [...]

question en génétique

7-dans l'ARN polymérase d'E.coli les facteurs d'initiation et d'élongation sont des sous unités permanentes de l'enzyme qui lui permettent de reconnaitre les séquences promoteur consensus et d'allonger la chaine d'ARN faux.  [...] 10-les proteines activatrices des gènes se lient à des séquences spécifiques d'ADN mais n'intéragissent pas avec l'ARN polymérase vrai.  [...]

[Divers] [bibliographie] Bibliothèque de biologie/santé

Site regroupant le génome de plusieurs organismes modèles. Il permet de trouver des séquences (ADN, ARN, proteines), les homologues dans les autres espèces, de faire des blasts, de trouver les séquences en amont ou en aval, et donne également des indications sur la structure des gènes, les epissages, ect.  [...] Site regroupant toutes les informations ayant trait au génome murin (analyse des gènes, des protéines, présentation des modèles mutants existants, bibliographie, photos).  [...]

[Biologie Cellulaire] Peut'on déduire la séquence de nucléotide de l'ARNm à partir de la séquence polypeptidique ?

Pour aller plus loin il te sera encore moins possible de prédire la séquence du gène ( donc ADN ) codant pour ce peptide à cause de l'épissage alternatif des introns car il y a dans l'ADN des séquences codantes. les exons, et non codantes. les introns. Ces derniers ne seront pas présents du tout sur ta séquence ARN codant pour la protéine.  [...] Cette technique est (ou a été utilisée) pour trouver des gènes a partir de séquences de protéines en trouvant des séquences consensus de messager basées sur la fréquence des différents codons.  [...]

Est-ce que tous les gènes codent des protéines

Peut-être que pour rester neutres on pourrait dire que toutes les séquences ne sont pas transcrites et tous les transcrits ne sont pas traduits en protéines.  [...] Dans les séquences codantes, seule une petite partie des transcrits ARNs sont voués à quitter le noyau et être traduit en protéine. ce sont les ARN messagers. Il existe ainsi d'autres ARN non-messagers, tels que les ARN ribosomiques (à activité catalytique), les ARN interférants, les ARN petits nucléaires, les ARNt (de transfert, impliqué également dans la synthèse des protéines).  [...]

[Biochimie] Outils informatiques

Appatch, le meilleurs logiciel de bioinfo pour aligner des séquences d'ADN, d'ARN ou protéique c'est Blast sur NCBI. C'est américain, très simple d'utilisation, est SUPER utile.  [...] J'imagine cependant que l'on peut réaliser des alignements locaux avec BLAST et plusieurs séquences en lui donnant une banque uniquement constituée de nos cibles (j'y ajouterai quand même quelques protéines non relevantes histoire de voir la pertinance des résultats).  [...]