• Forum - Reconnaissance, Séquence, ADN

[Génétique] Questions d'approfondissement diverses et variées

* Est-ce que quelqu'un aurait des infos sur le mode de reconnaissance de l'ADN non étranger par le transformosome de H. influenzae Je sais qu'il y a une séquence particulière de 9 nucléotides qui est reconnue, mais comment.  [...] * Comment est assurée la protection des îlots CpG au niveau du 5' d'un gène chez l'humain Je m'explique. La fréquence attendue du dinucléotide CpG dans le génome humain est de 4%. or, ce que l'on a observé (LE papier sur le génome humain séquencé de Nature), c'est que cette fréquence est de 1/5 de la valeur attendue.  [...]

[Génétique] Fermeture éclair à Leucine

Je sais que la fermeture éclair à leucine permet la dimérisation de 2 fos ou de Fos/Jun grâce à une reconnaissance d'une séquence de l'ADN. Par contre je n'ai pas bien compris. est-ce qu'il faut toujours qu'il y ai une séquence palindromique où celle ci n'est nécessaire que pour les homodimères Où est-ce que cela dépend du complexe qui se fixe.  [...]

Structure d'un phage

Mais ou se trouve la fameux site cos qui rend possible l' empaquetage de l'ADN dans la capside et à quoi sert t il dans le clonage.  [...] Le phage possède bien un ADN double brin linéaire et ses extrémités sont les séquences COS (séquences cohésives d'ADN simple brin qui font 12 bases). L'ADN du phage peut donc se circulariser grâce aux COS. On peut empaqueter in vitro de l'ADN exogène dans l'ADN phagique tout en conservant les régions COS, le phage encapside par reconnaissance des régions COS puis après infection sur des bactéries l'ADN se re-circularise dans son cytoplasme.  [...]

[Génétique] Différences recombinaison homologue/illégitime

J'ai toujours pensé que la recombinaison homologue se faisait par reconnaissance d'une (ou deux) séquences spécifique entre les deux fragments d'ADN en jeu.  [...] Selon ton raisonnement, dans le cas d'une double recombinaison homologue, seule la séquence encadrée par les 2 séquences appariables s'introduirait dans l'ADN chromosomique ( pour être tout à fait sûr ).  [...]

Comment est fait un promoteur ?

Globalement, on caractérise les promoteurs forts ou faibles par la fréquence d'initiation par la polymérase. L'enjeu de cette fréquence se retrouve en partie avec les facteurs transcriptionnels, mais aussi la boîte TATAA dont la séquence, qui varie légèrement d'un gène à l'autre, est plus ou moins efficace dans sa reconnaissance par l'ARN polymérase.  [...] La force des promoteurs depends de la sequence des boites -10 et -5 mais egalement de l'ecartement entre ces 2 zones. Une -35 modifiée fixera moins bien la RNA pol, un ecartment trop grand ou trop petit entre la -10 et la -35 ne premettra pas une bonne reconnaissance de la region par la RNA pol.  [...]

[Biochimie] Enzyme de restriction

Le cas le plus utilisé en biotech, c'est les enzyme de type II qui vont couper à l'intérieur de la séquence de reconnaissance. C'est en général une séquence d'environ 6 nucléotides et une séquence palindrome, c'est-à-dire que les deux brins, lus dans le même sens (3'-. 5' par exemple) vont donner la même séquence.  [...] Du coup si on nous dit qu'une enzyme coupe la séquence 5'CCCAAA en son milieu, elle coupera aussi une séquence 5'AAACCC (vu qu'elle coupe 3'AAACCC) ou elle différenciera une paire de base AC d'une paire de base CA dans le grand sillon.  [...]

[Génétique] Matrice adn simple brin

Ce que je n'ai pas très bien compris c'est que il y a une réplication qui permet à partir d'une molécule d'adn d'obtenir deux molécules d'adn mais cette première molécule comment a elle été synthétisée.  [...] en fait tu as ton adn double brin qui est ouvert par des hélicases et sur un des deux brins (celui avec les sites de reconnaissance) se fixera l'adn pol qui va répliquer l'adn.  [...]

[Biologie Moléculaire] Arrêt de la fourche de réplication chez coli

Pour la spécificité la seule solution c'est reconnaissance d'une séquence particulière avec une amorces complémentaires qui se fixerait au simple brin après l'hélicase et avant l'ADNpol, c'est à dire au niveau de la flèche (photo en pièce jointe). Le problème c'est si tu le fait in vivo ça risque d'être difficile d' injecter mass amorces sans nuire à la bactérie.  [...] Sinon, mettre un Ter au niveau de l'ORI... Ca risque de ne pas trop aimer, les positions de l'ORI et du Ter sont précises et ont une importance chez E. coli. Ensuite, tu peux spéculer avec une introduction d'un dimère de T et une mutation dans une protéine de reconnaissance du dimère de T.  [...]

Bibliothèque de biologie/santé

Des liens seront bien sûr rajoutés régulièrement, et n'hésitez pas à me faire parvenir vos adresses intéressantes pour que je puisse les intégrer et enrichir la bibliothèque.   [...] La génétique est une discipline passionante mais particulièrement complexe et en pleine mutation suite au séquençage des génomes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Sachant que la TATAbox a une importante composition en A/T, la TBP devrait avoir un site complémentaire à cette séquence. Cependant, la séquence concensus de la TATAbox peut légèrement varier. Donc il pourrait y avoir quelques problèmes si la reconnaissance ne se faisait qu'en fonction de la complémentarité selon moi.  [...] Non, il existe ce que l'on appelle des séquences DNA-binding, càd spécifiques à la séquence nucléotidique d'un ADN et la reconnaissant, ce qui permet la fixation.  [...]