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ADN et protéines

3. La mutation de l'ADN se passe sur un codon d'un acide aminé du site actif de la protéine. Beaucoup de protéines ont une fonction enzymatique qui leur permet de catalyser une réaction chimique. Cette réaction se fait lorsqu'un substrat spécifique entre en contact avec une poche de la protéine appelée site actif.  [...] Il doit aussi exister des cas plus compliqués où un acide aminé serait un site d'une modification post-traductionnelle nécessaire au fonctionnement de la protéine (glycosylation), mais on rentre dans des détails plus compliqués.  [...]

turn over des protéines

Il me semble qu'il est difficile de répondre à cette question. La demi-vie d'une protéine ou d'un ARNm va dépendre d'un nombre considérable de paramètres de nature diverse, lesquels peuvent varier d'un moment à l'autre. De plus, parler des protéines en général, c'est un peu vaste, non Bref, merci de préciser ta question.  [...] ce que je voudrais c est un site (comme saccharomyces genome database), dans lequel on aurait pour chaque protéine (ou arn) et dans un contexte bien défini (milieu, conditions...), la demi vie.Ceci tiré des différentes publis sur la protéine ou l'arn. mais vu votre réaction je suppose que ca n existe pa.  [...]

[Biochimie] nomenclature

salut tout le monde, j'ais une question pour les biochimistes versés dans la biologie végétale par rapport à la signification de codes du genre (EC 3.2.1.91) pour la cellobiohydrolase qui est une cellulase.   [...] Il y a probablement un site sur lequel tu peux trouver toute l'arborescence. En général, le premier chiffre correspond au type de réaction catalysée, le deuxième précise le mécanisme de recombinaison, le troisième le substrat de l'enzyme dont il est question et le quatrième l'organisme dont on a isolé la protéine (de souvenirs).  [...]

Insuline et pH

Si tu prends l'insuline par voie oral elle va arrivé dans la circulation général avec une perte de son efficacité on parle de métabolisation post systémique car au niveau du foie et du rein notamment mais également poumon et cerveau tu as des enzymes qui vont entré en interaction avec le principe actif de l'insuline c'est a dire la structure actif de cette protéine on identifie 2 phases.  [...] Phase 1 qui est la Réaction de Fonctionalisation qui dépend de la CYP450 a ce niveau là tu as sois une modification soit une création au niveau du site fonctionelle de la protéine. oxydation par une monooxgénase, réduction par une réductase, hydroxylation par une hydroxylase etc.  [...]

[Divers] Arsenic

-Les protéines coagulent quand la concentration en arsenic inorganique est forte. réaction arsenic/liens sulfures ou réaction arsenic/site actif.  [...] Après plusieurs semaines, suite à l'exposition initiale, l'arsenic s'accumule dans les tissus ectodermes en raison de la forte concentration de protéines contenant du soufre dans ces tissus. L'arsenic, par divers procédés, diminue la respiration cellulaire, ce qui peut conduire à l'hémolyse et à des lésions possibles des reins et du foie, en raison de l'accumulation de débris de globules rouges dans ces organes.  [...]

[Biologie Moléculaire] kinase

La phosphorylation entraine un changement de charge de la proteine qui lui meme provoque des changements de conformation, qui peuvent, a leur tour, permettre la liaison d'autres proteines a la proteine nouvellement phosphorylee. Schematiquement, on peut imaginer la kinase comme un interrupteur qui, lorsqu'on appui dessus (l'active) peut simplement allumer une lumiere (resultat de la phosphorylation d'un substrat) ou mettre en route un mecanisme plus complexe pour effectuer une action (cascade de reaction lorsqu'une kinase active une autre kinase qui etc...).  [...] Un test que tu peux tenter juste pour savoir si ta proteine est phosphorylee et dans le cas ou tu peux immunoprecipiter ta proteine est de faire une immunoprecipitation dans differente condition de stringence et incuber ton immunoprecipitation dans un tampon de reaction adequate pour les kinases avec de l'ATP32.  [...]

Le sexe de l'enzyme ?

Les deux en fait, si tu parles de la protéine, de sa structure tu dis une enzyme, si tu parles de son activité ou des réactions quelle catalyse tu dis un enzyme.  [...] Mais maintenant qu'il a été prouvé qu'une molécule autre qu'une protéine peut avoir des activités catalytiques, comment définit-on une enzyme Est-ce toujours une protéine catalysant une réaction chimique ou toute molécule biologique catalysant une réaction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réactions in cis in trans

J'ai une présentation à faire sur un article scientifique (en anglais évidemment... elle part par gagnante ma présentation ) et on m'y parle à plusieurs reprises de réactions in cis et in trans. Pour replacer le sujet, il s'agit d'une enzyme de restriction de type IIF, qui coupe un plasmide supercoiled possédant 2 site de restriction pour la-dite enzyme.  [...] If an enzyme must bind two sites before cleavage, the cleavage rate in cis reaction for two-site substrates will be much higher than in trans reaction for one-site substrates.  [...]

[Biochimie] Expérience sur les processus d'apparition de la vie. - Page 2

Les aminoacyl-ARNt-synthases chargent un acide aminé spécifique sur le site accepteur d'un ARNt spécifique. Il est notable qu'on se retrouve une nouvelle fois devant un catalyseur. On potentialise une réaction thermodynamiquement spontanée. On peut imaginer que d'autres catalyseurs, non biologiques, puissent permettre la réaction.  [...] Les aminoacyl-ARNt-synthases chargent un acide aminé spécifique sur le site accepteur d'un ARNt spécifique. Il est notable qu'on se retrouve une nouvelle fois devant un catalyseur. On potentialise une réaction thermodynamiquement spontanée.  [...]

[Biochimie] Les proteines

J'apporte justement quelques précisions sur la structure au cas ou. Les protéines sont en effet des molécules (des polymères) constituées d'acides aminés. pour les reconnaître il te suffit de regarder la structure de la molécule, les acides aminés sont composé comme leur nom l'indique d'une fonction acide, d'une fonction amine, et d'un reste (qui varie selon l'acide aminés).  [...] Ces acides aminés sont liés par une liaison peptidique qui est le résultat de la réaction entre la fonction acide carboxylique (COOH) du premier acide aminé et la fonction amine (NH2) du deuxième. Tu as donc maintenant toutes les clés pour reconnaitre une protéine.  [...]