• Forum - Quantité, ARNm, Protéine

[Biochimie] Corrélation ARNm et protéine

une question me vient à l'esprit en lisant quelques articles. la surexpression d'une protéine implique-t-elle obligatoirement une augmentation de la quantité de l'ARNm ou peut-elle résulter, par exemple, d'une augmentation de l'activité ribosomale.  [...] Donc, en fin de compte, pour évaluer la surexpression d'une protéine, une QRT-PCR, par exemple, ne suffit pas. Même si la quantité d'ARNm est identique à celle du contrôle cela ne veut pas forcément dire que la protéine n'est pas surexprimée.  [...]

Expression d'un gène

Un gène qui s'exprime très fortement est un gène dont le produit final (ARN ou protéine) est présent en grande quantité. ça veut dire que le gène est fortement transcrit (et dont l'ARN qui en résulte est grandement traduit si c'est un ARNm).  [...] Concrètement, ça veut dire que tu peux avoir, sur un gène donné, de multiples ARN polymérases qui se suivent les unes derrière les autres, pour générer en un temps réduit un grand nombre d'ARN (quel que soit le type d'ARN). A un niveau très très intense, cela peut donner lieu à une structure dite en sapin de Noël (mes excuses pour cette illustration de piètre qualité).   [...]

[Biologie Cellulaire] molécule intervenant dans la mise en place des feuillets embryonnaires

pour préciser les termes qui vous posent problème. d'abord, je ne sais pas si c'est très clair pour vous d'origine maternelle, cela signifie que le gène était déjà transcrit dans l'oeuf, avant la fécondation. L'ARNm et/ou bien la protéine (suivant le cas) était déjà présent en quantité dans l'ovocyte, c'est à dire dans son cytoplasme.  [...] Plus précisément ici, il est dit que la protéine VegT est surtout accumulée dans le cytoplasme (de l'ovocyte) au niveau cortical (c'est à dire en périphérie, cortical vient de cortex), dans l'hémisphère végétatif. Par autodétermination de l'endoderme, effectivement on entend que ce facteur est l'un de ceux qui vont intervenir dans la formation de l'endoderme.  [...]

[Génétique] Relation mutation phénotype

Il nous faut dessiner l'ARNm correspondant et la protéine correspondante. Déjà là j'ai un doute sur ce que j'ai mis. Est-ce que c'est.  [...] mutation ponctuelle dans séquence régulatrice 5' -. + ou - d'ARNm donc + ou - de quantité de protéine. La protéine est présente et fonctionnelle. Elle est capable de réagir avec l'anticorps.  [...]

[Génétique] Démonstration du role d'un miRNA in-vivo

Dans mon cours ils ont fait les constatations suivantes, c'est chez le pétunia. ils ont surexprimé le gene d'interet et sur northernblot, ils ont vu qu'il y avait une diminution de la quantité d'ARN.  [...] 1. surexprimer le miRNA (tu vérifies que tu as bien surexpression par qPCR), et regarder si cela a un effet sur ta quantité de protéine en WB. et si oui si tu as un phénotype lié. En général, ils montrent que la protéine est diminuée mais pas l'ARNm, encore caractéristique de l'action des miRNAs ou l'ARNm n'est pas dégradé mais simplement pas traduit.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcription ARNr/ARNm

3% contre 30%... Ca fait quand même un facteur 10 Peux-tu expliquer pourquoi une quantité si minime te paraît plus normale Il ne faut pas perdre de vue les gènes ne codant pas pour des protéines, mais qui sont quand même exprimés. donc, donnent des ARNm non traduits.  [...] *d'abord. pour les chiffres une autre réalité me revient. c'est la taille de chaque ARNm en effet chaQUE ARNm code pour une protéine bien déterminée donc a une taille bien déterminée et différente d'autres ARNm d'ou peut-on quantifier toutes l'es ARNm pouvant coder pour toutes les protéines dans une cellule sachant que cette traduction n'est pas simultanée c.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gene-ARN-Proteine

Oui jai bien compris le dernier paragraphe... Mais le premier pas trop mais je ne veux pas compliquer les choses./ tu dis que Et un de ces ARNm donne aussi plein d'exemplaire de la même protéine... plein d'exemplaire de quoi si c'est plein d'exemplaire d'arn, alors un de ces ARNm donne plusieurs d'exemplaires d'ARN, non non la je me perds.  [...] Non tu as un ARNm provenant d'un gène. Et cet ARNm donne une protéine en plein d'exemplaires = la même protéine mais en plein de fois.  [...]

mesure de l'expression d'un gene

En fait, je crois que la PCR quantitative est plus fine pour quantifier, mais comme le northern, cette technique va m'indiquer la quantité de proteine présente à un temps t, or je veux connaitre le taux de transcription d'un ARN et pas sa concentration.  [...] gloups en effet j'ai tapé un peu vite, pour Run ON et PCR quantitative c'est pour l'ARNm et pas la proteine sorry mais ce que je voulai dire c'est que oui la PCR est plus fine mais c'est une mesure de la quantité globale d'ARN aussi fine soit elle. Le RunON dose l'ARN transcrit pendant un temps t, et comme je veux connaitre mon taux de transcription, c'est plus adapté non.  [...]

[Biochimie] Expression protéique

Le fait que l'ARNm soit présent n'indique pas grand chose, sauf qu'effectivement ton promoteur fonctionne correctement. Il se peut que ta séquence soit mutée conduisant a un mauvais repliement et à l'élimination de la protéine avant même sa mise en fonction. As tu séquencé ta séquence d'adn.  [...] Une question importante qui n'a pas été posée. l'ARNm est-il fortement exprimé ou peu Je ne sais pas si tu as quantifié sa présence en faisant une qPCR mais selon le nombre de cycles où sort ton gène, on pourras te dire si tu peux t'attendre à détecter une protéine ou pas.  [...]

ARN traduction protéique

Les ARNm qui ont une durée de vie courte ont une région riche en A et en U dans la région 3'. Des protéines spécifiques peuvent s'y fixer pour réguler la vitesse de dégradation de l'ARNm. Cette vitesse de dégradation changera donc pour chaque l'ARNm différent selon l'importance de ses régions riches en A,U et la présence de protéines régulatrices.  [...] La séquence riche en A et en U (ARE) se trouve dans une région non traduite en 3'. C'est à partir de cette région que la dégradation des ARNm va commencer. Les protéines qui agissent sur ces séquences régulant la durée de vie de l'ARNm contrôlent la quantité de protéines traduites.  [...]