• Forum - Quantité, ADN, Tissus

[Biologie Moléculaire] extraction d'ADN

j'aime bien vous poser une question très précise en ce qui concerne l'extraction de l'ADN a partir des graines de soja. la quantité d'ADN extraite a partir de 100mg de poudre peut elle atteindre 900 ng /ul.  [...] Par contre il y a de grandes chances que l'on vous dise quelle quantité d'ADN vous pouvez espérer obtenir à partir d'une quantité de référence de tissu (ex. 100µg à partir de 100mg de tissus de départ).  [...]

Besoin d'avis pour optimiser extraction d'ADN à partir de tissu FFPE en vue d'une CGH

Dans le cadre de mon stage de Licence, je suis censé, dans un CHU, développer une méthode de CGH sur tissus FFPE (les profils, observés à l'aide du logiciel CytoGénomic, sont ininterprétables). Je dispose donc d'un protocole de base, mais, ayant commencé les manips cette semaine, malgré une extraction ayant conduit à une quantité plus que suffisante d'ADN (déterminée au nanodrop), notre marquage à la cyanine (random priming) à très mal fonctionné sur l'ADN du patient.  [...] J'en déduis donc que, malgré une quantité importante d'ADN, celui-ci est surement très dégradé (en cause, le formol) et qu'il faudrait mesurer sa qualité sur Qubit (merci de confirmer).  [...]

[Biologie Cellulaire] Endoduplication

je viens de lire que la quantité d'ADN peut varier dans une même plante, selon les différents organes, tissus...cela par des mécanismes d'endoduplication. J'aimerais savoir pourquoi les cellules nécessiteraient d'endodupliquer leur génome est-ce possible que cela soit une nécessité d'avoir plus d'ARN, plus de certaines protéines.  [...] L'endoduplication porte aussi le nom d'endoréplication. Cela consiste en une synthèse d'ADN sans mitose, qui a différente fonctions.  [...]

Quantité d'ADN chez différentes espèces animales

Je fais actuellement une recherche sur l'ADN animal. J'aurais une question concernant la différence de quantité d'ADN chez différentes espèces (type boeuf, cheval, porc, etc). Est-ce que la quantité est similaire, ou différente De quoi est-ce qu'elle dépend J'ai cherché des chiffres précis, mais je n'en ai pas trouvé.  [...] Merci beaucoup de cette réponse, je m'en doutais. Par contre, j'ai oublié de le préciser, mais j'ai encore une autre question, concernant la différence de quantité d'ADN au sein des tissus (pour une même masse, j'ai pas la même quantité d'ADN dans du muscle que dans de la graisse)... à quoi est du cette différence.  [...]

[Biochimie] cDNA - regulation des genes

On vient hybrider sur chacun de ces puits, 2 ARNm extraits a partir d'un tissus donnée. Cette hybridation va donner une couleur proportionel a la quantité d'ADN. vert ou rouge veut dire beaucoup ou pas beaucoup. Si on compare les profils d'expression de 3 types cellulaires données, le type cellulaire 1, 2 et 3, on va voir que chacun de ces type cellulaire a son profil d'expression spécifique de la lignée cellulaire donnée.''.  [...] et si ces cDNA son des bouts d'ADN, dans l'expérience ils sont identiques dans les puits et je ne comprends pas non plus le passage des ARNm et quantité d'ADN.  [...]

sexe des oeufs

Super, maintenant, on pourra tous les broyer avec les dents ou les ébouillanter à petits feu ou les laisser agoniser à la poubelle.   [...] Je ne sais pas mais il leur suffit de quantifier cet ADN sur un petit échantillon de tissus déterminé.  [...]

[Biologie Moléculaire] Q-CPCR encore !

Je me pose la question, je souhaite comparer l'expression du gène A dans deux tissus (tissu 1 et tissu 2). Il se trouve qu'après extraction je me retrouve après plusieurs manips et une moyenne, une quantité d'ARN totaux dans le tissu 1 10 fois plus importante que dans l'autre.  [...] Ce qui est important, c'est la quantité d'ARN qui sera présent dans la cellule ou a eu lieu la transcription pour permettre une traduction, donc les tissus environnant, qui font de la masse, ne participe pas à ce phénomène. Il faut donc trouver un moyen de ramener ta valeur à une valeur représentative du nombre de cellules dans ton tissu, et cela tu l'obtiens en regardant le niveau de ton gène dans X µg d'ARN.  [...]

[Biologie Moléculaire] protocole extraction ADN tissus formolés et non inclus en parffine

on me demande pour un cas particulier (nécropsie) dont l'ADN est surement dégradé, de tester une extraction d'ADN sur un tissus fixé au formol 10% et non inclus en paraffine.  [...] Lyse des cellules (là ça va dépendre de ce que tu veux faire de l'ADN par la suite. Si il s'agit de PCR sur des petits fragments, tu peux soniquer, sinon il va falloir privilégier un tampon de lyse assez agressif et une lyse manuelle).  [...]

[Génétique] extraction d'ADN ancient

Bonjour, est ce que vous pourriez m'indiquer une methode pour extraire de l'ADN vieux de 20 a 50 ans conserve dans de l'alcool. une methode qui me permettrait de l'extraire avec relativement beaucoup de succes. ou des articles qui parlent d'extraction d'ADN ancien et probablement abimee.  [...] L'ADN est encore dans les tissus (tentacules de poulpes de différentes espèces). Les tissus sont conservés dans de l'alcool à 70° pour la plus part. peu de mes échantillons sont dans de l'alcool pur.  [...]

[Génétique] meilleur conservateur d'ADN

Je dois conserver des tissus de différentes espèces d'octopodes afin de faire des analyses d'ADN ultérieurement. Et j'aimerais savoir quel est le meilleur conservateur tissulaire afin que l ADN que je veut prélever plus tard ne soit pas abîmé. (Ex alcool, paraffine, -80ºC).  [...] (j 'utilise actuellement des tissus ages de 1 an pour faire des analyses d'ARN, ADN, proteines... et apres confirmation de la qualite, rien n'a bouge...).  [...]