• Forum - Séquence, Enzymes, Rôle

[Biochimie] Immunoblotting, anticorps

Ma question porte sur les anticorps qu'ils ont utilisés... Au lieu de prendre un anticorps contre tout l'enzyme (anticorps qui existe), ils ont préféré d'abord ajouter - par clonage - une séquence tag et ensuite utiliser un anticorps contre ce tag.  [...] En résumé de l'article. on sait que c'est une protéine transmembranaire, on a sa séquence donc on sait aussi qu'il y a 7 cystéines. Comme souvent dans les enzymes les cystéines ont un rôle important, le but de l'article est de le vérifier dans cette enzyme en particulier.  [...]

[Biologie Moléculaire] Prédiction de coupure d'un génome par des enzymes de restriction

Je me tourne vers la communauté pour savoir si l'un d'entre vous connait un site permettant de prédire le nombre de coupures d'un génome entier de bactéries (4Mb) par des enzymes de resctrictions.  [...] Un peu moins flexible quand au choix des génomes ou séquence et dans le choix des enzymes mais remplit bien son rôle, il m'a donné un début de réponse.  [...]

enzymes acides aminées

moi je pense que dans l'intro j'aurai brievement defini les ternes du sujet, genre (pas redigé bien sur ). il existe de nombreuses proteines (= sequence d'AA, AA=...) qui peuvent avoir differents roles. Parmis ces proteines, il y a les enzymes dont le role est.  [...] Et pour le plan j'aurai peut etre mis en premiere partie les differentes structures des protéines (primaire, secondaire, tertiaire). Et puis jsuis d'accord avec Gorben, il faut montrer l'importance de ces structures et que c'est la sequence en acide aminés (structure primaire) qui va determiner les autres structures (secondaire, tertiaire) et donc parler des sites actifs, et du fonctionnement générale d'une enzyme (enzyme/substrat).  [...]

[Biologie Moléculaire] Enzymes de restriction VS fragment d'ADN

Bonjour, j'aurais une question de novice sur les enzymes de restriction. En quoi le fait d'être un site palindromique du style ATAT rend une séquence vulnérable aux enzymes de restriction.  [...] Ça dépend des enzymes et certaines enzymes préfèrent certaines séquences à d'autres. Rien de rédhibitoire mais par exemple NotI aime bien avoir une séquence EcorRI à coté du site.  [...]

[Biologie Moléculaire] Choisir le bon vecteur?

aprè avoir copier votre séquence dans le logiciel, cliquez sur 2 cutter c en bas dans display. ça va vous donner les nom des enzymes qui coupent 2 fois sur la même séquence.. é puis revenez au menu principal et choisissez le vecteur que vous voulez.. aprez sur custum digest et mettez les nom des enzymes que vous avez trouvé précédement.. et voilà.  [...] vous pouvez utilisez 2 enzymes de restrictions aussi..mais cette fois vous allez remplacer une séquence du vecteur (elle va être coupée par 2 enzymes différents, chaqu'un d'un coté )par votre séquence d'ADN (qui va être aussi coupée par lé deux)...P.  [...]

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

Depuis juillet 1995, on a séquencé complètement 2329 génomes différents, à l'heure à laquelle je poste ce message, dont 134 génomes d'archées (5,8%), 2046 génomes de bactéries (87,8%) et 149 génomes (6,4%) d'eucaryotes (voir la base de données GOLD ). Tout cela est à comparer avec les millions d'espèces vivantes déjà répertoriées, sans compter les microorganismes ou les virus.  [...] En 1972, on connaissait 1770 réactions différentes catalysées par des enzymes (voir le site du NC-IUBMB ). En janvier 2012, on en connaissait 4585 différentes (voir le site de la classification MACiE ). On ne connaît la séquence d'acides aminés des enzymes impliquées que pour 2828 (61,7%) d'entre elles et parmi ces enzymes dont on connaît la séquence, seules 1776 (38,7%) de ces réactions ont également les structures cristallines des enzymes référencées.  [...]

Dénaturation de l'adn en pH acides

Certaines enzymes de restrictions ont des fréquences de coupures plus grandes suivant la complexité de la séquence reconnue.  [...] heu... ben southern blot c'est le nom de la methode. Le principe de la methode est d'hybrider une sequence d'ADN connue sur un pannel de sequence d'ADN inconnues (banque d'ADN, ADNg coupé par des enzymes de restriction, etc...) pour mettre en evidence la presence ou l'absence de la sequence connue.  [...]

[Génétique] adn et police scientifique TPE help svp !

3) Donc je pense peut-être qu'on coupe cette séquence de PCR (qui me parait pourtant déjà bien réduite) avec des enzymes de restriction pour ensuite pouvoir procéder à l'electrophorèse. Mais je sais qu'en criminalistique, on ne se sert que des introns (séquence non codante), (pour raisons éthiques) or je croyais que les enzymes de restriction étaient spécifiques aux gênes (or gêne absent sur les séquences non codantes) donc là aussi je bloque.  [...] 3) les enzymes de restriction ne sont pas spécifiques aux gènes mais à des séquences, si la séquence se trouve dans un intron, elle va couper quand même.  [...]

Conditions nécessaires a l'apparition de la vie ?

Il faut également des sulfures de métaux, qui comme on l'a découvert en 1988, on pu jouer le rôle de catalyseurs de réactions chimiques prébiotiques (en gros, ce seraient des proto-enzymes). En observant la vie actuelle, on observe l'importance des grappes (clusters en anglais) de FeS et de NiS dans les centres actifs des enzymes de tous les êtres vivants actuels.  [...] Autrement dit, il faut du NiS et/ou du FeS pour jouer le rôle de proto-enzymes pour catalyser des réactions. Il y a également tout un tas d'éléments qui devaient être dissous dans l'eau (sodium, calcium, etc...) pour que les proto-cellules puissent les adopter dans leurs fonctions métaboliques et autres.  [...]

[Biologie Cellulaire] signaux de retention ???

Mais certaines protéines sont vouées à rester dans le réticulum (par exemple, certains canaux, des enzymes, etc...). pour indiquer qu'elles doivent y rester, elles portent alors une séquence particulière appelée la séquence de rétention.  [...] Ainsi, elle va rester dans la réticulum. si jamais elle en sort par une vésicule, cette séquence va indiquer qu'elle doit y retourner. La séquence KDEL intéresse des protéines à l'intérieur de la lumière, tandis que la séquence KKXX intéresse des protéines transmembranaires.  [...]