• Forum - Séquence, ADN, Site

[Biologie Moléculaire] Comment visualiser un nouveau site d'épissage?

Mais le problème, c'est que je n'ai que l'ADN du patient. J'ai la séquence de son gène GNAS et je voudrais juste, sans autre analyse biologique si l'on pouvait trouver l'apparition d'un site d'épissage.  [...] Si tu m'envoyes la sequence d'ADN je pourrais regarder si cela cree un site d'epissage altenatif. Maintenant ca ne sera qu'une prediction, et il restera a la demontrer.  [...]

cherche site séquences acides aminés

je ne trouve plus l'adresse du site qui me permettrait de trouver la séquence en acides aminés de façon automatique a partir de ma séquence ADN.  [...] Je ne connais pas de site dédié à ça, mais néanmoins je connais Anagène, un logiciel qui fait ce que tu demandes et bien plus.  [...]

[Génétique] nucleaire ou mitochondrial?

si j'ai une sequence d'adn comment puis je faire la difference entre une sequence provenant d'un gene nucleaire ou d'un gene mitichondrial si je ne veut pas utiliser le site de NCBI (blast).  [...]

[Biologie Moléculaire] Recherche site pour alignement et traduction

jusqu'à présent pour réaliser des alignements de séquences d'ADN et faire de la traduction j'utilisais le site d'infobiogen hébergé par un autre groupe depuis leur arrêt en France, ce qui était bien pour les traductions c'est que l'on pouvait avoir les 3 cadres de lectures simultanément avec en prime la séquence d'ADN.  [...] pour la traduction de tes séquences ADN il existe également ORFfinder sur le site NCBI qui va te permettre d'avoir des traductions dans les 6 cadres de lectures. Je l'ai beaucoup utilisé et il est très pratique. Sinon pour tes alignements de séquences en effet tu peux te servir de Bioedit qui est libre accès mais tu as également des outils comme Clustalw libre accès également sur internet ou ClustalX que tu peux installer en local.  [...]

[Biologie Moléculaire] Sites de restrictions proches sur vecteur

Je voulais donc savoir si BamHI peut cliver son site de restriction lorsque celui ci se trouve trop à l'extrémité d'un fragment d'ADN Je précise aussi que les 6 bases de la séquence palindromique de BamHI sont bien présentes après clivage par XhoI.  [...] Donc, j'avais 2 bouts d'insert. l'un étant 5'NdeI-NdeI, l'autre NdeI-XhoI-3'. J'ai d'abord inséré le dernier, j'étais sûre d'avoir mon insert correctement ligué. Puis, j'ai inséré le dernier bout et j'ai envoyé à séquencer. Le tout avait réussi du 2e coup, alors que NdeI est une enzyme un peu space.  [...]

Adn

sur ce site il est dis La structure primaire de l'ADN correspond donc à la séquence des paires de bases le long de la molécule.  [...] La structure primaire d'une séquence d'ADN est généralement donnée en 5' -. 3' et en simple brin, par souci de simplicité, étant donné que le second brin est complémentaire. Mais ce n'est pas toujours le cas et tu peux croiser des structures primaires par paires de bases (littéralement avec les sections des deux brins complémentaires).  [...]

[Génétique] C'est inscrit dans les gênes

Ce dernier est comme l'ADN, sauf que la Thymine est remplacée par l'Uracile. Donc l'ARN contient exactement la même information que le brin qui était en face du brin qui à servi de modèle (grâce à la complémentarité). Dans l'exemple de séquence que j'ai donné plus haut, si le premier brin d'ADN sert de modèle pour la synthèse d'un ARN, alors cet ARN aura la même séquence que le deuxième brin (sauf que T est remplacé par U). UUACGACGUU.  [...] Si la polymérase est parvenue à un endroit de la séquence d'ADN qui possède un G, il faut mettre un C en face, mais les autres types de nucléotides sont aussi présents dans cet environnement et viennent s'entrechoquer avec le site ou doit être incorporé le C.  [...]

L'ADN et l'ARN messager

En fait pas tout à fait, je suis désolée mon 1er post t'as induit en erreur. L'ARN doit contenir le codon AUG (méthionine) donc ATG en langage ADN. Mais ce codon se situe sur le brin non transcrit, puisque identique à l'ARNm. Le brin transcrit est donc le brin complémentaire, ayant le codon TAC.  [...] Non, l'ARNm est constitué de 3 parties. 5'UTR, la séquence codante (qui commence au codon AUG et se termine au codon stop) et la partie 3'UTR. AUG correspond au site d'initiation de la traduction, ce n'est pas le début de l'ARNm. Mais pour savoir quel brin d'ADN est le transcrit ou le non transcrit on se sert de ce codon.  [...]

ESE,ESS,ISE,ISS qu'est-ce?

Donc ces séquences vont soit favoriser le maintien de l'exon dans l'ARNm mature (ESE) soit induire l'excision de cette même séquence (ESS).  [...] Il faut savoir qu'un ESE peut aussi bien être un ESS mais cela dépendra des molécules qui s'y fixeront. Les facteurs se liant à ces séquences commences à être connu. Il existe même un site.ESE Finder qui te permet de vérifier si dans ta séquence d'ADN il ne s'y trouve pas de site potenciel correspondant à un ESE ou ESS.  [...]

[Génétique] Principe de la technique RFLP

La majorité de ces enzymes coupent le DNA une fois qu'ils ont reconnu une séquence particulière dans celui ci (par exemple l'enzyme EcoR1 coupe dès qu'il repère la séquence GATC).  [...] Grace a un ordinateur qui pouvait reperer les possibilité d'abolition ou de creation de site de restriction sur une sequence d'ADN qu'on a rentre au prealable on pouvait en quelques sorte triché.  [...]