• Forum - Séquence, Consensus, ARN

[Génétique] Adn et arn

Pour les deux brins, que ce soit le brin avancé et le brin retardé, il y a sunthèse d'une amorce d'ARN et c'est la primase qui synthétise ces amorces, et c'est l'ADN polymérase qui synthétise les deux brins (retardé et avancé) et qui a besoin d'une amorce pour fonctionnée (Toutes les ADN polymérases synthétisent l'ADN dans le sens 5'-3', chez tous les organismes vivants, et aucune n'est capable de commencer une nouvelle chaîne sans amorces.  [...] c'est l'arn plyerase 2 qui va detecter la sequence consensus a la region -35 et se fixé sur elle puis il a le facteur tf2 D qui va se lier a cette sequence puis les facteurs TF2 A, B,D, H.  [...]

séquence promotrice / séquence régulatrice

Dans le sens où les polymérases ont une affinité différentes en fonction de la séquence du promoteur (qui est un élément obligatoire pour la transcription.) on peut dire que le promoteur fait partie de la région régulatrice.  [...] exemple chez les eubactéries. Plus la séquence du promoteur est proche de la séquence consensus (TTGACA -quinzaine de nucléotides- TATAAT) plus l'affinité de l'ARN polymérase pour le promoteur est forte et plus il y a de transcription du gène sous contrôle de ce promoteur.  [...]

[Génétique] promoteur??

Cette séquence -35 présente un motif de six bases bien conservées. TTGACA. Enfin, à environ 10 nucléotides en amont de l'origine de la transcription, on retrouve un motif TATAAT. Cette séquence dite séquence -10 est appelée également boîte de PRIBNOW.  [...] une séquence de six nucléotides riche en A et T. La séquence dite consensus (statistiquement la plus rencontrée) est TATAAA. Cette boîte fixe un facteur général de transcription appelé TFIID (TF. facteur de transcription. II pour l'ARN polymérase II). Ce facteur est absolument nécessaire pour l'initiation de la transcription.  [...]

[Génétique] La transcription

Dans les séquences consensus l'une d'elle est apelé PRINBOW BOX qui posséde la séquence TATAAT et qui se trouve à -10.la 2eme est appelé région-35 et posséde la séquence TTGACA et quand donne par convenction le n°1 à la par de base qui débute une molécule d'ARN.  [...] il me semble que la séquence que tu donnes n'est pas la séquence consensus, mais l'exemple d'une séquence. par exemple, le spacer N 17 a une longueur qui varie entre 16 et 18, en fait. La séquence TATAAT est bien la séquence consensus, qu'on a déduite des différentes séquence à -10, qui varient légèrement selon l'espèce de bactérie et le gène considéré.  [...]

[Biologie Moléculaire] Site d'initiation de la transcription

Je sais que vers le -10 se trouve normalement la TATA box, séquence consensus permettant la mise en route de la transcription. l'arn polymérase ouvre alors la double hélice d'adn et débute son travail (après avoir recruter tous les facteurs de transcription).  [...] ..). S'il y a utilisation d'un point +1 en amont du promoteur considéré, alors ce promoteur est transcrit (dans ce cas là on ne dit pas que c'est un promoteur, c'est juste une séquence faisant partie de l'unité de transcription débutant par le point +1 considéré).  [...]

[Biologie Moléculaire] la transcription et la traduction à partir d'une séquence en bases

Donc c'est bien le brin du bas qui est copié par l'ARN polymérase (brin du bas = brin matrice), vu que le recopiage se fait par complémentarité, l'ARNm ainsi synthétisé correspond à la séquence du brin du haut (brin du haut = brin codant). Par contre, ne vous focaliser pas sur la recherche d'une séquence consensus comme la boite TATA, cela ajoute une complexité inutile pour répondre à cet exercice.  [...] Une petite remarque, la séquence TATAA qui est le meilleur consensus de la boite TATA est communément retrouvé dans les séquences d'ADN, cela ne veut pas forcément dire que c'est une TATA box.  [...]

Mutation?!

Si l'on parle de séquence consensus, on ne parle pas de séquences exactes mais de séquences approchées d'une séquence moyenne mais différant seulement par quelques paires de bases.  [...] Ce que je ne pige pas c'est la chose suivante. comment peux-tu affirmer d'un côté que c'est une séquence consensus et d'un autre dire que ça ne supporte aucun changement Cela signifierait que pour les promoteurs possédant TATAAA par exemple alors que la séquence consensus est TATAAT, on parlerait obligatoirement de mutation.  [...]

séquence consensus

Donc la seule chose que j'ai compris au cours c'est que la séquence consensus intervient dans la période d'initiation de la réplication... et je n'ai rien suivi de l'explication concernant cette séquence à cause d'un guignol qui avait décidé d' biiip tout l'amphi en parlant aussi fort que la prof.  [...] Les sites internet que j'ai pu visiter n'étant pas assez vulgarisés,je vous pose la question. qu'est-ce qu'une séquence consensus Comment la reconnait-t-on et de quelle manière intervient-elle dans la réplication.  [...]

[Biochimie] ARNm Bactérien.

Dans le cadre d'un exercice comme ici, les choses sont simplifiées et volontairement ciblées. On voit que les ARNm 2, 3, 4 et 5 ont vers leur extrémité 3' une séquence (AGAUAA) que ne possède pas l'ARNm 1. La poly(A) polymérase qui est une enzyme synthétisant la queue polyA chez l'eucaryote (les ARNm procaryotes n'ont pas de queue polyA) reconnait une séquence consensus AAUAAA, similaire à la séquence que nous retrouvons dans ton exercice.  [...] Ca dépend de l'exercice, s'il faut dans un autre exo, tu auras 1 ARNm procaryote et un autre eucaryote. Je pense que le but de l'exercice est de te faire repérer des séquence consensus que l'on t'a appris dans tes cours. Ces séquences consensus peuvent être spécifique d'un domaine phylogénétique (proca vs euca) mais pas toutes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique SELEX aidez moi!

3. On disposent de fragments qu'on espère pouvoir exploiter pour obtenir la séquence consensus. Ce que l'on va faire c'est simplement un clonage des fragments. Des colonies seront piquées, amplifiées puis séquencées. L'analyse de toutes les séquences nous donnera la séquence consensus.  [...] Vous allez donc avoir une collection de fragments identifiés qui vont vous permettre de déterminer une séquence consensus de fixation.  [...]