• Forum - Séquence, ADN, Lecture

[Biologie Moléculaire] Lecture Sequence ADN et WB

-Premierement j'ai un doute concernant la lecture de sequence d'ADN, par exemple j'ai. ACTTCGTAG.. et ACTTCTAG.  [...] - Troisième question. l'IP vous dit quelle protéine on a immunoprécipité (ici DCC est immunoprécipitée), et WB vous dit quelle protéine a été marquée en western blot (ici p-y kinase). On utilise un anticorps polyclonal pour les immunoprécipitations et pour le western blot, si on détecte une autre protéine que celle immunoprécipitée, on utilise soit un monoclonal soit un polyclonal.   [...]

[Biologie Moléculaire] Lecture sequence ADN et codon initiateur

Le codon initiateur et le codon stop doivent bien être en phase avec le cadre de lecture. C'est à dire qu'il ne suffit pas de lire la séquence brut et de rechercher un ATG ou un STOP, il faut aussi connaitre le cadre de lecture.  [...] En revanche, l'inverse peut être exploité. Si vous savez que votre protéine débute ou se termine dans une région précise. Si vous ne voyez qu'un ATG ou un STOP là dedans alors il y a fort à parier que ce soit les codons pertinants et vous avez votre cadre de lecture.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène GH-25

- sur ton schéma, il ne s'agit pas de gènes à proprement parlé, mais de ce qu'on appelle des cadres de lecture ouverte (open reading frame), qui correspondent en fait à la séquence de l'ADN transcrit qui sera potentiellement codé en protéine (ou en peptide) et qui commence par le codon d'initiation.  [...] C'est souvent des outils bioinformatiques qui permettent d'identifier ces cadres de lectures ouvertes, qui donnent ensuite la possibilité aux scientifiques d'identifier des séquences codantes dans les génomes.  [...]

L'épigénétique

On est passé de 100000 théorique à 30000 vérifié chez l'être humain apres avoir sequencé son ADN. Les genes codent plusieurs fois. C'est peu.  [...] Mais si on part du fait qu'une proteine provient non pas de la lecture de l'adn d'un bout à un autre bout,mais au contraire d'un bout a à un bout b puis de là à ailleurs d' un bout n à un bout o et ainsi de suite,alors là les séquences répétitives peuvent jouer un rôle.  [...]

[Biologie Moléculaire] qu'est ce qu'une ORF?

Tout cela pour dire que la notion de séquence codante ne se superpose pas parfaitement avec la notion de cadre de lecture.  [...] On est bien d'accord mais comme t'avais mis ATG et non pas AUG j'etait en droit d'imaginer que c'etait une sequence ADN, et dans ce cas la il est normal de vérifier les 6 phases de lecture.  [...]

cadres de lecture et codon start

une question me trotte dans la tête depuis qq jours. comment est-il possible de lire une séquence d'adn suivant les différents cadres de lecture... ce que je veux dire c'est qu'il faut obligatoirement un codon start pour que la transcription puisse démarrer, donc il faudrait qu'en se décalant d'un cadre (soit d'un seul nucléotide) on retombe sur un codon start a chaque fois, a partir d'un codon start (je parle pour amorcer)...comment est-ce possible.  [...] Mais tu as raison, il y a bien 6 cadres de lecture théoriquement possibles sur un double brin d'ADN, 3 sur un ARNm. Mais ces capacités de codage sont rarement (jamais ) toutes utilisées. (en tous cas dans les génomes les plus évolués, où la fraction codante est très réduite – la compaction maximale est atteinte chez les virus, avec plusieurs cadres de lecture chevauchants).  [...]

ARN bicat?

L'existence d'ARN bicatenaire signifirait que celui-ci serait capable de se répliquer... ce qui est totalement inutile pour la cellule... on aurait 2 ARN provenant d'un même brin d'ADN evc des séquences nucléotidiques complémentaire donc une cadre de lecture totalement érroné de l'un des 2 brins.  [...] Dix pour cent des gènes souris seraient régulés par ces mécanismes. Ils participeraient également à la régulation de la transcription au niveau en agissant sur la chromatine. Ces découvertes sont relativement récentes et l'utilisation d'ARN double brins (RNA interférence) pour provoquer la dégradation d'ARNms cibles est actuellemnt largement utilisée, que ce soit en recherche fondamentale ou appliquée.   [...]

BLAST x

De BLAST x, je sais qu'il traduit notre séquence requête dans les 6 cadres de lecture avant de les comparer à la base de données.  [...] 1 ère question. pour travailler sur les 6 cadres ouverts de lecture, BLAST recréé le brin complémentaire de la séquence requête.  [...]

DM 1ère S biologie

Phase codante, car on peut lire une séquence nucléique selon 3 phases, puisqu'il s'agit de triplets (en décalant chaque fois d'une base le début de la lecture). Mais une seule de ces phases, commençant au codon initiateur, code pour la protéine.  [...] une erreur qui provoque un décalage du cadre de lecture et donc qui te donne la mauvaise séquence... tu fais du frameshift sans le savoir.  [...]

[Biochimie] idéé générale svp

la lecture de la solution d'ADN s'effectue contre un blanc,que contient celui ci.  [...] Les deux messages ont un contenu différent. le premier doit être posté en rubrique exercices. Il faut par ailleurs que tu montres que tu a cherché et où ça bloque. Personne ne fera l'exercice entièrement à ta place, comme il est indiqué en-dessous du titre de la rubrique.   [...]