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[Biologie Moléculaire] calcul d'efficacité de PCR

merci pour ce doc j'y avais déjà jeté un oeil mais ce qui me chagrinais c'est qu'il parle de C0 (concentration initial connue par l'expérimentateur) dans leur explication, et dans leur exemple il aborde que le passage le calcul de l'efficacité de la PCR avec le standard la myoglobine donc la concentration est connue en revanche pour le gène X rien.  [...] Comme dit au dessus, pour calculer l'efficacité d'une PCR, pas besoin de connaitre la concentration exacte de ton échantillon standard. Tu peux par exemple attribuer une valeur arbitraire 1 au standard non dilué, puis faire les dilutions comme ca te chante par la suite (dilution en série par 4 ou 10 ou autres), et le calcul de la pente te permettra de calculer l'efficacité.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gammes pour calcul de l'éfficacité de la RT-qPCR

dans le labo je fait mes calculs de quantité relative sans le calcul de l'efficacité, cet-à-dire, j'utilise E=2 (efficacité = 100%), mais si je veux faire ces calculs de la quantité relative avec la vrai éfficacité ( E differente de 2), je peux utiliser la même formule R=E^-deltaCp sauf que en se cas le E est differente de 2.  [...] L'efficacité est propre a un protocole donné, c'est à dire amorces, mix réactionnel et programme d'amplification. La seule façon de calculer l'efficacité d'une PCR est de faire une gamme de concentration en parallèle des échantillons pour chaque couple d'amorces utilisé.  [...]

[Biologie Moléculaire] Efficacité PCR quantitative

J'ai fait un petit résumé en PDF sur le calcul de l'efficacité. J'espère que ca t'éclairera. Je pense que ca peut etre utile pour comprendre le principe de la QPCR.  [...] Car une chose m'intrigue. lorsqu'on fait le calcul pour savoir de combien doit être la pente pour avoir une efficacité maximale égale à 1 (donc dans le cas ou E est compris entre 0 et 1) et bien on tombe sur une pente = -1 / log 1 qui mathématiquement impossible.  [...]

BPH- Fibre nerveuse PA

Mais maintenant qu'en est il du calcul a faire dans la question 2 Comment calcul t-on l'amplitude en mV du potentiel d'action Ainsi que le début de la question Je comprend ce qu'il faut faire mais pas a quoi cela correspond./.  [...] Il n'y a pas de calcul à faire pour la question 2. Si tu as pu répondre à la question 1, la question 2 est une déduction logique. Tu connais les intensités qui ne provoquent pas le potentiel d'action. Tu connais aussi celles qui le provoquent. Ce qu'on te demande est tout bonnement d'encadrer la valeur seuil, c'est-à-dire la valeur limite à partir de laquelle le potentiel d'action est provoqué.  [...]

qPCR

Déjà, premier truc, on utilise pas 2 dans la methode du, tu dois utiliser 1+ l'efficacité de tes amorces (et déjà etre sur que tes amorces on une bonne efficacité qui est bien proche de 1 ), ducoup 1+ efficacité te donne quelque chose proche de 2, c'est pourquoi on parle de la methode des, mais il faut utiliser dans chaque calcul, l'efficacité que tu as calculé pour ton couple d'amorce,, si tu n'as pas calculé celles ci, il faut le faire car si l'efficacité est eloignée de 1 ce n'est pas bon et il te faut choisir d'autres amorces.  [...] Tu ne peut vraiment pas te passer de calculer l'efficacité des amorces avant de faire du quantitatif, enfin je ne le concois pas, c'est comme faire une PCR classique et oublier de mettre le BET (ou autre colorant) dans le gel, et dire après je ne vois rien c'est dans mon echantillon ya pas le gène en question.  [...]

Les questions fondamentales en biologie

La Vie, organisée en cellules assemblées. Intention d'efficacité dans un milieu de plus en plus riche, donc, nécessité d'adaptation, et nécessité interne de centralisation, contrôle et calcul. D'où deux types de mutations, les unes liées à la pression adaptative et les autres neutres.  [...] Une nécessité de centralisation, je suis pas sûr que ce soit une adaptation très efficace à partir d'un certain point (voir les réseaux ferré, l'irrigation des feuilles,...). de contrôle (de même, voir les PC parallèles notament). de calcul (je pense que c'est pareil).  [...]

[Biologie Moléculaire] Efficacité PCR temps réel

Il faut faire super attention avec l'efficacité dans les PCR en temps réel, qui dépend fortement de la façon dont tu places ton Ct (et le calcul de l'efficacité diffère parfois selon les machines. Notamment celui de Stratagène). Il peut arriver que tu aies des efficacités de 103, 104% voir plus.  [...] la question est comment calculer l'efficacité de la PCR en temps réel, (chimie Taqman) j'ai trouvé plusieurs formules mais je ne sait pas quelle est.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fréquence de sites de restriction

Je ne comprends pas ce calcul. Je ne vois pas en quoi diviser le nombre de fragments générés (si ou coupe à 100% d'efficacité) avec la probabilité de couper donne quelque chose ressemblant à un rendement.  [...] C'est pour cette raison que je pose la question. Encore, on m'aurait demandé de faire un calcul en bonne et due forme d'activité enzymatique comme en bioch, je veux bien comprendre pourquoi je le fais. Mais ça.  [...]

[Biochimie] Rendement d'acide acétique

Je trouve un problème dans le calcul du rendement d'acide acétique qui peut etre obtenu de 1kg de glucose en supposant 90% d'éfficacité pour les 2 processus de conversion(glucose à l'éthanol, et l'éthanol à l'acd.acétiq).  [...] quel quantité de CO2 (en g et en l) sera libérée.   [...]

[Biologie Moléculaire] Calcul d'efficacité nécessaire en TaqMan ?

Là, je ne cherche pas midi à 14 h, j'utilise les kits commerciaux prévus à cet usage de A à Z. En revanche, une technicienne de mon labo qui a l'habitude de la PCR quantitative m'affirme qu'en TaqMan, contrairement au SYBR Green, on n'a pas besoin de faire de test d'efficacité.  [...] tu as besoin du cacul d'efficacite de PCR (en taqman ou pas) si tu compare 2 PCR (2 couples de primer) differents et que tu veux relativiser l'un par rapport a l'autre.  [...]