• Forum - Régions, ADN, Facteurs

[Biologie Moléculaire] Chip-Chip et Transcriptome

Le chip on chip sert principalement à étudier les régions d'ADN qui sont régulées par des facteurs de transcriptions protéiques.  [...] On identifie ces facteurs notamment par analyse du génome (informatique et autre) puis on effectue la technique du chip on chip en utiliant, comme tu l'as dis, des anticorps spécifiques de ces facteurs de régulation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéines se liant à l'ADN???

Les promoteurs étant des régions de l'ADN fortement modulées par des facteurs trans, cette banque de données te fournira déjà pas mal d'informations sur ce que tu recherche. Promoter database. Cette banque de données est vaste. En plus si tu veux fouiller un promoteur, tu peux aller chercher des régions à -10000 ou plus, c'est énorme.  [...] en fait, j'ai une séquence d'ADN et je voudrais savoir le ou les éventuels facteurs qui peuvent se fixer dessus pour une régulation de la transcription.  [...]

Sensibilité et hypersensibilité à la Dnase I

Salut à tous. Je voulais savoir qu'elle est la différence entre la sensibilité et l'hypersensibilité à la DNase I. Je sais que c'est en rapport avec la structure de la chromatine et l'accessibilité de facteurs de transcription à certaines régions de l'ADN mais je n'arrive pas a voir la différence entre les deux. Merci.  [...] les gènes inactifs ne sont pas sensibles, donc, où il n'y a pas la fixation des facteurs géneraux de transcription.  [...]

Comment un gène s'exprime dans une cellule ?

Chaque gène est précédé d'une ou plusieurs séquences promotrices. Ce sont des régions sur lesquelles vont venir se fixer des facteurs de transcription, qui vont soit stimuler soit inhiber l'expression du gène en amont. Un facteur de transcription stimulateur va permettre la liaison de l'ARN polymérase qui crééra la séquence ARNm complémentaire de la séquence d'ADN du gène.  [...] ce n'est pas toute a fait exacte un gène est constituer d'une suite d'introns (séquence non codante) et d'exons (séquence codante) prenons un Gene A I=introns et E= exons.   [...]

[Vignettes cliniques] Approche systémique de la physiopathologie pour les étudiants en Médecine

les principales hormones T4 et T3 sont des hormones globalement apolaire qui agissent comme facteurs de transcription à l'intérieur de la cellule (contrairement aux hormones peptidiques, qui agissent en surface). Elles ont de nombreux effets sur les tissus, et la diversité des effets rencontrés dépend de la distribution différentielle des récepteurs et de leur isoforme, qui vont sélectivement aller se lier dans des régions différentes de l'ADN et moduler la transcription de gènes spécifiques à l'organe ou au système.  [...] L'hypothyroïdie est souvent accompagnée d'une athérosclérose augmentée, qui s'explique par plusieurs facteurs (augmentation de la pression diastolique et du taux de cisaillement, dysfonctions endothéliale, augmentation de l'homocystéine et de l'inhibiteur de l'activateur du plasminogène 1 (PAI-1) sériques, et de la protéine C-réactive (CRP).  [...]

[Biologie Cellulaire] Histones méthyltransférases de novo dans la différenciation cellulaire

Lors de la différenciation, les marques épigénétiques de différenciation cellulaire par excellence, mais surtout les marques durables voire définitives sont les méthylations. Ces modifications post-traductionnelles entraine une fixation stable de l'hélice d'ADN avec les histones et donc une compaction chromatinienne permanente de ces régions, rendant l'ADN inaccessible aux facteurs de transcription.  [...] En effet, qu'est ce qui va déterminer le fait qu'elles éteignent certains gènes plutôt que d'autres selon le ou les facteurs de transcription actifs (là j'ai ma petite idée... ) En plus selon la ou les lysines méthylées sur certaines histones, le comportement épigénétique de la région ainsi marquée est différent.  [...]

[Génétique] Adam et Eve ....

.. dans le corps), molécules mutagènes, facteurs de stress (thermique, chimique,...), erreurs de ségrégation des chromosomes. Le hasard intervient toujours mais ce n'est pas un bruit blanc. Par exemple, dans des conditions stressantes, des processus en cascades arrivent à une situation où il y a plus de mutations (moins de réparations par exemple).  [...] Autre effet non aléatoire (mais là je m'avance peut-être, les biologistes me corrigerons si je dis une bêtise) les gènes fortement exprimés sont plus susceptibles de mutations cas l'ADN est alors déroulé et plus exposé à divers facteurs mutagènes. Par contre, la sélection elle agit beaucoup plus sur les gênes (ou sur les zones de régulation) important ou fortement exprimés (en éliminant nombre de mutations) que sur des gênes aux effets mineurs ou sur les régions non codantes.  [...]

[Génétique] Régions régulatrices facultatives et facteurs tissus spécifiques???

Si tu parles de facteur tissus spécifique je comprend moi que tu parle de facteur de transcription qui n'esxiste que dans un seul type de tissus. Ces facteur activeront donc des génes propres a ce tissus. Ex. Myo D est un facteur tissus spécifique du muscle strié.  [...] Les région regulatrice facultative sa doit être les enhancers et tout le reste ces a dire des région qui ne sont pas necessaire à la transcription du géne (régulation on/off) mais qui module cette réglation (on/off) On niveau 3/5 par ex.. Enfin là ces très théorique et imagé se que je dis hein.  [...]

[Biologie Moléculaire] Quelques questions de biologie moléculaire

3) Les télomères et centromères constituent l'hétérochromatine constitutive avec l'ADN compacté. Il y a peu voire pas de gènes dans ces régions et donc pas d'ilots CpG (car ils sont en amont des gènes). Or la méthylation de l'ADN ne se fait que sur les cytosines de ces ilôts CpG.  [...] a savoir que le fait qu'il s'agisse de region AT riche est justement bon contrairement a ce que tu crois pour le compactage car le chromosome en ecouvillons est permis par la topoisomérase II qui reconais des sequences SAR (scaffold attachement region) qui son AT riche et ceci permet un compactage supplementaire d'un facteur 30 a 40 (56*30=1600*compacté en tout ) et l'enroulement solenoide permet un compactage *5.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

La diminiution de substrat est l'une des nombreuses causes possibles mais la plus fréquente, si tu continues dans le joyeux monde de la bio tu verras à quel point les systèmes de régulation enzymatiques sont complexes même sans ajout de cofacteur ou d'autres enzymes.  [...] Comme il le précise en théorie rien n'est définitif. Pour ce qui est de la capacité d'un facteur à lier l'ADN, nous sommes dans un cas particulier. En effet, les protéines lient l'ADN grâce à des motifs en doigt de zinc. Ce sont des régions riches en cystéine qui, par regroupement de 4 cystéine ou 2 cystéines/2 histidines stabilisées par un ion Zn2+ permettent la formation d'une structure en boucle qui peut interagir avec le sillon majeur de l'ADN.  [...]