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[Biologie Moléculaire] Taux d'expression de gènes et fonction des protéines...

Suite à une expérience incluant un traitement A et un traitement B sur des animaux, je travaille sur l'expression de gènes qui codent pour des protéines dont la fonction est connue. Je trouve des différences significatives entre les taux d'expression de gènes des individus ayant subi le traitement A et ceux ayant subi le traitement B.  [...] Parce que quantité d'ARN =/= quantité de protéine exprimée. Si c'est par western et que tu as donc bien plus de protéine dans un cas que dans l'autre, l'explication peut éventuellement venir d'un manque de substrat pour la synthèse de la coquille.  [...]

[Biochimie] Fonction des protéines

Dans les autres types d'ARN, on retrouve principalement (en quantité) les ARN ribosomaux qui comme leur nom l'indique composent en partie les ribosomes (tu en parle donc je pense que tu vois a quoi ils servent). On retrouve aussi les ARN de transfert (ARNt) qui sont de petits ARN permettant d'effectuer la correspondance entre les codons présents sur l'ARN messager et les acides aminés qui doivent être incorporés dans la protéine.  [...] Pour résumer, la traduction (ensemble des étapes permettant la production d'une protéine a partir de son ARN messager) fait intervenir les ribosomes (composés d'ARNr et de protéines), les ARN de transfert qui vont chercher les acides aminés en fonction des codons du messager.  [...]

[Biologie Moléculaire] Q-CPCR encore !

Si avec la meme quantité d'ARN pour la RT, je trouve un gène 2 X plus exprimé dans un tissu que dans l'autre, il faut ensuite que je ramène à la quantité d'ARN initial dans le tissu pour avoir une idée réel du niveau d'expression et de la quantité non.  [...] Je comprends ton problème, mais le truc, c'est que tu as moins d'ARN car tu as moins de cellules dans ton tissu, donc moins d'ARN. Or toi ce qui t'intéresse, c'est que savoir à quel niveau d'expression se trouve ton ARN dans une cellule donnée. Donc comparer ce niveau avec le niveau d'un gène stable, ou par défaut à une quantité X d'ARN (par ex la quantité d'ARN utilisé pour faire la RT), te permet de tenir compte de cette dilution des cellules.  [...]

[Génétique] Relation mutation phénotype

Il nous faut dessiner l'ARNm correspondant et la protéine correspondante. Déjà là j'ai un doute sur ce que j'ai mis. Est-ce que c'est.  [...] mutation ponctuelle dans séquence régulatrice 5' -. + ou - d'ARNm donc + ou - de quantité de protéine. La protéine est présente et fonctionnelle. Elle est capable de réagir avec l'anticorps.  [...]

Expression d'un gène

Un gène qui s'exprime très fortement est un gène dont le produit final (ARN ou protéine) est présent en grande quantité. ça veut dire que le gène est fortement transcrit (et dont l'ARN qui en résulte est grandement traduit si c'est un ARNm).  [...] Concrètement, ça veut dire que tu peux avoir, sur un gène donné, de multiples ARN polymérases qui se suivent les unes derrière les autres, pour générer en un temps réduit un grand nombre d'ARN (quel que soit le type d'ARN). A un niveau très très intense, cela peut donner lieu à une structure dite en sapin de Noël (mes excuses pour cette illustration de piètre qualité).  [...]

mesure de l'expression d'un gene

En fait, je crois que la PCR quantitative est plus fine pour quantifier, mais comme le northern, cette technique va m'indiquer la quantité de proteine présente à un temps t, or je veux connaitre le taux de transcription d'un ARN et pas sa concentration.  [...] gloups en effet j'ai tapé un peu vite, pour Run ON et PCR quantitative c'est pour l'ARNm et pas la proteine sorry mais ce que je voulai dire c'est que oui la PCR est plus fine mais c'est une mesure de la quantité globale d'ARN aussi fine soit elle. Le RunON dose l'ARN transcrit pendant un temps t, et comme je veux connaitre mon taux de transcription, c'est plus adapté non.  [...]

CNV: Copy Number Variation

Le nombre de copies d'un gène va influencer la quantité d'ARNm produite et donc la quantité de protéine finale (ou d'ARN si c'est un transcrit non traduit comme pour les miRNA). C'est une relation qui relie l'efficacité en fonction de la dose... Plus tu as de protéine A et plus tu auras d'activité correspondant à l'activité A dans ta cellule.  [...] Ces différences viennent du gène SMN2 qui est présent en quantité variable (0 à 4 exemplaires par locus selon les individus). SMN2 a la même fonction qu'SMN1 et quasiment la même séquence à quelques bases prêt. Seulement ces différences provoquent un exon skipping qui fait que la majorité de l'ARN transcrit sera dégradé avant traduction.  [...]

polymerase adn

Si l adn pol subit un glissement, elle ne va pas dupliquer 2 fois la meme chose sur le meme brin car elle aura change de cadre de lecture. Par exemple certains virus ont une structure de leur genome qui permet le glissement de l arn pol (cas qui arrive a basse frequence) et permet donc apres la traduction d une proteine dont ils ont besoin en peu de quantite.  [...] Lors de la replication du genome, les glissements dus a l adn pol sont repares par des systemes de reparation dans la cellule, mais il peut arriver que ce ne soit pas repare et provoquer des pathologies. syndrome du X fragile, atrophie musculaire spino-bulbaire, ataxie de Friedreich, creutzfeld jacob familiale.   [...]

[Biologie Moléculaire] Problème PCR : Besoin d'aide

Je me joins à LXR pour le conseil d'utiliser SyBR-Green. Il m'est arrivé un truc bizarre quand je travaillais sur le virus de la Dengue et celui de la Vallée du Rift en utilisant d'autres qPCR. j'avais l'impression de détecter des quantités correspondant uniquement au bruit de fond.  [...] soit l'étape de synthèse de l'ADNc déconnait et je me retrouvais avec rien du tout en qPCR, soit la qPCR elle-même crashait pour je ne sais quelle raison... Je crois que ce serait dû à la protéinase K dans certains cas, à la petite quantité d'ARN viraux dans un autre (plutôt la très grosse quantité d'ARN eucaryote gêne...).  [...]

[Microbiologie] l'ARN viral

Ensuite l'ARN polymérase traduite va se servir de l'ARN + comme matrice pour synthétiser de l'ARN - (non reconnu par les ribosomes). Cette ARN - va à son tour servir de matrice pour synthétiser de l'ARN + en grande quantité. Cet ARN + sera encapsidé et on aura donc des virions ARN +.  [...] Pour les ARN - ce cycle sera légèrement différent. L'ARN - n'est pas reconnu par les ribosomes, donc le virus va apporter son ARN polymérase ARN dépendante au moment de l'infection. Le brin d'ARN - servira de matrice pour synthétiser une grande quantité d'ARN +.  [...]