• Forum - Séquence, Fragments, Région

Urgent : Ssp Pcr

Low-stringency sequence-specific PCR (LSSP-PCR) is an example of a recent method that does not require additional biochemical treatments. The analysis of LSSP-PCR by capillary electrophoresis (CE) to discriminate the highly polymorphic mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region is described.  [...] The DNA from five individuals were amplified (first step) using sequence-specific primers to produce 1021 bp fragments containing the D-loop region. Each fragment was isolated by electroelution using CE and UV detection, and subjected to a second amplification (second step) using a single primer annealed under low stringency conditions.  [...]

Question idiote sur le génôme humain

En gros (et vraiment très gros). on tire dans le tas (tas d'ADN) et on séquence les fragments. ensuite avec des programmes, on aligne les fragments et superpose les régions identiques afin de reconstituer la frise.  [...] Remarque. On fait ici abstraction du fait que le génome contient beaucoup de séquences répétées. Il peut donc y avoir des superpositions de fragments alors qu'ils ne sont pas issus du même endroit… Les assemblages réalisés à partir de ces superpositions peuvent être erronés.  [...]

Alignement séquence (Bioinformatique)

J'aimerais savoir s'il y aurait un logiciel capable de relier tous ces fragments afin d'avoir une seule séquence de ma protéine. Présentement je le faismanuellement et c'est très long.  [...] Salut, oui il y a notre protéine que nous avons transfecté dans un plasmide. Nous l'avons verifier par blast avec la sequence de cette protéine de NCBI (reference). Et nous obtenons pleins de petits fragments d'alignement, ce qui est normal puisque lors du séquencage le logiciel fait pleins d'erreurs et donc l'alignement ce fait moins bien, ce qui crée ces fragments.  [...]

[Biotechnologie] Projet : mécanisme biologique et ses applications

Les régions flanquantes des microsatellites servent également d'amorces lors de la PCR. Une fois celle-ci réalisée, une électrophorèse sur gel d'agarose permet de séparer les différents fragments d'ADN en fonction de leur taille (donc de la taille de la séquence microsatellite).  [...] Le projet international HapMap est une initiative visant à relever et à cataloguer les similitudes et les différences génétiques entre les humains. Les connaissances acquises dans le cadre du projet HapMap permettront aux chercheurs de découvrir les gènes qui jouent un rôle dans la santé, la maladie et la réponse des individus aux médicaments et aux facteurs environnementaux.   [...]

Les bases constituant les protéines

Vu que les fragmentations sont aléatoires, on en aura entre chaque liaison peptidique, et donc on aura des fragments de tailles différentes. Ceci recoupe un peu le séquençage de Sanger où on a des fragments séparés d'une base et où on remonte à la séquence.  [...] Ici on fait pareil mais avec la masse séparant les fragments. Connaissant aussi la masse des acides aminés, on peut remonter ainsi à la séquence protéique. Je te passe la détermination des ions a, b, c, x, y, z ainsi que les fragmentations permettant de discriminer les acides aminés isobares.  [...]

[bio mol] Séquencage. RFLP

la sonde permet d'amplifier une séquence unique qui est situé en amont d'une séquence répetée. Le nombre de répetitions est différent selon les individus, on digére en amont de la sonde et en aval de la séquence répétée la taille du fragment sera variable selon les individus.  [...] RFLP pour polymorphisme (polymorphisme concernant les séquences répétées) des fragments de restriction (fragment contenant la séquence répétée+la séquence unique).  [...]

Séquençage [cours]

Néanmoins, on me dit que, par exemple pour une séquence. 5' G C T A C T C 3'. lorsque l'on utilise le ddATP, on obtient deux fragments. A T G A G et A G. Ce que je ne comprends pas, c'est.  [...] Comment peut-on obtenir DEUX fragments, ou plus suivant la séquence, alors que la synthèse est sensée se bloquer, par exemple dès qu'elle rencontre une thymine lorsque l'on utilise ddATP D'après la compréhension que j'ai de mon cours, j'aurais dit que j'obtenais A G seulement.  [...]

[Génétique] adn et police scientifique TPE help svp !

2) Lors de l'électrophorèse, on compare des tailles de fragments différentes mais, lors de la PCR on n'obtient pas DES fragments mais une seule et même séquence donc je ne comprends pas =/.  [...] 2) Si on n'utilise pas l'életrophorèse avec la PCR mais avec le Southern Blot, a quoi ça sert de multiplier des milliers de fois une séquence je pensais qu'on pouvais faire migrer ces fragments par milliers (de la PCR) avec l'électrophorèse et que comme ils ont la même taille, ça permettrais de voir à l'oeil nu si elle correspond à une séquence spécifique d'un éventuel suspect en les faisant migrer en même temps sur la même électrophorèse.  [...]

[Biologie Moléculaire] Questions relatives à la PCR

Les séquences Alu sont des fragments d'ADN d'environ 300 pb qui sont mobiles dans le génome humain. On y retrouve un site de restriction Alul (d'où leur nom). Certaines personnes possèdent la séquence Alu. d'autres non. L'expérience en question impliquait que plusieurs personnes effectuaient un rincage de leur bouche (pour aller recueillir de l'ADN) avec de l'eau saline et crachait dans un tube qui était ensuite centrifuger.  [...] Les séquences Alu sont des fragments d'ADN d'environ 300 pb qui sont mobiles dans le génome humain. On y retrouve un site de restriction Alul (d'où leur nom). Certaines personnes possèdent la séquence Alu. d'autres non.  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique SELEX aidez moi!

3. On disposent de fragments qu'on espère pouvoir exploiter pour obtenir la séquence consensus. Ce que l'on va faire c'est simplement un clonage des fragments. Des colonies seront piquées, amplifiées puis séquencées. L'analyse de toutes les séquences nous donnera la séquence consensus.  [...] Vous allez donc avoir une collection de fragments identifiés qui vont vous permettre de déterminer une séquence consensus de fixation.  [...]