• Forum - Séquence, Fixation, Protéine, Propre, Expression

Analyse Région intergénique

Dans mon cas précis, régions intergéniques autour du gène DnaA codant pour une protéine initiatrice de réplication chromosomique.  [...] j'aurai tendance a penser que si tu trouves une region conservée dans les regions intergenique tu as identifié un site important. Apres tu peux avoir, une region importante pour la regulation du gène (enhancer, silencer), ou des une region qui coderait un ARN non codant voir une proteine encore inconnue.  [...]

l'Homme, un programme ?

Ok, l'expression de l'operon se fera en fonction des differentes concentratons cellulaires de lactose et de W, mais cette regulation reste directement dependante de l'adn puisqu'elle se fait par la sequence adn 'opérateur'. Pr le lactose. augmentation de lactose -.  [...] fixation sur la proteine 'regresseur' qui annule son affinité pour la sequence 'operateur' et permet ainsi la transcription de l'operon. L'adn regule sa propre expression, mais le resultat est le meme (le metabolisme de la cellule est regulé par l'adn, qui se regule lui-meme en fonction d'un facteur externe).  [...]

Gel Shift : problème avec la compétition

Ca ressemble a une fixation non specifique de ta proteine sur l'ADN. As tu fais un temoin de binding de ta proteine sur une sequence d'ADN non specifique (different de la competition).  [...] D'autres études ont montré que ma prot liait une séquence d'ADN X et que cette fixation était spécifique. J'ai reproduit ses manip avec ma séquence d'ADN Y pour savoir si il y avait également fixation. J'ai obtenu un retard sur gel similaire mais pour des quantités un peu supérieures de protéine.  [...]

[Génétique] Stochasticité dans l'expression des gènes

Toutes ces modifications ne sont pas là par hasard puisque les enzymes brièvement citées sont elles même très finement régulées par les facteurs de transcription en ce qui concerne leur recrutement au niveau de gènes précis, mais aussi par leur propre expression et leurs modifications post-traductionnelles (phosphorylation, ubiquitinylation,  [...] Dans un certain nombre de cas limités, en effet, la mutation d'une base dans la séquence d'un gène peut aboutir à un phénotype malade, comme l'anémie falciforme. Cette maladie est due au fait que la molécule d'hémoglobine, mutée en un point précis de sa séquence, induit une conformation tridimensionnelle différente de cette protéine et modifie ces propriétés de fixation de l'oxygène.  [...]

[Biologie Cellulaire] question sur les séquences consensus

Par exemple. les sites de fixation d'une protéine. Si il est établie qu'une protéine peut se fixer sur plusieurs séquences d'ADN différentes mais proches, il est possible d'écrire une séquence type. Ainsi, si l'on veut savoir si nos séquences d'intérêt possède le site de fixation pour cette protéine, c'est une séquence consensus que l'on cherche.  [...] Xylem, la séquence dite Shine-Dalgarno est un motif ARN reconnu par l'ARN16s du ribosome chez les procaryotes. Elle participe donc à l'initiation de la TRADUCTION pour de nombreux gènes bactériens.  [...]

Concernant la transcription chez les eucaryotes...

. Je pense que c'est faux 2.)la tatabox est une séquence trés conservé du promoteur sur laquelle vient directement se fixer l'ARN polymérases deux..je pense que c'est faux car l'ARN polym va se fixer a d'autre protéines 3.)un enhanceur est un facteur de transcription capable de stimuler la transcription du gêne situé parfois trés loin de son propre site de fixation.. Je pense que c'est vrai.  [...] 2.)la tatabox est une séquence trés conservé du promoteur sur laquelle vient directement se fixer l'ARN polymérases deux..je pense que c'est faux car l'ARN polym va se fixer a d'autre protéines.  [...]

homéodomaine et protéine

dans mon cours de bio, on m'explique qu'un gène commande l'expression d'une protéine homéodomaine qui se fixe ensuite sur un site specifique de l'and, et est un facteur de traduction... en gors, il permet la traduction grace a de l'adn polymerase des genes qui suivent... je ne comprends pas bien.  [...] En simplifiant bcp, L'homéodomaine est une partie de la protéine qui va reconnaitre une séquence spécifique de l'ADN en amont d'un gène. Cette fixation va permettre la fixation du complexe d'initiation de la transcription et de l'ARN polymerase et le gène cible va être transcrit, puis maturé et traduit.  [...]

[Biologie Cellulaire] dégradation des protéines

Qu'est ce qui fait qu'une protéine cytosolique sera dégradée par le protéasome plutôt que par le lysosome ou inversement. Est ce que cela dépend de la séquence signal qui est démasquée.  [...] c'est l'article qu'il me fallait. Donc en fait selon la séquence présente dans la protéine, il y aura soit ubiquitination ou fixation par cette chaperonne.  [...]

technique du double hybride

En utilisant une séquence d'ADN codant pour un gène rapporteur sous le controle d'un promoteur activé par le facteur de transcription, on peut fixer la cible sur l'ADN via le domaine de liaison de l'ADN du facteur de transcription. Comme le système ne possède pas le domaine de transactivation, il n'y a pas d'activation de l'expression du gène.  [...] Ainsi pour avoir activation du gène rapporteur il faut une mise en contact du domaine d'activation au domaine de fixation. Ceci étant réalisé si il y a intéraction entre protéine X et Y.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gel de retard

Eske je peut trouvé quelqu'un qui peut m'expliquer la nature des interaction qui s'établissent entre ADN/protéines ARN/protéines lors de la migration sur un gel de retard.. merci d'avance.  [...] Le principe d'un EMSA, c'est qu'un fragment d'ADN lié à un facteur est plus lourd donc migrera moins vite qu'un fragment d'ADN seul, ce qui permet donc (avec les contrôles adéquats) de démontrer que telle protéine se fixe sur telle séquence, ou que telle séquence est un domaine de fixation d'un facteur,  [...]