• Forum - Séquence, Acides aminés, Unité

ATPsynthétase source d'energie et de surchauffe cerébrale =)

J'aimerais bien trouver la séquence en acides aminées (ou en nucléotides) de la sous unité C de la partie F0 de l'ATPsynthétase (d'E.coli par exemple), mais je ne sais pas comment m'y prendre.  [...] Je me suis dejà dirigé vers la base de données PBD mais je ne connais pas encore tout ses travers, penser vous que si je trouve la séquence nucléotidique ou en acides aminés de la sous unité C, je pourrais la comparer à la base de données afin de trouver des homologies avec d'autres molécule susceptibles de pouvoir protoniser elles-aussi.  [...]

Import/export pore nucléaire

ah d'accord je comprend ^^ Merci beaucoup pour toutes ces infos en revanche j'ai un peu de mal à saisir une chose, quelles sont les protéines dites ribosomales qui servent à la formation du ribosomes et qui sont importées dans le noyau Car pour moi un ribosome est formé des ces 2 sous unités (ça on l'aura compris ^^), je sais également qu'a chaque sous unité s'associent des polypeptides (49 pour la grande sous unités et 33 pour la petite il me semble) c'est ces protéines la qui sont importés dans le noyau (celles dont on parle depuis le début en fait...).  [...] En effet, ce sont ces protéines qui forment un complexe avec chaque sous unité. Il me semble qu'on en a 34 pour la grande sous unité, et 21 pour la petite sous unité, dans l'ensemble, elles assurent une meilleur cohésion du ribosome, et permettent sa structure 3D, mais les protéines de chaque sous unité ribosomique n'interagissent qu'assez peu avec les protéines de l'autre sous unité ribosomique, elles possèdent un rôle assez important dans la traduction de l'ARNm en mettant en relation cette structure avec l'ARNt qui va apporter les acides aminés (grossièrement dit).  [...]

Génétique

5. cistron est generalement un gene appartenant a un opéron...maintenant la definition exacte varie pas mal selon les personnes. Je pense que tu parles du Wobble qui est le fait que certains ARNt ne s'apparient que sur 2 des 3 nucleotides du codon.   [...] Pour le trinôme ARNt,etc j'aimerais savoir si l'ARnt est spécifique d'un acide aminé donné ou s'il peut se fixer à plusieurs acides aminés.  [...]

ribosomes

En fait les ribosomes sont constitués de 2 sous-unités d'ARN ribosomique ou ARNr. C'est la grande sous-unité du ribosome qui possède les sites de fixation de l'ARNt au codon de l'ARNm et de catalyse de la liaison peptidique entre les acides aminés.  [...] Chez les eucaryotes le ribosome est consituté de deux sous-unités appellées 40S (petite sous-unités) et 60S (grande), de même chez les procaryotes qui ont des sous unités 30S et 50S.  [...]

Codon initiateur et protéine

Les bactéries possède en amont du codon start AUG (donc dans le 5' UTR) une séquence RBS (Ribosome Binding Site) qui permet de recruter la sous-unités 30S du ribosome. Le RBS bactérien est appelé Séquence Shine-Dalgarno et c'est un motif riche en purine. La séquence Shine-Dalgarno permet le recrutement de la sous-unité 30S car celle-ci possède un ARNr 16S qui a une séquence Anti Shine-Dalgarno (ASD).  [...] Mais, c'est du racolage.. Comment dans une science aussi précise que la génétique, on dis que les exons se regroupent comme si on avait coupé les bords d'un pain de mie Moi je vois l'ADN comme une séquence de nucleotides agencés précisément, alors rassembler des nucleotides qui a la base ne sont pas côte à cotes je ne vois pas bien.  [...]

CANAUX IONIQUES transport passif SOS

Y a un truc que je comprend spas dans mon cours, il est dit que les canaux cationiques ont une structure générale similaire constitués notamment de 4 sous-unités (ou domaines), chaque domaine étant constitué de 6 segments il est dit que ces segments tout comme les domaines sont hydrophobes mais après il est dit que les 2 premiers domaines sont constitués de 6 segments.  [...] Maintenant imagine chaque sous unité en tant qu'enchainement d'acide aminés. Chaque sous unités est donc formé comme tu le dis de 6 segments transmembranaires.  [...]

[Biochimie] chaine polypeptidique

je veux savoir ce que c'est que les sous unité d'une chaine polypeptidique, est ce les acides aminées qui la compose et aussi dans un resultat d'electrophorese comment reconnaitre le nombre de chaines polypeptidique ainsi que le nombre de sous unite.  [...] La spectrométrie de masse permettra de déterminer finement le nombre et l'agencement des séquences d'acides aminés mais c'est une action dénaturante donc pas moyen de déterminer la structure quaternaire (bien que certaines personnes pratiquent de la spectrométrie de masse native.  [...]

Un prob a resoudre

- il faut une sequence consensus pour faciliter l'accrochage de la petite sous-unite du ribosome (sequence Kozak) qui comporte au moins 6 nucleotides (soulignes) et peut-etre que 9 c'est mieux (3 entre parenthese).  [...] Apres 14 annees d'efforts, on extrait de l'hypothalamus une hormone proteique constituee par la condensation de seulement 3 molecules d'acides aminés.La sequence de ce tripeptides est Glu-His-Pro.  [...]

[Biologie Moléculaire] Le ribosome: une fonction unique ou des fonctions multiples?

Par example chez les bactérie, le ribosome a besoin d'une séquence partcilière située sur l'ARNm pour pouvoir se fixer. On appel cette séquence SD du nom de son decouvreur(s) (Shine-Delgrano). cette sequence est complémentaite a une region de l'ARNr 16S l'appariement permet alors l'attachement de la petite sous-unite du ribosome sur l'ARNm.  [...] Enfin il semble que le repliement des protéines commencent a l'interieur meme du ribosome. Le polypeptide en élongation, sort du ribosome par un tunnel, qui couvre environ une trentaine d'acides aminés. Or des études structurales en cryo-microcopie électronique, indiquent que le peptide en élongation acquiert sa structure 3D a l'interieur de ce tunnel.  [...]

Les différences en traduction génétique entre bactérie/eucaryote

Sur cette ARN polycis. se trouve des sequence type SD ( shine delgano me semble ) sur lesquels vont se fixer les ribosomes et initier la traduction.  [...] Chez les procaryotes, la petite sous unité reconnait une sequence (shine-delgarno) située quelques nucléotides avant le codon AUG. cette sequence interagit avec l'ARNr 16S et permet de definir le codon d'initiation.  [...]