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[Biologie Moléculaire] Recherche de gènes orthologues

J'aurais aimé savoir comment peut-on rechercher un gène d'une espèce séqucné chez une autre espèce séquencé afin d'éventuellement trouvé un gène orthologue.  [...] On obtient une liste d'identifiant de séquence classés par degré de proximité avec la séquence initiale. Quand tu cliques dessus, tu as accès à l'alignement des 2 séquences ce qui de te permet de valider ou non s'il s'agit de gènes orthologues ou pas.  [...]

Biochimie Exons

Le plus simple reste encore de chercher ton gène sur Gennome Browser, mais ça n'est possible que si tu travailles chez une espèce dont le génome est séquencé et annoté.  [...] C'est un exercice je ne pense pas que ce gène existe vraiment, en plus d'avoir cette séquence j'ai aussi la séquence du brin ARNc du coup j'ai pu trouver le nombre d'Exons en fonction de ce qui était codé et ce qui ne l'était pas. Maintenant on me demande de trouver le nombre de nucléotide de la région non codante 3' UTR mais j'ai aucune idée de comment y parvenir. Une aide.  [...]

recherche du genome bacterien

je prend une espèce X, j enregistre son génome a partir de NCBI, et après je veux faire un BLAST pour une séquence nucléotidique, mais je ne trouve pas mon espèce X,  [...] Ce que Je cherche est de trouver des sequences qui sont specifiques à une espece bacterienne donnée (à partir de son genome mais pas d'un gene donne).  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène GH-25

- Dans ton article, ils ont commencé par une analyse bioinformatique de séquence d'ADN de différentes espèces de l'arbre de la vie, puis ils ont séquencé en particulier, après amplification par PCR, le gène GH25 présent dans ces espèces. Comme il s'agit d'abord d'une analyse informatique, ils ont du dans un premier temps identifier si les séquences autour de leur gène fétiche étaient déjà connues pour être la/les séquence(s) codante(s) de gène(s) connu(s).  [...] ..), pour lequel on trouvera beaucoup plus d'annotation de génome (puis qu'il y aura plus d'espèces incluses, dont certaines sont des modèles d'études des scientifiques, donc bien mieux annotées). Et c'est comme ça qu'à partir d'un séquence d'ADN dont on ne sait rien, on peut prédire si cela correspond à un gène connu (étudié et séquencé dans une autre espèce du même règne) ou pas.  [...]

Variation/mutation

Dans mon cours, on définit la variation comme ''la différence entre la séquence d'un génome de référence et la séquence d'un individu de la même espèce''. Je sais que tout les individus d'une espèce présentent normalement les mêmes gènes (et donc le même génome), mais on diffère tous par nos allèles non.  [...] Ce qu'on appelle génome de référence c'est juste un assemblage de séquences, ça ne correspond pas forcément à un individu particulier. Son rôle est justement d'être une référence à laquelle comparer des séquences issues d'autres individus de la même espèce, voire d'autres espèces.  [...]

definition exacte des genes et alleles

Une allèle est une VERSION d'un gène, ce qui signifie que c'est une séquence d'ADN semblable à celles des autres versions. Cependant, le peu de nucléotides qui changent feront que le gène codera pour une protéine qui sera fonctionnelle, avec le même rôle, mais pas forcément le même aspect.  [...] Le mot gène couvre à la fois une fonction (et donc les aspects principaux de la séquence) et une position dans un génome (pour une espèce donnée). Un allèle est une version déterminée du gène, une séquence précise de nucléotides.  [...]

Manipuler l'Evolution

Car ce que tu propose est fait régulièrement, en labo, en modifiant la séquences génétique des éspèces manipulées (plantes, souris, mouches, ver...) seulement pour parler d'évolution (ici contrôlée) il faudrai les laisser dans la nature et voir si la séléction naturelle fait son office, siils meurent ou si ils se reproduisent, persistent et dépasse leurs congénères non modifiés en fréquences allélique dans la population.  [...] Oui, si l'on connait la séquence exacte de l'ancêtre et qu'on édite le génome d'un embryon de cette espèce pour que le nouveau née se rapproche génétiquement plus de l'ancere pris pour modèle sur le plan génétique, qu'il n'est proche de son père ou de sa mère.  [...]

mon grand-père est trop fort pour moi

Donc il suufira de séquencer des régiopns choisies du génome pour comparer deux individus et déterminer l'espèce à partir de banques, qui restent à réaliser (voir les articles sur le code barre génétqieu, il y en a un dans Pour la Science, de janvier je crois, par Le Guyader).  [...] Chez les procaryotes (mon domane de prédilection), le séquencage d'une espèce, ou plutot d'un organisme consiste à séquencer le génome entier (chromosome et plasmide(s) ).  [...]

sequencage du genome humain

J'ai deja lu que selon notre origine nous n'avons pas le meme genome et par la, des differences de sensibilité a certaines maladies. Donc je me demandais, d'ou vient l'humain qui a ete sequencé, comment c'est effectué la selection du coup, le genome est il vraiment fiable et utilisable (mis a part pour le groupe ethnique correspondant a l'humain sequencé).  [...] Il existe des phénoménes de mutations interchromosomiques qui vont faire que certaines régions des chromosomes ne vont pas se retrouver sur le bon chromosome. Mais là, il y a fort à parier qu'il s'agira d'une mutation qui entrainera de graves conséquences et la personne affectée par cette mutation ne sera plus saine donc on ne la choisira pas pour nous donner un patron de séquence génotypique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Probleme en biologie moleculaire

Techniquement oui on peut faire comme ça... si on a le génome de l'espèce qui nous intéresse. Pour remplir une fonction, une protéine doit avoir certaines séquences d'acides aminés bien précises, donc le gène correspondant doit avoir une séquence de nucléotides bien précises.  [...] Des logiciels spécialisés (il en existe plusieurs) vont essayer de retrouver ces séquences dans ton génome pour déterminer où sont les gènes et ce qu'ils font.  [...]