• Forum - Région, Plasmide, ADN

recherche sur les cancers des végétaux

Bon pour faire très simple, Agro bactérium est un phytopathogène qui possède un plasmide apellé plasmide Ti. Sur ce plasmide tu as une région que l'on apelle ADN-T pour ADN Transféré... Lorsque la plante est blessée, elle émet des facteur moléculaires qui permettent à Agrobatérium de venir au niveau de la partie blessée, et de tranférer cet ADN-T aux cellules de la plante (c'est résumé très rapidement et n'hésites pas à demander si tu veux plus de détails).  [...] Tu sais peut-être que la croissance des végétaux est régulé entre autre par la balance auxine/cytokinine, et bien l'ADN-T possède justement des gènes permettant la synthèse de ces hormones végétales. Donc en gros lorsque Agrobactérium transfère son ADN-T à la plante, il dérgle complètement la régulation de la croissance de la plante.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr

Voilà, je n'ai pas compris la correction d'un TD à propos de la PCR. Par le fait que l'on utilise des amorces oligonucléotidiques de synthèse, il est possible d'ajouter des séquences dans la région 5' de chaque amorce. Par exemple, un site de restriction aux 2 extrémités du fragment d'ADN synthétisé permettrons ultérieurement d'assembler le produit PCR dans un plasmide.  [...] C'est simple. l'amorce s'hybride partiellement, la partie qui contient le site de restriction et qui est donc indépendant de la région à amplifier dépasse.  [...]

transgenèse

Oui. Par ex., le plasmide Ti d'Agrobacterium tumefaciens est utilisé comme vecteur mais avant il doit être désarmé, on lui retire sa région vir pour lui oter son pouvoir pathogène.  [...] Sur ce plasmide Ti existe également cette fameuse région vir (pour virulence) qui joue un rôle dans le mécanisme de transfert de l'ADN-T et qui doit bien rester présente pour que ça marche.  [...]

[Biochimie] Linker, enzyme de restriction and co

Un polylinker est une région d'un plasmide contenant plein de sites de restriction, souvent uniques. Ce sont ces divers sites qui sont reconnus par les enzymes respectives. Tu peux rencontrer aussi le terme MCS, pour Multiple Cloning Site (ou Site de Clonages Multiples).  [...] Beh même si tu mets 3L de ligase, tu n'auras pas de clonage Excepté le cas où une recombinaison peut se produire entre une région du plasmide et l'insert et à condition que l'ADN linéaire que représente ton insert ne soit pas détruit, tu pourras éventuellement avoir un truc recombinant.  [...]

transduction phagique

Les phages que tu récupereras, seront soit identiques à ton phage d'origine, soit contiendront des séquences d'ADN de ta bactérie qui se seront malencontreusement retrouvés insérés dans la séquence du phage en plus de leur ADN d'origine. Il est peu probable que l'ADN de ton virus d'origine ait perdu un morceau de sa séquence car les phages n'ayant pas la séquence entière du phage d'origine, ont une trop grande chance d'avoir perdu une séquence essentielle comme celle de la capside ou des protéines virales. C'est tout ce que je vois comme solution.  [...] merci pour ta réponse, mais imagine que j'utilise ce phage pour faire de la trasduction d'un plasmide. l'adn du phage contiendra non seulement les informations nécessaires à sa propre réplication mais également mon plasmide. Les régions qui appartenaient au plasmide ne sont donc pas essentielles pour le phage.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problèmes: Recombinaison d'un plasmide

Lorsqu'on incorpore un gène dans un plasmide disponible dans le commerce, on aimerait insérer le moins d'ADN supplémentaire possible en plus du gène réel avec son promoteur. Parfois, cependant, il n'y a pas de séquence de restriction appropriée dans la région avant et après le gène qui peut également être trouvé dans le plasmide.  [...] Une fois ta PCR faite, tu digères tes fragments avec les 2 enzymes et pareils avec ton plasmide. Quand tu choisis tes sites il faut que tu vérifies l'ordre dans lequel les sites de restriction sont présents sur le plasmide. Dans notre cas, il faut que EcoR1 soit avant HindIII et le tout après le promoteur déjà présent sur le plasmide (sinon ton insertion se fera à l envers). Donc il faut que ton plasmide ait.  [...]

[Génétique] plasmide ADN distinct de l'ADN chromosomique

j'ai pas bien compris la définition du plasmide,surtout quand ils disent que c'est une molécule d' ADN distinct de l'ADN chromosomique.  [...] Les plasmides sont des molécules d'ADN, généralement circulaires, et capables de réplication autonome, que l'on trouve surtout chez les bactéries. Ils existent dans le cytoplasme en plus du chromosome cellulaire (d'où le distinct dans ta définition) comme tu peux le voir ici.  [...]

[Biochimie] Calcul d'une concentration en ADN

Le but de l'exo est de déterminer la quantité d'ADN plasmidique dans une solution de 100mL. On sait que la taille du plasmide est de 3500pb. On introduit dans la solution des enzymes qui détachent les sucres, bases et phosphates les uns des autres, puis on détermine qu'il y a 9,8g d'unité osidique dans la solution.  [...] J'ai compris comment déterminer la masse d'ADN pr ésent dans la solution, à partir de la masse d'unités osidique. J'ai également compris comment déterminer la quantité de matière de plasmide à partir de la taille de celui-ci et je vous en remercie d'ailleurs car c'était pas gagné.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transformation chez la bactérie ?

Si ton ADN est un plasmide, et alors il peut rester (et être répliqué) sans s'intégrer au gnome de la bactérie.  [...] Si ca n'est pas n'est pas un plasmide, il peut être intégré de facon site-spécifique, si l'ADN en question contient une séquence particulière homologue de certaines régions du chromosome bactérien (attention, ca n'est pas un crossing-over. ce terme est réservé à la recombinaison homologue lors de la méiose chez les eucaryotes uniquement).  [...]

[Biochimie] Manipulation de l'ADN: plasmide

L'intérêt est de couper ET notre morceau d'ADN d'intérêt ET le plasmide avec le MÊME enzyme de restriction. Ainsi lorsqu'on les mets en présence l'un de l'autre, ils auront tendance à s'attacher et nous permettre de refermer le plasmide nouvellement constitué.  [...] Le plasmide étant constitué d'ADN tu as besoin d'une origine de réplication afin de permettre aux polymérases de le reproduire dans la bactérie. Si le morceau d'ADN ajouté code pour une protéine, la présence d'un promoteur et d'un terminateur te permettra d'activer la production de la protéine à partir du plasmide.  [...]