• Forum - Reconnaissance, Facteurs, Promoteur

[Biologie Moléculaire] promoteur = séquence cis régulatrice et enhancer/silencer = facteur trans régulateur ?

J'ai toujours du mal a comprendre le rôle réel d'un promoteur, car je trouve différente définition sur le net. Dernièrement j'ai lu qu'un promoteur agissait comme une séquence cis régulatrice ( en réalité ils avaient écris facteurs cis régulateur) mais je pense que c'est une erreur car un promoteur ne code pas pour une protéine (facteur), ils disaient que les promoteurs sont reconnu par des facteurs spécifiques reconnaissant les nucléotides de la séquence promotrice et ainsi venait s'y fixer (protéine) pour la régulé donc on comprends pas là que ceux sont des facteurs trans-régulateur codé par une séquence codante (exon) pour réguler l'expression d'un gène en se fixant sur la séquence promotrice en l'inhibant ou en l'activant (stimulation), donc du coup un promoteur est le nom donné aux séquences cis régulatrice et les facteurs trans régulateurs sont les noms données aux enhancers et silencer.  [...] Est ce quelqu'un pourrait réellement me dire qu'elle est le rôle, la fonction d'un promoteur mise a part le fait qu'il permet la reconnaissance du gène a transcrire par l'intermédiaire du facteur de transcription qui vient s'y fixer pour que l'ARN Polymérase 2 viennent s'y fixer.  [...]

[Biologie Moléculaire] Facteur de Transcription et Cofacteur de Transcription (incompréhension)

Je voulais savoir qu'est ce qu'un facteur de transcription concrètement Dois-je comprendre que sans facteur de transcription il n'y aurait pas de transcription et que l'ARN Polymérase est non seulement ADN dépendante mais également Facteur de Transcription dépendante car c'est elle qui permet la reconnaissance du promoteur et sa fixation au promoteur pour imiter la transcription.  [...] De plus j'aurais aussi voulu savoir qui code pour ces facteurs de transcription (ma supposition. des facteurs en trans donc des gènes de type intron Merci pour vos futures réponses.  [...]

Facteur sigma

L'ARN polymérase procaryote est composée d'une enzyme-cSur (E) et d'une sous-unité sigma. Chez Escherichia coli, il existe 7 facteurs sigma qui permettent la reconnaissance spécifique d'une classe de promoteurs. Le facteur sigma70, protéine indispensable, contrôle l'expression de la majorité des gènes au cours de la phase de croissance.  [...] L'entrée en phase stationnaire ainsi que certaines conditions de stress permettent l'induction du facteur sigmaS qui contrôle alors l'expression de nombreux gènes impliqués dans des fonctions comme la résistance aux stress, la réparation de l'ADN ou la virulence.  [...]

[Biologie Moléculaire] ARN non codant qu'elle est l'intérêt pour une cellule ? A quoi sert-il ?

Donc si je comprends bien ton exemple avec l'ARNr 16S qui est une sous unité de l'ARNr elle a pour rôle de reconnaitre le site d'initiation de la traduction sur un ARNm en faite elle a un peu le même rôle qu'un facteur de transcription qui permet la reconnaissance du promoteur pour une ARN Polymérase qui elle est incapable de reconnaitre le promoteur d'elle même c'est ça Il me semble d'ailleurs que l'ARNr est composé de 2 sous-unités 1 grande sous-unités et 1 petite sous unités non qui forme un espèce de diaphragme et que genre la petite sous-unités se fixe en premier suivie de la grande juste derrière et que l'ARNr est synthétisé dans le Nucléole par une ARN Polymérase 1.  [...] _ Pour la transcription, il faut une ARN polymérase (= complexe enzymatique protéique) qui se débrouille seule chez les proK pour initier une transcription. Chez les euK, il y a différentes ARN polymérases qui nécessitent chacune l'intervention de facteurs de transcription pour initier celle-ci.  [...]

Mutation?!

Est ce que cela n'est pas dû au fait qu'il y ait plusieurs promoteur Donc si il y a mutation dans l'un d'eux, la polymérase ne reconnaîtra pas un promoteur mais reconnaîtra un autre Enfin c'est une hypothèse car je ne sais même pas si il y a plusieurs promoteur (Et même promoteur pas les alternatifs) qui précedent un gêne.  [...] Par ailleurs, il existe des promoteurs TATA-less (LXR doit en connaître un bout ), donc la TATA-box est une séquence de reconnaissance au niveau du promoteur parmi d'autres.  [...]

Comment est fait un promoteur ?

Globalement, on caractérise les promoteurs forts ou faibles par la fréquence d'initiation par la polymérase. L'enjeu de cette fréquence se retrouve en partie avec les facteurs transcriptionnels, mais aussi la boîte TATAA dont la séquence, qui varie légèrement d'un gène à l'autre, est plus ou moins efficace dans sa reconnaissance par l'ARN polymérase.  [...] La force des promoteurs depends de la sequence des boites -10 et -5 mais egalement de l'ecartement entre ces 2 zones. Une -35 modifiée fixera moins bien la RNA pol, un ecartment trop grand ou trop petit entre la -10 et la -35 ne premettra pas une bonne reconnaissance de la region par la RNA pol.  [...]

le monde végétal:système immunitaire chez les végétaux?

En théorie, toute molécule étrangère devrait pouvoir entraîner une reprogrammation et un déclenchement de l'expression des gènes de défense. Cette reconnaissance génétiquement simple déclenchée par la simple interaction récepteur/ligand, a besoin de co-facteurs cellulaires qui sont les cibles de facteurs de virulence.  [...] La revue traite de la reconnaissance des éliciteurs et comment la protéine R est activée. Elle traite également des mécanismes en aval de cette reconnaissance.  [...]

[Biochimie] Synthese protéique

Ce sont les facteurs de croissance, liposolubles ou hydrosolubles, qui vont venir, soit traverser la membrane plasmique de la cellule par lipodiffusion, et trouver un récepteur cytosolique qui va lui ( facteur de transcription), entrer dans le noyau grâce à un NLS ( signal de reconnaissance) et venir transcrire la séquence spécifique d'ADN.  [...] soit donc aussi par transduction, le facteur de croissance, vient rencontrer un récepteur membranaire, et par effet TRANS, par des cascades de réactions cela va entrainer, la phosphorylations de protéines G cytosoliques puis la phosphorylations de kinases qui vont elles phosphoryler des facteurs de transcriptions qui vont donc eux aussi transcrire une séquence d'ADN.  [...]

[Biologie Cellulaire] brin sens/antisens

L'ARNpol va glisser sur l'ADN double brin avant de reconnaitre un promoteur (type boite TATA). Une fois la reconnaissance faite, elle va ouvrir ton ADN afin de transcrire le brin matrice.  [...] Il est donc tout à fait probable que ton ARNpol reconnaissance la boite TATA sur le brin sens.  [...]

Mutations silencieuses

Comme le montre l'étude de Montera et coll. (J Med Genet, 2001), cette mutation affecterait une séquence régulatrice de l'épissage (normalement reconnue par SRp40, un facteur de régulation de l'épissage) et nécessaire à la reconnaissance de l'exon 16 (voir figure).  [...] Des séquences exoniques ou introniques de 5 à 10 nucléotides, appelées séquences régulatrices de l'épissage, jouent un rôle important dans la reconnaissance des sites d'épissage par le spliceosome. Ces séquences, qui peuvent être proches ou éloignées des sites d'épissage qu'elles contrôlent, sont reconnues par des protéines appelées facteurs d'épissage qui aident au recrutement local du spliceosome ou au contraire empêchent ce recrutement (rôle enhancer ou silencer ).  [...]