• Forum - Séparation, Fragments, ADN, Grande taille

[Biologie Cellulaire] vie

svvvvvp, je veut vous demander de m aider a me donner des noms des labo ou je peut faire un stage de 1mois pendant les vacances d'Été en tt ce qui est biologie.moléculaire, microbiologie,biotechnologie... etc,,a metz ou a des endroit pres de metz. je suis une étudiante en 1ere année biotechnologie et je doit faire un stage car c est important pour la vie professionnels plus-tard,car le nombre de stage que je ferai pendant mes premiers 3 ans a une grande influence dans mon cv et ce que m intéresse le plus c que il augmente mon chance de continuer mes études et d être accepter dans un cycle d'ingénieur ainsi que pour le choix de mon spécialité,je doit pratiquer pour que je puisse choisiiiiirrrrrrrrrrrrrrrrrrrr,svvvp j ai besoin de votre aide c.  [...] Le TAE possède le plus faible pouvoir tampon mais produit une meilleure séparation pour les fragments d'ADN de grande taille.  [...]

Acides Nucléiques

L'ADN est chargé négativement. La séparation se fait en fonction de la taille des fragments qui diffère d'un seul nucléotide entre chaque bandes les plus proches visible sur le gel.  [...] Salut. Au moment de la migration, la charge est identique pour chaque fragment d'ADN car la préparation de ton ADN pour l electrophorese sert justement a masquer la charge réel de tes fragments afin que ces derniers aient tous la même charge fictive et migrent uniquement selon leur poid moléculaire.  [...]

Demande d'aide pour un exercice

Le critère de séparation des fragments est leurs nombres de paires de base. L'électrophorèse sépare 11 fragments d'ADN. Grâce à des marqueurs de poids moléculaires, on estime leurs longueurs comme variant de 220 à 260 paires de bases. Les différentes bandes ou fragments identifiées sont ensuite découpées dans le gel d' agarose.  [...] Il faudrait tester la reproductibilité de l'expérience pour confirmer les résultats obtenus. De plus, afin de valider l'aspect sinusoïdal de la courbe et aller dans le sens de l'hypothèse émise que le pas est bien de 10 nucléotides, il faudrait refaire l'expérience en incluant un plus grand nombre de fragments de tailles différentes.  [...]

[Biochimie] anti LC3 humain aucun marquage en Western blot

J'ai essayé avec du cerveau de souris (censé etre un bon temoin positif). Toujours rien à la bonne taille. La technique de western n'est pas en cause car le marquage actine est impecable. Le LC3 est sensible à la degradation, donc les extraits sont realisés en presence d'inhibiteurs de proteases.  [...] Mon collègue fait un gel à 12.5% mais tu peux pousser jusqu'à 15% vu que les fragments sont de petite taille, tu auras une meilleure séparation.  [...]

biochimie

Une même quantité de DNA double brin d'un virus est complètement hydrolysée par différentes enzymes de restriction utilisées seules (digestions simples) ou conjointement (digestions doubles). Après séparation par électrophorèse en gel d'agarose, la taille des fragments générés est estimée (tableau ci dessous).  [...] C) Donner, en justifiant, la structure de ce fragment de DNA double brin sachant que la séquence ci-dessus appartenait à un DNA double brin obtenu lors de l'attaque de l'extrémité d'un DNA linéaire par l'enzyme de restriction BbvI qui reconnaît le site.  [...]

[Biologie Moléculaire] pcr

plus ils sont petits et plus ils migrent vite vers la partie inférieure et positive du gel. C'est donc au cours de la migration que se fait la séparation entre ton ADN de départ (très grosse molécule qui restera en haut du gel) et les amplifiats (fragments plus petits qui seront plus bas dans le gel).  [...] Plus on a d'ADN et plus la coloration est intense. Très souvent, la quantité d'ADN de départ est trop faible pour être détectable par cette méthode et on ne verra donc sur le gel que les amplifiats dont on estime la taille par comparaison avec les fragments de référence du marqueur.  [...]

[Biochimie] differencier deux gel d'agarose de concentration différente

l'utilisation de gel d'agarose à forte concentration (3 à 4%) est nécessaire pour des fragments inférieurs à 150 pb, car elle permet une meilleure séparation et résolution des différentes bandes en fonction de leur différence de taille.  [...] Concernant la fin du message, utiliser une concentration forte permet de mieux retenir les petits fragments, c'est donc indiqué lorsq'on a des fragments de taille inférieure à 150 pb. On perdra alors les plus gros, qui migreront très peu (voire pas du tout) et ne seront pas séparés.  [...]

Extraction d'acides nucléiques

J'aurais voulu connaître succinctement les principes généraux (et pas les protocoles..) des méthodes d'extraction de l'ADN plasmidique, ADN totaux, ADN chromosomique, ARN. Parmis les ARN peut on séparer les ARNr, ARNt et ARNm.  [...] LA séparation ADNg et plasmide se fait essentiellement sur la capacite de la soude d'attaquer plus rapidement l'ADNg que le plasmide (miniprep). Mais aussi sur le fait que l'ADNg se fragmente tres facilement vu sa taille.  [...]

[Evolution] Combien de temps pour une adaptation...

Juste pour savoir comment il faut répondre. par bénéfique tu entends conservation des espèces Par ce que du point de vue de l'évolution ça n'existe pas un effet bénéfique. On pourrait même dire que les diminution de taille des populations favorise la spéciation et donc paradoxalement augmenterait la biodiversité.  [...] Par contre la diminution des effectifs des populations, la séparation de population de petites taille, liée à la fragmentation des habitats, favorise forcément les effets de dérive génétique.C'est l'effet fondateur. Cela permet à une population de se scinder en plusieurs et d'explorer des voies adaptatives différentes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Temps de migration de long fragments d'ADN

Pour les grands fragments il faut passer par une électrophorèse en champ pulsé pour les séparer convenablement dans un gel d'agarose. Pour le gel il me semble évident qu'il faut prendre le moins concentré, 0,5-0,6%. Le temps de migration c'est au feeling. Vous faites migrer une ou deux heures, vous regardez sous UV, si ce n'est pas bon, vous refaites migrer etc.  [...] tu peux faire une electrophorese normale avec un gel 0.3prcent grand format a 30V pendant 14-16h, et tu obtiendras un beau gel avec une belle separation. En ce qui concerne les marqueurs tu peux aussi utiliser de l'ADN de Lambda clive avec Xho1 tu obtiendras trois jolies bandes.  [...]