• Forum - Séquence, ADN, Protéines

[Biochimie] etude de proteine de liaison à l'ADN

A priori je dirai immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), dont le principe consisite à fixer la séquence d'ADN à laquelle tu t'intéresse sur des billes d'une colonne de chromato, puis à faire passer dans cette colonne les protéines dont tu suspectes la liaison à la séquence considérée. Après élution, tu récupères la protéines liée.  [...] En gros, ta sonde libre va migrer en bas du gel, et en présence d'une interaction avec une protéine, le complexe ADN-protéine sera ralenti dans le gel puisque plus gros. il apparaitra une bande radioactive dite retardée.  [...]

système de double hybride

On a deux protéines d'intérêt humaine, PCR-1 (appat) et AST-1 (proie) que l'on étudie au laboratoire. On a leur séquence ADN (ADNc) sur un plasmide. Et on pense qu'il y a interaction de ces deux protéines dans la cellule humaine (colocalisation). On veut donc vérifier s'il y a réellement une interaction direct entre ces deux protéines, et pour cela on utilise les système double hybride.  [...] A coups d'ingénierie génétique (du clonage, simplement), on va fusionner la séquence ADN de GAL4BD à celle de PCR-1, pour que ces deux protéines n'en forme plus qu'une seule. On procède de même avec AST-1 et GAL4AD. On a donc la séquence de deux protéines chimères.  [...]

Combien de nucléotides ?

Un gène en gros c'est une séquence d'AA, si tu rajoutes des new AA même s'ils sont intégrés à l'ADN,ils doivent avoir des propriétés reconnues par la suites de la chaîne de transcription/traduction, pour que l'ADN avec ce AA soit interprétés en ARN puis en protéines.  [...] Un gène en gros c'est une séquence de nucléotides, si tu rajoutes des new nucléotides même s'ils sont intégrés à l'ADN,ils doivent avoir des propriétés reconnues par la suites de la chaîne de transcription/traduction, pour que l'ADN avec ce nucléotide soit interprétés en ARN puis en protéines.  [...]

[Génétique] Dynamique des éléments transposables ( transposons) !

Pour ceux sans LTR. sequence capable de se reproduire dans le genome en faisant transcription en ARNm puis traduction cytoplasmique en trois proteines et ces trois proteines vont s'attacher a l'ARNm, celui ci repasse dans le noyeau et la une des proteines coupe l'ADN a un endroit precis une autre (reverse transcriptase ) fait passer l'ARN en ADN et la troisieme (integrase) integre cet ADN dans le genome.  [...] Pour ceux avec LTR. et ben je comprend pas le mecanisme de reproduction dans le genome.J'ai note que c'etait pareil que pour les transposons sans LTR sauf qu'il n'y avait pas de passage en ARN mais ca me semble tres bizarre... comment coder de proteines si il n'y a pas de passage en ARN.  [...]

Qu'est-ce qu'un Element Transposable ?

Donc les protéines qui servent à la base de notre organisme sont en fait codées par une séquence d'ADN qui leur est propre (le gène).  [...] Au sens large, le génome est l'ensemble de notre séquence d'ADN. Je dis ça parce que si on prend notre ADN, seulement 1 à 2% sont occupés par ces gènes codant pour des protéines vu au dessus.  [...]

[Biologie Cellulaire] d'ou vient l'ADN mitochondrial

On a désormais cloné et séquencé le génome mitochondrial complet d'un grand nombre d'organismes différents et l'on a découvert que leurs ADN mt codent des ARNr, des ARNt et des protéines mitochondriales essentielles. Toutes les protéines codées par l'ADN mt synthétisées dans des ribosomes mitochondriaux.  [...] La plupart des protéines situées dans les mitochondries telles que les ADN et ARN polymérases mitochondriales, sont synthétisées dans des ribosomes cytosoliques.  [...]

Restitution organisée de connaissances niveau 1e S

expliquer, comment une séquence nucléotidique de l'ADN peut produire des protéines différentes.  [...] Il me semble savoir que c'est au moment de l'epissage que l'ADN prémessager peut être a l'origine de protéines différentes. Ce mécanisme de maturation alternative démultiplie les capacités codantes d'un gène.  [...]

transduction phagique

Les phages que tu récupereras, seront soit identiques à ton phage d'origine, soit contiendront des séquences d'ADN de ta bactérie qui se seront malencontreusement retrouvés insérés dans la séquence du phage en plus de leur ADN d'origine. Il est peu probable que l'ADN de ton virus d'origine ait perdu un morceau de sa séquence car les phages n'ayant pas la séquence entière du phage d'origine, ont une trop grande chance d'avoir perdu une séquence essentielle comme celle de la capside ou des protéines virales. C'est tout ce que je vois comme solution.  [...] merci pour ta réponse, mais imagine que j'utilise ce phage pour faire de la trasduction d'un plasmide. l'adn du phage contiendra non seulement les informations nécessaires à sa propre réplication mais également mon plasmide. Les régions qui appartenaient au plasmide ne sont donc pas essentielles pour le phage.  [...]

Quel avenir pour la biologie cellulaire ?

Vu sa petite taille, la quantité d'ADN qu'il peut transporter d'une cellule à l'autre dans sa capside (ultra-résistante) est toute petite. environ 4500 nucléotides (simple brin, cela prends moins de place). Cet ADN a été séquencé très rapidement, et deux gènes codants pour 7 protéines (merci l'épissage) ont été identifiés, puis confirmé par visualisation de ces protéines.  [...] L'AAV est très étudié depuis le milieu des années 80 car c'est un candidat potentiel pour la thérapie génique. Et puis, en 2010, trente ans après la découverte et le séquençage de ce virus, qui est étudié tout les jours, la surprise. Une équipe de recherche a découvert une protéine inconnue sur ces 4500 nucléotides.  [...]

Immunoprécipitation de la chromatine

Le protocole donné est. extraction de l'ADN depuis la cellule puis isolation de la chromatine que l'on souhaite- on retire les protéines fixées dessus puis on séquence l'adn.  [...] La ChIP permet d'identifier le site de fixation d'une protéine sur l'ADN. Il faut posséder l'anticorps spécifique de la protéine qui t'intéresse (ou alors exprimer une protéine taggée dans ta cellule et avoir un anticorps anti-tag). Donc tu extrais les complexes ADN/protéines des cellules, tu les découpes en courts fragments (qq centaines de paires de bases par exemple pour commencer) tu incubes avec ton anticorps.  [...]