• Forum - Séquence, Promoteur, Hybride

[Biologie Cellulaire] Fusion transcriptionnelle et traductionnelle

La fusion traductionnelle consiste en la fabrication d'une protéine hybride, c'est-à-dire que tu as la construction génétique suivante [promoteur du gène d'intérêt]-[5'UTR]-ATG-séquence codante 1-séquence codante 2-STOP-[3'UTR et terminateur de transcription].  [...] Maintenant si tu veux non plus localiser une protéine d'intérêt mais quantifier l'activité d'un promoteur donné entre plusieurs conditions, tu peux construire quelque chose comme [promoteur d'un gène d'intérêt]-[5'UTR]-ATG-séquence codante d'un gène rapporteur-STOP-[3'UTR et terminateur de transcription].  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcriptome

Mon prof a dit que qu'on connait le gène qu'on a mis dans chaque puits et après comme on connait la séquence du génome de l'organisme qu'on utilise, on peut identifier les promoteurs... mais si un gène est la séquence non transcrite (promoteur) + séquence transcrite.  [...] En fait les ADNc s'hybrident aux gènes mais comme ils correspondent aux transcrits... La séquence du promoteur ne s'hybride pas. Du coup on utilise les transcrits s'ayant hybridé et comme on a les séquences entières du génome... on peut identifier les promoteurs.  [...]

Insertion d'un promoteur sur un vecteur plasmidique

A désolé j'avais pas vu que tu demandait aussi comment l'isoler. Bein les séquences de ce types de promoteur sont archi connues donc quand tu commandes tes amorces, tu peux leur demander qu'ils te rajoutent ta séquence promotrice en amont de ton amorce 5' et le tour est joué.  [...] Et puis la PCR pour mettre un promoteur, cela me semble tout à fait convenable. Un promoteur minimal fait combien à peu près, dans les 50 bases au max. Admettons qu'on prenne une séquence en 5' de 50 bases qui s'hybride à notre fragment, cela est suffisant pour avoir une hybridation spécifique, et notre amorce fait donc 100 bases.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène et Promoteur

Pour l'étape de transcription d'un gène, il faut trois outils essentiels. un promoteur, qui recrute la machinerie de transcription, une séquence à transcrire et une séquence terminatrice. Ce sont les trois outils essentiels à la transcription des gènes. La séquence promotrice se situe en amont de l'unité de tranxcription et permet l'initiation et la régulation de la transcription.  [...] cette séquence n'est pas transcrite. L'unité de transcription a donc un point de départ situé en aval du promoteur. c'est le nucléotide à partir duquel la synthèse de l'ARN par l'AN polymérase s'initie. Le terminateur est une séquence qui marque l'arrêt de l'élongation de l'ARN polymérase et la dissociation de l'hybride ARN-ADN qui s'est formé dans la bulle de transcription (le phénomène de transcription découle de l'appariement des bases azotées du brin matrice d'ADN et du brin en synthèse d'ARN).  [...]

[Biologie Moléculaire] Promoteur Taq

Je suis en Licence 2 de Chimie et j'étudie les promoteurs utilisés dans la transcription. On me demande de schématiser le promoteur Ptac qui est l'hybride entre le promoteur de l'opéron tryptophane (-50 -11) et celui de l'opéron lactose (-10 +30).  [...] J'aurais voulu savoir si quelqu'un pouvait me donner un site où trouver ou même la séquence du promoteur Ptac.  [...]

[Biochimie] Réponse QCM

Oui mais sans les télomères, lors des divisions cellulaires, les chromosomes perdraient sans cesse une partie de materiel génétique puisque les polymérases n'arrivent pas répliquer les chromosomes dans leur intégralités (jusqu au bout). La réponse D me parait correct dans se sens, la A aussi puisque la séquence télomère est tjs la même (humain) mais peut être que la télomérase n'agit pas sur tout les chromosomes (dans les endroits ou elle est ative).  [...] En ce qui concerne la réponse C, le début me parait correct, mais ce qui me dérange c'est de type Z. Les hélice type Z concerne les répétition de type purine, pyrimidine... CGCGCGCGCG, ce qui n'est pas strictement le cas de la séquence télomère TTAGGG.  [...]

[Biologie Cellulaire] Sonde fish

une sonde FISH de sequence TTAGGG hybridé sur des chromosomes humains.  [...] Sinon je ne comprends pas comment les réponses que vous jugez toutes vraies peuvent l'être dans la mesure où la dernière contredit toutes les autres.   [...]

Sequence 5' pour un ADNc en Southern Blot

j'explique si la deuxiéme sonde utilisée est marqué à son extrémité 5' et puisqu'elle s'hybride avec le fragment 1.1 adnc et 4.1 dans l'adng.....je pense que la séquence du fragment 1.1 est comprise dans le frg 4.1 et donc ce dernier contient une partie exonique de 1.  [...] Merci cela comforte l'hypothese que javais formulé. le probleme venant du fait que j'avais oublié que la sonde ne s'hybridé pas avec la sequence 5' Utr.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutagénèse dirigée

oui c'est un peu court. Mais pour ce genre de technique tu dois utiliser des amorces contenant la séquence que tu veux modifier, mais aussi une séquence commune avec ta matrice d'ADN. Comme ca l'amorce s'hybride partiellement avec ton ADN, et le reste contient ta mutation.  [...] Dans un premier temps tu dois insérer ta séquence à modifier dans un plasmide. La Pfu turbo est une polymérase qui fait moins d'erreurs que la Taq. Par PCR, tes amorces contenant les mutations désirées vont être allongées, tu obtiendras ainsi des plasmides linéarisés, pareils au plasmide parental mais contenant tes mutations.  [...]

[Microbiologie] Hybridation Southern Blot

Vous parlez d'hybridation avec la sonde C'est le principe clef de cette technique. on crée une sonde taggée (avec un radio-isotope ou un fluorophore) qui cible la séquence d'intérêt. La sonde s'hybride avec la séquence cible, on lave le gel de l'excédent de sondes, puis on redarde où s'est hybrider la sonde relativement sur le gel.  [...] a) S'il s'agit d'une variation génétique/ allélique d'un gène séquencé, en designant la sonde selon le gène sauvage, vous aurez tout de même une hybridation hétéroduplex (incomplète/imparfaite), mais pour une détection par SB ça devrait suffir.  [...]